More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1199 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1199  Rhodanese domain protein  100 
 
 
279 aa  569  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000276254  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2623  rhodanese domain-containing protein  51.81 
 
 
283 aa  289  4e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3515  thiosulfate sulfurtransferase  47.48 
 
 
278 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.432298  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3673  Rhodanese domain protein  46.24 
 
 
279 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3608  Rhodanese domain protein  45.52 
 
 
279 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0580281  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1496  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.2 
 
 
300 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2636  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.71 
 
 
292 aa  198  9e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.488566  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1566  Rhodanese domain protein  40.14 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.51 
 
 
300 aa  192  6e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0305  Rhodanese domain protein  40.43 
 
 
285 aa  191  9e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  42.4 
 
 
285 aa  191  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2381  rhodanese domain-containing protein  44.09 
 
 
275 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  40.49 
 
 
278 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0951  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.18 
 
 
299 aa  189  5e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3278  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.53 
 
 
330 aa  189  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1033  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.18 
 
 
310 aa  188  9e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0667917 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1319  Rhodanese domain protein  41.7 
 
 
300 aa  187  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.147779  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2010  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.16 
 
 
299 aa  187  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0121868  hitchhiker  0.0031153 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00777  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.7 
 
 
290 aa  186  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0224116  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3367  rhodanese domain-containing protein  41.96 
 
 
312 aa  185  8e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1048  Rhodanese domain protein  42.11 
 
 
281 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2237  rhodanese domain-containing protein  38.64 
 
 
304 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.814145  normal  0.0284823 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2880  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.1 
 
 
289 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518579  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1708  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.86 
 
 
276 aa  181  9.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4824  rhodanese domain-containing protein  43.9 
 
 
289 aa  179  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0196782  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4490  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.56 
 
 
289 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3875  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.56 
 
 
289 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.403807 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3652  rhodanese domain-containing protein  45.56 
 
 
289 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865325  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47500  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.87 
 
 
284 aa  178  9e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2620  rhodanese-like protein  39.52 
 
 
285 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27500  rhodanese-related sulfurtransferase  39.86 
 
 
280 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1326  Rhodanese domain protein  44.13 
 
 
283 aa  177  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0377463  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  43.72 
 
 
288 aa  176  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3246  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.5 
 
 
289 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0068458 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1769  rhodanese domain-containing protein  38.3 
 
 
284 aa  176  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000405789  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3772  rhodanese domain-containing protein  43.8 
 
 
289 aa  175  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0206148 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4099  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.52 
 
 
284 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2489  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.72 
 
 
282 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1426  Rhodanese domain protein  38.21 
 
 
276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.630889  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2215  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.21 
 
 
289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255157  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1779  rhodanese-like protein  37.41 
 
 
272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0268693  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2427  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.35 
 
 
280 aa  172  5.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.244086 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0593  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.59 
 
 
285 aa  171  7.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2918  thiosulfate sulfurtransferase  41.28 
 
 
276 aa  172  7.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0877  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.75 
 
 
287 aa  171  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0347  rhodanese domain-containing protein  37.85 
 
 
284 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.772652  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4756  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.36 
 
 
284 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0846963 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32980  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase protein  38.54 
 
 
284 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1417  thiosulfate sulfurtransferase  40.82 
 
 
289 aa  171  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1239  Rhodanese domain protein  39.86 
 
 
284 aa  171  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.954881  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  41.46 
 
 
291 aa  169  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06480  rhodanese-related sulfurtransferase  41.73 
 
 
310 aa  169  6e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5118  rhodanese domain protein  37.5 
 
 
284 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0325  rhodanese domain-containing protein  39.92 
 
 
289 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0847  rhodanese domain-containing protein  39.92 
 
 
289 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2539  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.92 
 
 
289 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920072  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1860  Rhodanese domain protein  41.75 
 
 
282 aa  168  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0293763  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2397  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.92 
 
 
289 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0359  rhodanese domain-containing protein  39.92 
 
 
289 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1701  rhodanese domain-containing protein  39.92 
 
 
289 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1507  rhodanese domain-containing protein  39.92 
 
 
289 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1455  thiosulfate sulfurtransferase  38.3 
 
 
277 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3952  rhodanese domain-containing protein  42.17 
 
 
290 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3212  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.04 
 
 
299 aa  166  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389078  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1631  Rhodanese domain protein  40.57 
 
 
291 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00167409  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1745  rhodanese-like domain protein  36.65 
 
 
277 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000561696  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2019  ketopantoate reductase ApbA/PanE  40.21 
 
 
627 aa  165  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0420  rhodanese-like domain protein  38.81 
 
 
285 aa  165  9e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1483  rhodanese-like domain-containing protein  37.81 
 
 
277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1599  rhodanese-like domain-containing protein  37.81 
 
 
277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.317702  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0610  rhodanese domain-containing protein  39.92 
 
 
289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1669  rhodanese-like domain protein  37.94 
 
 
277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0354  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.21 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2431  Rhodanese domain protein  38.75 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1776  Rhodanese domain protein  43.08 
 
 
335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305984  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1455  thiosulfate sulfurtransferase  37.46 
 
 
277 aa  163  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2395  Rhodanese domain protein  38.38 
 
 
282 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0631  Rhodanese domain protein  40.14 
 
 
305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0797433  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4992  rhodanese domain-containing protein  36.81 
 
 
284 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6785  Rhodanese domain protein  40.53 
 
 
289 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0412413  hitchhiker  0.0000256266 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2038  Rhodanese domain protein  37.28 
 
 
295 aa  162  6e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3055  rhodanese-like protein  37.86 
 
 
279 aa  162  6e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.403851  normal  0.0127336 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3711  rhodanese-like domain protein  37.46 
 
 
277 aa  162  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.584837  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1705  rhodanese-like domain-containing protein  35.94 
 
 
277 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165982  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1634  rhodanese-like domain protein  37.01 
 
 
277 aa  161  9e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0494002  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1310  rhodanese domain-containing protein  35.69 
 
 
276 aa  161  9e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.965267  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5343  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40 
 
 
284 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5168  rhodanese domain-containing protein  36.46 
 
 
284 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1498  rhodanese domain-containing protein  35.94 
 
 
277 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125768  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0177  Rhodanese domain-containing protein  39.5 
 
 
278 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000691288  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1095  Rhodanese domain protein  39.57 
 
 
271 aa  160  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1466  Rhodanese domain protein  39.44 
 
 
282 aa  159  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0394652  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0159  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.67 
 
 
292 aa  160  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2831  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.77 
 
 
289 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4550  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  39.93 
 
 
419 aa  158  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.757162 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5179  Rhodanese domain protein  39.05 
 
 
283 aa  157  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7064  thiosulfate sulfurtransferase  42.05 
 
 
270 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2596  Rhodanese domain protein  40.86 
 
 
282 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.126951  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2226  thiosulfate sulfurtransferase protein  37.28 
 
 
296 aa  156  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2346  rhodanese domain-containing protein  35.51 
 
 
272 aa  156  4e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>