More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3061 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_3061  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  100 
 
 
279 aa  557  1e-158  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122579  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2553  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  68.21 
 
 
289 aa  398  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650161  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3775  rhodanese domain-containing protein  67.14 
 
 
288 aa  362  5.0000000000000005e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0631  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  53.07 
 
 
286 aa  287  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0146  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  52.73 
 
 
291 aa  280  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.717164  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2989  rhodanese domain-containing protein  52.4 
 
 
281 aa  280  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.700254 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2634  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  50.55 
 
 
283 aa  276  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0030  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  51.32 
 
 
287 aa  273  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.918889 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2925  rhodanese domain-containing protein  51.25 
 
 
283 aa  270  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0122  rhodanese domain-containing protein  50.94 
 
 
282 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0885  thiosulfate sulfurtransferase, rhodanese-like  50.94 
 
 
282 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2544  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  50.94 
 
 
282 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.79 
 
 
285 aa  255  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0430  Rhodanese domain protein  48.01 
 
 
286 aa  255  7e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  47.14 
 
 
286 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6256  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.21 
 
 
285 aa  249  4e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1915  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.86 
 
 
285 aa  248  9e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.021654  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5874  rhodanese domain-containing protein  50.72 
 
 
280 aa  245  6e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2500  Rhodanese domain protein  47.48 
 
 
282 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585045  normal  0.552129 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2916  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.86 
 
 
286 aa  242  5e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6380  Rhodanese domain protein  48.55 
 
 
280 aa  242  6e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2568  rhodanese domain-containing protein  46.76 
 
 
282 aa  241  9e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2791  Rhodanese domain protein  46.76 
 
 
282 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.798975  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0405  rhodanese-like protein  46.52 
 
 
284 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.484971  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3798  rhodanese domain-containing protein  46.57 
 
 
281 aa  239  5e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.0625377 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1615  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.4 
 
 
285 aa  238  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2490  rhodanese-related sulfurtransferase  46.43 
 
 
292 aa  233  3e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36636  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1365  rhodanese domain-containing protein  44.04 
 
 
287 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.247662  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1615  Rhodanese domain protein  45.09 
 
 
289 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2127  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.21 
 
 
285 aa  228  9e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.312853  hitchhiker  0.0057571 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2263  rhodanese domain-containing protein  47.1 
 
 
284 aa  228  9e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.552964  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  42.96 
 
 
477 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1436  Rhodanese domain protein  44.73 
 
 
289 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.506053  normal  0.624415 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3021  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.7 
 
 
289 aa  223  4e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1219  rhodanese domain-containing protein  43.73 
 
 
284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.315032  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1113  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.24 
 
 
284 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1253  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.97 
 
 
289 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.54 
 
 
284 aa  219  5e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4678  rhodanese domain-containing protein  44.36 
 
 
284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0100  rhodanese domain-containing protein  42.12 
 
 
286 aa  209  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.602678  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2673  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.81 
 
 
281 aa  208  8e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121629  normal  0.540659 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02413  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.81 
 
 
281 aa  207  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1147  Rhodanese domain protein  40.81 
 
 
281 aa  207  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2805  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.81 
 
 
281 aa  207  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02375  hypothetical protein  40.81 
 
 
281 aa  207  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1156  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.81 
 
 
281 aa  207  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1432  rhodanese domain-containing protein  41.79 
 
 
281 aa  207  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3750  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.81 
 
 
281 aa  207  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2896  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.44 
 
 
281 aa  205  5e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2672  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.44 
 
 
281 aa  205  5e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1426  rhodanese-like protein  41.61 
 
 
281 aa  205  7e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3017  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.57 
 
 
281 aa  201  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.439328  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2866  rhodanese domain-containing protein  37.82 
 
 
284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2787  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.82 
 
 
284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1333  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.82 
 
 
284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2791  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.39 
 
 
280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2685  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.39 
 
 
280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362659  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2142  rhodanese domain-containing protein  38.63 
 
 
284 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557885  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2728  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.39 
 
 
280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2904  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.39 
 
 
280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.823076  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2772  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.39 
 
 
280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573482  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1055  rhodanese family protein  38.27 
 
 
284 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1020  rhodanese family protein  38.27 
 
 
284 aa  193  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.85738  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3630  rhodanese-like protein  38.71 
 
 
282 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.69295  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2642  rhodanese-like protein  39.93 
 
 
286 aa  190  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1555  mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.22 
 
 
316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5914  thiosulfate sulfurtransferase  40.07 
 
 
283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259229  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_13229  predicted protein  38.68 
 
 
304 aa  181  1e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0193  Rhodanese domain protein  38.35 
 
 
284 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0926264  normal  0.228732 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0854  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.82 
 
 
289 aa  172  5.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06252  thiosulfate sulfurtransferase SseA  33.82 
 
 
276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0562  putative thiosulfate sulfurtransferase SseA  32.72 
 
 
276 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2924  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.63 
 
 
285 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.860252  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1494  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.43 
 
 
276 aa  160  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.732763 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3103  rhodanese domain-containing protein  34.63 
 
 
285 aa  160  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3006  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.28 
 
 
285 aa  159  6e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.148603  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1421  sulfurtransferase (rhodanese-like protein)  32.12 
 
 
276 aa  155  6e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000488  rhodanese-related sulfurtransferase  34.18 
 
 
276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.572454  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1261  mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.52 
 
 
285 aa  152  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3019  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.41 
 
 
277 aa  152  8e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2221  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.97 
 
 
283 aa  151  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.28427  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0968  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.57 
 
 
284 aa  149  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1047  Rhodanese domain protein  34.97 
 
 
289 aa  150  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  35.21 
 
 
288 aa  148  8e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  36.04 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01483  hypothetical protein  34.45 
 
 
255 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2802  thiosulfate sulfurtransferase  36.59 
 
 
290 aa  145  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02073  rhodanese-related sulfurtransferase  36.17 
 
 
276 aa  145  6e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.161687  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  34.72 
 
 
286 aa  144  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  31.21 
 
 
278 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  34.84 
 
 
285 aa  143  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3747  rhodanese-like protein  33.81 
 
 
290 aa  142  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.745396  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1488  rhodanese domain-containing protein  34.86 
 
 
355 aa  142  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305791  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4351  thiosulfate sulfurtransferase  32.63 
 
 
281 aa  142  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  0.607689 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0912  Rhodanese domain protein  39.04 
 
 
305 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4335  rhodanese domain-containing protein  33.45 
 
 
308 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3198  Rhodanese domain protein  31.67 
 
 
285 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.387721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1160  rhodanese domain-containing protein  31.67 
 
 
285 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3937  Thiosulfate sulfurtransferase  33.22 
 
 
279 aa  138  7.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1192  rhodanese domain-containing protein  31.32 
 
 
285 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0358282  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>