More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7246 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7246  rhodanese-related sulfurtransferase  100 
 
 
279 aa  551  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0149117  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2596  Rhodanese domain protein  43.17 
 
 
282 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.126951  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4306  Rhodanese domain protein  43.01 
 
 
272 aa  190  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.913868  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1460  rhodanese domain-containing protein  41.24 
 
 
288 aa  180  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.058733  normal  0.145252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2019  ketopantoate reductase ApbA/PanE  42.53 
 
 
627 aa  178  9e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07810  rhodanese-related sulfurtransferase  42.35 
 
 
375 aa  174  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2415  ketopantoate reductase ApbA/PanE-like  41.11 
 
 
687 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.427729  normal  0.379727 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27500  rhodanese-related sulfurtransferase  38.32 
 
 
280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2635  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.02 
 
 
278 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.273027  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1421  rhodanese domain-containing protein  41.61 
 
 
288 aa  169  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  decreased coverage  0.00000340615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1466  Rhodanese domain protein  39.19 
 
 
282 aa  168  8e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0394652  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2381  rhodanese domain-containing protein  37.74 
 
 
275 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0631  Rhodanese domain protein  35.02 
 
 
305 aa  167  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0797433  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12314  thiosulfate sulfurtransferase sseB  39.36 
 
 
284 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1860  Rhodanese domain protein  40 
 
 
282 aa  167  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0293763  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29210  rhodanese-related sulfurtransferase  38.91 
 
 
297 aa  166  5e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2918  thiosulfate sulfurtransferase  38.03 
 
 
276 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1452  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.21 
 
 
282 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5322  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.01 
 
 
281 aa  158  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.710111 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3789  Rhodanese domain protein  39.31 
 
 
301 aa  157  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0279123  normal  0.459796 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3069  Rhodanese domain protein  41.18 
 
 
277 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1417  thiosulfate sulfurtransferase  37.73 
 
 
289 aa  156  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1631  Rhodanese domain protein  38.75 
 
 
291 aa  155  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00167409  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1776  Rhodanese domain protein  37.72 
 
 
301 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2370  Rhodanese domain protein  41.29 
 
 
298 aa  154  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000188451 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4806  thiosulfate sulfurtransferase  40.78 
 
 
279 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404932  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7064  thiosulfate sulfurtransferase  37.01 
 
 
270 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5105  thiosulfate sulfurtransferase  40.81 
 
 
269 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.384708  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  36.49 
 
 
288 aa  149  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4720  thiosulfate sulfurtransferase  41.03 
 
 
270 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.190744  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4149  Rhodanese domain protein  37.87 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32980  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase protein  42.32 
 
 
284 aa  145  6e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  37.69 
 
 
291 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4550  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  36.74 
 
 
419 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.757162 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0952  Rhodanese domain protein  38.18 
 
 
284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63885  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06480  rhodanese-related sulfurtransferase  38.55 
 
 
310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47500  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.68 
 
 
284 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1769  rhodanese domain-containing protein  38.65 
 
 
284 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000405789  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5604  Rhodanese domain protein  35.21 
 
 
287 aa  139  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4099  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.11 
 
 
284 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3367  rhodanese domain-containing protein  38.06 
 
 
312 aa  135  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0305  Rhodanese domain protein  35.94 
 
 
285 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3775  rhodanese domain-containing protein  34.55 
 
 
288 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2237  rhodanese domain-containing protein  33.44 
 
 
304 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.814145  normal  0.0284823 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0177  Rhodanese domain-containing protein  34.53 
 
 
278 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000691288  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1113  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.78 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0631  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.09 
 
 
286 aa  133  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  34.22 
 
 
278 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0877  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.47 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0885  thiosulfate sulfurtransferase, rhodanese-like  33.09 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1310  rhodanese domain-containing protein  30.4 
 
 
276 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.965267  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0430  Rhodanese domain protein  33.45 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2544  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.09 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1253  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.33 
 
 
289 aa  129  6e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2925  rhodanese domain-containing protein  34.08 
 
 
283 aa  129  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0593  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.94 
 
 
285 aa  128  8.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0354  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.59 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1095  Rhodanese domain protein  29.48 
 
 
271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2523  rhodanese-like protein  39.05 
 
 
266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2568  rhodanese domain-containing protein  39.05 
 
 
266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5334  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2010  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.45 
 
 
299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0121868  hitchhiker  0.0031153 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5118  rhodanese domain protein  37.5 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3021  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.93 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2989  rhodanese domain-containing protein  34.5 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.700254 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0677  Rhodanese domain protein  36.33 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2560  rhodanese domain-containing protein  39.05 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2620  rhodanese-like protein  37.5 
 
 
285 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2553  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.71 
 
 
289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650161  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5179  Rhodanese domain protein  37.28 
 
 
283 aa  126  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2568  rhodanese domain-containing protein  33.69 
 
 
282 aa  125  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4992  rhodanese domain-containing protein  36.76 
 
 
284 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3017  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.21 
 
 
281 aa  125  7e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.439328  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1745  rhodanese-like domain protein  31.4 
 
 
277 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000561696  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5343  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.26 
 
 
284 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0347  rhodanese domain-containing protein  37.13 
 
 
284 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.772652  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6256  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.28 
 
 
285 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1496  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.32 
 
 
300 aa  124  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2787  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.45 
 
 
284 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0122  rhodanese domain-containing protein  31.6 
 
 
282 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2489  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.26 
 
 
282 aa  124  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1498  rhodanese domain-containing protein  30.36 
 
 
277 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125768  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1333  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.45 
 
 
284 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3061  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.5 
 
 
279 aa  124  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122579  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2866  rhodanese domain-containing protein  30.45 
 
 
284 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0556  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30 
 
 
276 aa  123  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.593662 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0159  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.59 
 
 
292 aa  123  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2395  Rhodanese domain protein  35.09 
 
 
282 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1872  Rhodanese domain protein  32.27 
 
 
274 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.494935  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1705  rhodanese-like domain-containing protein  31.01 
 
 
277 aa  122  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165982  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  34.57 
 
 
477 aa  122  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2791  Rhodanese domain protein  32.97 
 
 
282 aa  122  8e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.798975  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1326  Rhodanese domain protein  35.21 
 
 
283 aa  122  9e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0377463  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0420  rhodanese-like domain protein  35.48 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0454  Rhodanese domain protein  34.34 
 
 
298 aa  121  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  35 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1199  Rhodanese domain protein  34.17 
 
 
279 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000276254  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1048  Rhodanese domain protein  33.46 
 
 
281 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3646  Rhodanese domain protein  31.67 
 
 
276 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2636  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.92 
 
 
292 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.488566  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5168  rhodanese domain-containing protein  36.03 
 
 
284 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>