76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5177 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5177  Ketopantoate reductase  100 
 
 		 333 aa  672    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2019  ketopantoate reductase ApbA/PanE  40.07 
 
 		 627 aa  196  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2415  ketopantoate reductase ApbA/PanE-like  41.46 
 
 		 687 aa  188  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.427729  normal  0.379727 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4029  2-dehydropantoate 2-reductase  39.93 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3116  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  36.28 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4304  2-dehydropantoate 2-reductase  36.84 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0937432  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1115  2-dehydropantoate 2-reductase  25.88 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.275273  normal  0.917906 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  27.06 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  26.32 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  27.39 
 
 		 300 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02678  2-dehydropantoate 2-reductase  26.97 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.321227  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0382  2-dehydropantoate 2-reductase  27.93 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.876847  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0791  2-dehydropantoate 2-reductase  25.95 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  26.01 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  26.97 
 
 		 302 aa  59.3  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  26.69 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4927  2-dehydropantoate 2-reductase  26.67 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332007  normal  0.934837 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  24.76 
 
 		 316 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  24.39 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0383  2-dehydropantoate 2-reductase  27.27 
 
 		 280 aa  55.1  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  24.53 
 
 		 316 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  24.53 
 
 		 316 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  23.97 
 
 		 315 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5770  2-dehydropantoate 2-reductase  28.12 
 
 		 307 aa  52.8  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  25.32 
 
 		 316 aa  52.8  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  25.71 
 
 		 312 aa  52.8  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  23.17 
 
 		 335 aa  52.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3892  2-dehydropantoate 2-reductase  25.67 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1698  2-dehydropantoate 2-reductase  22.26 
 
 		 306 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.656315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2159  2-dehydropantoate 2-reductase  28.52 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  24.76 
 
 		 315 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_003296  RS03188  2-dehydropantoate 2-reductase  24.1 
 
 		 338 aa  51.2  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  23.73 
 
 		 319 aa  50.4  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1719  2-dehydropantoate 2-reductase  29.46 
 
 		 312 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11731  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  21.84 
 
 		 325 aa  50.8  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3888  2-dehydropantoate 2-reductase  26.89 
 
 		 324 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0769062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  25.69 
 
 		 324 aa  49.7  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1519  2-dehydropantoate 2-reductase  21.71 
 
 		 309 aa  49.3  0.00009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.982841  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1867  2-dehydropantoate 2-reductase  26.4 
 
 		 318 aa  49.3  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1790  2-dehydropantoate 2-reductase  28.91 
 
 		 332 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  24.84 
 
 		 319 aa  48.5  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3493  2-dehydropantoate 2-reductase  28.53 
 
 		 336 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.240886  normal  0.0518644 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  26.42 
 
 		 307 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2382  2-dehydropantoate 2-reductase  25.33 
 
 		 314 aa  47.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2991  2-dehydropantoate 2-reductase  27.44 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.1296  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  36.05 
 
 		 323 aa  47.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  24.92 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  26.3 
 
 		 317 aa  46.2  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3234  2-dehydropantoate 2-reductase  34.09 
 
 		 325 aa  46.6  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34380  ketopantoate reductase  27.11 
 
 		 368 aa  46.2  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0495871  normal  0.346815 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  29.73 
 
 		 325 aa  46.2  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1405  2-dehydropantoate 2-reductase  21.82 
 
 		 307 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1677  2-dehydropantoate 2-reductase  28.4 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3780  2-dehydropantoate 2-reductase  27.69 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.146686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  25.71 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4857  2-dehydropantoate 2-reductase  27.69 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57160  2-dehydropantoate 2-reductase  27.55 
 
 		 303 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  26.52 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1558  2-dehydropantoate 2-reductase  32.43 
 
 		 447 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  28.83 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  23.3 
 
 		 306 aa  43.9  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  25.87 
 
 		 294 aa  43.9  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0749  2-dehydropantoate 2-reductase  25.36 
 
 		 340 aa  43.5  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.770799  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4737  2-dehydropantoate 2-reductase  27.96 
 
 		 330 aa  43.9  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1081  2-dehydropantoate 2-reductase  33.93 
 
 		 337 aa  43.9  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.117992  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  25.63 
 
 		 298 aa  43.5  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  24.76 
 
 		 301 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2307  2-dehydropantoate 2-reductase  29.58 
 
 		 319 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198557  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0016  2-dehydropantoate 2-reductase  27.13 
 
 		 307 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2354  2-dehydropantoate 2-reductase  29.58 
 
 		 295 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  24.92 
 
 		 313 aa  43.1  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  24.03 
 
 		 316 aa  43.1  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  26.33 
 
 		 337 aa  43.1  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  27.93 
 
 		 324 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0018  2-dehydropantoate 2-reductase  28.12 
 
 		 306 aa  42.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0462  2-dehydropantoate 2-reductase  30.17 
 
 		 303 aa  42.4  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>