267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4304 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4304  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 340 aa  654    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0937432  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3116  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  50.94 
 
 		 339 aa  276  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4029  2-dehydropantoate 2-reductase  55.37 
 
 		 328 aa  262  6e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2019  ketopantoate reductase ApbA/PanE  45.29 
 
 		 627 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2415  ketopantoate reductase ApbA/PanE-like  45.02 
 
 		 687 aa  209  5e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.427729  normal  0.379727 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5177  Ketopantoate reductase  36.84 
 
 		 333 aa  186  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  32.74 
 
 		 299 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  32.19 
 
 		 301 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0382  2-dehydropantoate 2-reductase  34.15 
 
 		 351 aa  97.4  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  33.75 
 
 		 300 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  33.23 
 
 		 298 aa  89.4  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  29.53 
 
 		 333 aa  89.4  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  33.02 
 
 		 299 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  32.39 
 
 		 326 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  30.24 
 
 		 332 aa  87  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  33.13 
 
 		 295 aa  87  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  32.14 
 
 		 325 aa  86.7  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  32.31 
 
 		 313 aa  85.9  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  33.02 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  27.56 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  32.62 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  28.77 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  31.38 
 
 		 335 aa  83.2  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  30.65 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  26.81 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  28.9 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  29.13 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  31.25 
 
 		 326 aa  82.4  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  33.75 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  34.12 
 
 		 345 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  30.28 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  31.25 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  31.13 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  31.23 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0791  2-dehydropantoate 2-reductase  29.65 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  33.23 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  29.21 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  31.63 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  29.01 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  31.63 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  32.01 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  32.42 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  32.32 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02678  2-dehydropantoate 2-reductase  26.02 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.321227  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1405  2-dehydropantoate 2-reductase  27.8 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1115  2-dehydropantoate 2-reductase  29.32 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.275273  normal  0.917906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  28.1 
 
 		 335 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  30.7 
 
 		 306 aa  75.9  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  29.25 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3892  2-dehydropantoate 2-reductase  32.54 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  31.4 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3118  2-dehydropantoate 2-reductase  28.12 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  31.11 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  28.93 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  29.78 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2967  2-dehydropantoate 2-reductase  32.09 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  31.09 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1688  2-dehydropantoate 2-reductase  29.6 
 
 		 351 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.754321  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  29.97 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  25.71 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  29.45 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  32.11 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.399113 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  28.66 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  28.7 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2936  2-dehydropantoate 2-reductase  27.01 
 
 		 312 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178942 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  30.42 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  27.73 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  32.68 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4530  2-dehydropantoate 2-reductase  30.65 
 
 		 355 aa  67.8  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.247613 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1698  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 		 306 aa  67  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.656315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  29.59 
 
 		 324 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4708  2-dehydropantoate 2-reductase  30.7 
 
 		 289 aa  67  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.392544 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0021  2-dehydropantoate 2-reductase  28.43 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  26.71 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5770  2-dehydropantoate 2-reductase  28.94 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  27.25 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  30.16 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  27.25 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  29.89 
 
 		 327 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3136  2-dehydropantoate 2-reductase  28.15 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4737  2-dehydropantoate 2-reductase  31.12 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2487  2-dehydropantoate 2-reductase  30.88 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  27.44 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  26.92 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0743  ketopantoate reductase ApbA/PanE  30.48 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1519  2-dehydropantoate 2-reductase  25.32 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.982841  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6687  2-dehydropantoate 2-reductase  29.53 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3341  2-dehydropantoate 2-reductase  30.88 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1224  2-dehydropantoate 2-reductase  29.6 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318793 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  29.51 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4552  2-dehydropantoate 2-reductase  32.11 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2289  2-dehydropantoate 2-reductase  29.03 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.974409  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  31.25 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5382  2-dehydropantoate 2-reductase  28.69 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324063  normal  0.227406 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  30.45 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1471  2-dehydropantoate 2-reductase  30.59 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1238  2-dehydropantoate 2-reductase  30.59 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1964  2-dehydropantoate 2-reductase  30.59 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.734659  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  25.86 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0729  2-dehydropantoate 2-reductase  32.45 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.691763  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>