More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0188 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 285 aa  567  1e-161  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2489  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  57.24 
 
 		 282 aa  321  9.000000000000001e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0593  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  56.38 
 
 		 285 aa  318  5e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3055  rhodanese-like protein  58.21 
 
 		 279 aa  317  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.403851  normal  0.0127336 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0305  Rhodanese domain protein  51.59 
 
 		 285 aa  310  2e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32980  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase protein  55.48 
 
 		 284 aa  293  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47500  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  54.06 
 
 		 284 aa  291  6e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4099  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  54.42 
 
 		 284 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1239  Rhodanese domain protein  55.63 
 
 		 284 aa  288  9e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.954881  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0347  rhodanese domain-containing protein  51.94 
 
 		 284 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.772652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5168  rhodanese domain-containing protein  51.24 
 
 		 284 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4992  rhodanese domain-containing protein  51.24 
 
 		 284 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0877  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  54.34 
 
 		 287 aa  276  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5343  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  50.18 
 
 		 284 aa  275  7e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5118  rhodanese domain protein  50.18 
 
 		 284 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2226  thiosulfate sulfurtransferase protein  54.61 
 
 		 296 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0420  rhodanese-like domain protein  49.65 
 
 		 285 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0764  Rhodanese domain protein  49.12 
 
 		 281 aa  271  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4756  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  49.3 
 
 		 284 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0846963 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1769  rhodanese domain-containing protein  50.53 
 
 		 284 aa  270  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000405789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2620  rhodanese-like protein  51.31 
 
 		 285 aa  268  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2038  Rhodanese domain protein  52.79 
 
 		 295 aa  264  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4824  rhodanese domain-containing protein  52.28 
 
 		 289 aa  263  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0196782  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1326  Rhodanese domain protein  51.79 
 
 		 283 aa  263  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0377463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  50.53 
 
 		 288 aa  263  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2431  Rhodanese domain protein  52.79 
 
 		 295 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0610  rhodanese domain-containing protein  50.88 
 
 		 289 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2010  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  49.5 
 
 		 299 aa  262  6e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0121868  hitchhiker  0.0031153 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0177  Rhodanese domain-containing protein  52.65 
 
 		 278 aa  260  2e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000691288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6785  Rhodanese domain protein  49.82 
 
 		 289 aa  259  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0412413  hitchhiker  0.0000256266 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2831  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  50.53 
 
 		 289 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0325  rhodanese domain-containing protein  50.53 
 
 		 289 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2539  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  50.53 
 
 		 289 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920072  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0847  rhodanese domain-containing protein  50.53 
 
 		 289 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3246  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  50.18 
 
 		 289 aa  257  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0068458 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2397  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  50.53 
 
 		 289 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1701  rhodanese domain-containing protein  50.53 
 
 		 289 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0359  rhodanese domain-containing protein  50.53 
 
 		 289 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1507  rhodanese domain-containing protein  50.53 
 
 		 289 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1566  Rhodanese domain protein  48.84 
 
 		 302 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2237  rhodanese domain-containing protein  49.15 
 
 		 304 aa  253  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.814145  normal  0.0284823 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  48.42 
 
 		 291 aa  252  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3652  rhodanese domain-containing protein  50.88 
 
 		 289 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4490  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  50.88 
 
 		 289 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3875  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  50.88 
 
 		 289 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.403807 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1496  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.99 
 
 		 300 aa  252  5.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3772  rhodanese domain-containing protein  50.18 
 
 		 289 aa  247  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0206148 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2215  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  51.93 
 
 		 289 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.35 
 
 		 300 aa  246  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  46.86 
 
 		 278 aa  246  3e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1708  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.02 
 
 		 276 aa  245  6.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0951  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  49.01 
 
 		 299 aa  244  9e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1033  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  49.01 
 
 		 310 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0667917 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1779  rhodanese-like protein  48.29 
 
 		 272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0268693  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3212  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.6 
 
 		 299 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1319  Rhodanese domain protein  48.99 
 
 		 300 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.147779  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1048  Rhodanese domain protein  50.19 
 
 		 281 aa  242  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0952  Rhodanese domain protein  50.53 
 
 		 284 aa  241  1e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63885  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2636  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  51.58 
 
 		 292 aa  241  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.488566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3952  rhodanese domain-containing protein  47.2 
 
 		 290 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0556  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.72 
 
 		 276 aa  239  2.9999999999999997e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.593662 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2880  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.92 
 
 		 289 aa  239  4e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518579  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1872  Rhodanese domain protein  46.13 
 
 		 274 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.494935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1846  Rhodanese domain protein  46.13 
 
 		 274 aa  238  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1705  rhodanese-like domain-containing protein  41.88 
 
 		 277 aa  237  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1745  rhodanese-like domain protein  41.88 
 
 		 277 aa  236  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000561696  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2346  rhodanese domain-containing protein  47.58 
 
 		 272 aa  236  4e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3646  Rhodanese domain protein  47.41 
 
 		 276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0159  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  50.69 
 
 		 292 aa  233  2.0000000000000002e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3485  rhodanese domain-containing protein  43.57 
 
 		 278 aa  232  5e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2427  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  50.36 
 
 		 280 aa  231  1e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.244086 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3278  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.3 
 
 		 330 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1310  rhodanese domain-containing protein  40.79 
 
 		 276 aa  229  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.965267  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1455  thiosulfate sulfurtransferase  40.79 
 
 		 277 aa  229  4e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1483  rhodanese-like domain-containing protein  40.43 
 
 		 277 aa  229  5e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1455  thiosulfate sulfurtransferase  40.43 
 
 		 277 aa  229  5e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1669  rhodanese-like domain protein  40.43 
 
 		 277 aa  229  5e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1599  rhodanese-like domain-containing protein  40.43 
 
 		 277 aa  229  5e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.317702  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1426  Rhodanese domain protein  45.52 
 
 		 276 aa  229  6e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.630889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3711  rhodanese-like domain protein  41.52 
 
 		 277 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.584837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1634  rhodanese-like domain protein  40.79 
 
 		 277 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0494002  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1498  rhodanese domain-containing protein  40.07 
 
 		 277 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125768  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3367  rhodanese domain-containing protein  48.87 
 
 		 312 aa  225  7e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3515  thiosulfate sulfurtransferase  47.57 
 
 		 278 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.432298  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00777  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.95 
 
 		 290 aa  215  5.9999999999999996e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0224116  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7064  thiosulfate sulfurtransferase  47.14 
 
 		 270 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1776  Rhodanese domain protein  50.18 
 
 		 335 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305984  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5604  Rhodanese domain protein  48.06 
 
 		 287 aa  213  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2381  rhodanese domain-containing protein  49.48 
 
 		 275 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3673  Rhodanese domain protein  46.37 
 
 		 279 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27500  rhodanese-related sulfurtransferase  48.3 
 
 		 280 aa  211  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3608  Rhodanese domain protein  46.1 
 
 		 279 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0580281  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1860  Rhodanese domain protein  48.94 
 
 		 282 aa  206  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0293763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2395  Rhodanese domain protein  43.62 
 
 		 282 aa  205  9e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0354  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1631  Rhodanese domain protein  48.28 
 
 		 291 aa  204  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00167409  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2635  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.76 
 
 		 278 aa  203  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.273027  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1095  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 271 aa  198  7.999999999999999e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2623  rhodanese domain-containing protein  36.4 
 
 		 283 aa  198  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4306  Rhodanese domain protein  47.7 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.913868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>