More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2415 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2415  ketopantoate reductase ApbA/PanE-like  100 
 
 		 687 aa  1309    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.427729  normal  0.379727 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2019  ketopantoate reductase ApbA/PanE  69.24 
 
 		 627 aa  816    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2596  Rhodanese domain protein  62.28 
 
 		 282 aa  306  8.000000000000001e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.126951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2635  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  56.25 
 
 		 278 aa  298  3e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.273027  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29210  rhodanese-related sulfurtransferase  60.22 
 
 		 297 aa  293  5e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2381  rhodanese domain-containing protein  58.82 
 
 		 275 aa  292  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0677  Rhodanese domain protein  59.8 
 
 		 299 aa  291  3e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4306  Rhodanese domain protein  59.26 
 
 		 272 aa  287  5e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.913868  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0631  Rhodanese domain protein  53.1 
 
 		 305 aa  286  9e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0797433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1860  Rhodanese domain protein  56.4 
 
 		 282 aa  284  5.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0293763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1631  Rhodanese domain protein  56.91 
 
 		 291 aa  283  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00167409  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7064  thiosulfate sulfurtransferase  58.52 
 
 		 270 aa  282  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4149  Rhodanese domain protein  56.08 
 
 		 283 aa  279  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27500  rhodanese-related sulfurtransferase  53.77 
 
 		 280 aa  277  4e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2370  Rhodanese domain protein  57.93 
 
 		 298 aa  273  8.000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000188451 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3069  Rhodanese domain protein  59.18 
 
 		 277 aa  271  2.9999999999999997e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1466  Rhodanese domain protein  54.58 
 
 		 282 aa  266  7e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0394652  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2918  thiosulfate sulfurtransferase  54.85 
 
 		 276 aa  253  6e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1421  rhodanese domain-containing protein  52.54 
 
 		 288 aa  253  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  decreased coverage  0.00000340615 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07810  rhodanese-related sulfurtransferase  53.09 
 
 		 375 aa  249  1e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1776  Rhodanese domain protein  53.51 
 
 		 301 aa  248  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1460  rhodanese domain-containing protein  51.7 
 
 		 288 aa  243  7.999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.058733  normal  0.145252 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1417  thiosulfate sulfurtransferase  47.44 
 
 		 289 aa  242  1e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1452  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  52.2 
 
 		 282 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5604  Rhodanese domain protein  49.32 
 
 		 287 aa  233  6e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5322  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  50.35 
 
 		 281 aa  233  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.710111 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  48.19 
 
 		 288 aa  226  7e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  47.6 
 
 		 291 aa  219  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06480  rhodanese-related sulfurtransferase  49.28 
 
 		 310 aa  219  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3116  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  43.27 
 
 		 339 aa  219  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4029  2-dehydropantoate 2-reductase  48.24 
 
 		 328 aa  218  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4099  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  49.46 
 
 		 284 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4806  thiosulfate sulfurtransferase  50.17 
 
 		 279 aa  216  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404932  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3367  rhodanese domain-containing protein  48.21 
 
 		 312 aa  214  4.9999999999999996e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4720  thiosulfate sulfurtransferase  51.58 
 
 		 270 aa  213  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.190744  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47500  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.21 
 
 		 284 aa  210  7e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5105  thiosulfate sulfurtransferase  51.75 
 
 		 269 aa  208  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.384708  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2831  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.39 
 
 		 289 aa  207  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0177  Rhodanese domain-containing protein  44.15 
 
 		 278 aa  207  5e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000691288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4550  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  47.87 
 
 		 419 aa  207  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.757162 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12314  thiosulfate sulfurtransferase sseB  45.97 
 
 		 284 aa  207  5e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2620  rhodanese-like protein  43.4 
 
 		 285 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3952  rhodanese domain-containing protein  45.39 
 
 		 290 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6785  Rhodanese domain protein  44.64 
 
 		 289 aa  201  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0412413  hitchhiker  0.0000256266 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1326  Rhodanese domain protein  44.57 
 
 		 283 aa  201  3.9999999999999996e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0377463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2431  Rhodanese domain protein  42.55 
 
 		 295 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1769  rhodanese domain-containing protein  47.29 
 
 		 284 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000405789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2038  Rhodanese domain protein  42.2 
 
 		 295 aa  200  6e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0305  Rhodanese domain protein  40.8 
 
 		 285 aa  200  6e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0952  Rhodanese domain protein  44.32 
 
 		 284 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63885  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4824  rhodanese domain-containing protein  45.92 
 
 		 289 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0196782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3246  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.07 
 
 		 289 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0068458 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2397  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.29 
 
 		 289 aa  198  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0359  rhodanese domain-containing protein  44.29 
 
 		 289 aa  198  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2539  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.29 
 
 		 289 aa  198  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920072  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0325  rhodanese domain-containing protein  44.29 
 
 		 289 aa  198  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4756  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.42 
 
 		 284 aa  198  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0846963 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0847  rhodanese domain-containing protein  44.29 
 
 		 289 aa  198  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1507  rhodanese domain-containing protein  44.29 
 
 		 289 aa  198  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1701  rhodanese domain-containing protein  44.29 
 
 		 289 aa  198  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5177  Ketopantoate reductase  41.14 
 
 		 333 aa  196  9e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32980  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase protein  48.75 
 
 		 284 aa  196  9e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0877  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.93 
 
 		 287 aa  196  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3789  Rhodanese domain protein  45.34 
 
 		 301 aa  196  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0279123  normal  0.459796 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0610  rhodanese domain-containing protein  43.93 
 
 		 289 aa  196  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2636  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.46 
 
 		 292 aa  195  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.488566  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0420  rhodanese-like domain protein  42.86 
 
 		 285 aa  195  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0354  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.48 
 
 		 285 aa  194  5e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2226  thiosulfate sulfurtransferase protein  41.11 
 
 		 296 aa  194  7e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3772  rhodanese domain-containing protein  44.13 
 
 		 289 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0206148 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4490  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.74 
 
 		 289 aa  191  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3875  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.74 
 
 		 289 aa  191  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.403807 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3652  rhodanese domain-containing protein  45.74 
 
 		 289 aa  191  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4992  rhodanese domain-containing protein  44.07 
 
 		 284 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2215  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.55 
 
 		 289 aa  190  9e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2489  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.73 
 
 		 282 aa  189  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4304  2-dehydropantoate 2-reductase  44.84 
 
 		 340 aa  189  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0937432  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5168  rhodanese domain-containing protein  43.54 
 
 		 284 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5343  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.96 
 
 		 284 aa  188  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5118  rhodanese domain protein  43.88 
 
 		 284 aa  187  8e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3212  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.73 
 
 		 299 aa  186  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  44.77 
 
 		 285 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0347  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 		 284 aa  183  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.772652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7246  rhodanese-related sulfurtransferase  41.91 
 
 		 279 aa  180  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0149117  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1496  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.02 
 
 		 300 aa  179  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.14 
 
 		 300 aa  177  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1776  Rhodanese domain protein  45.42 
 
 		 335 aa  177  8e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305984  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0593  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.58 
 
 		 285 aa  176  9e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2427  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.72 
 
 		 280 aa  174  3.9999999999999995e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.244086 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2523  rhodanese-like protein  46.25 
 
 		 266 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2568  rhodanese domain-containing protein  46.25 
 
 		 266 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00777  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.39 
 
 		 290 aa  172  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0224116  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2560  rhodanese domain-containing protein  45.63 
 
 		 266 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1048  Rhodanese domain protein  41.35 
 
 		 281 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2237  rhodanese domain-containing protein  38.41 
 
 		 304 aa  168  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.814145  normal  0.0284823 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2880  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.54 
 
 		 289 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518579  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3485  rhodanese domain-containing protein  36.95 
 
 		 278 aa  167  5e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3055  rhodanese-like protein  39.86 
 
 		 279 aa  167  8e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.403851  normal  0.0127336 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1426  Rhodanese domain protein  35.62 
 
 		 276 aa  165  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.630889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1319  Rhodanese domain protein  41.01 
 
 		 300 aa  165  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.147779  normal  0.429606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>