More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2038 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2038  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 295 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2431  Rhodanese domain protein  97.29 
 
 		 295 aa  595  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2226  thiosulfate sulfurtransferase protein  81.42 
 
 		 296 aa  499  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2620  rhodanese-like protein  65.72 
 
 		 285 aa  386  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0877  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  68.54 
 
 		 287 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2831  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  63.1 
 
 		 289 aa  363  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3952  rhodanese domain-containing protein  62.2 
 
 		 290 aa  359  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6785  Rhodanese domain protein  61.72 
 
 		 289 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0412413  hitchhiker  0.0000256266 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3246  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  60.34 
 
 		 289 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0068458 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4824  rhodanese domain-containing protein  60.34 
 
 		 289 aa  348  9e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0196782  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0325  rhodanese domain-containing protein  59.66 
 
 		 289 aa  346  3e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0847  rhodanese domain-containing protein  59.66 
 
 		 289 aa  346  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0359  rhodanese domain-containing protein  59.66 
 
 		 289 aa  346  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2397  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  59.66 
 
 		 289 aa  346  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1507  rhodanese domain-containing protein  59.66 
 
 		 289 aa  346  3e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1701  rhodanese domain-containing protein  59.66 
 
 		 289 aa  346  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2539  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  59.66 
 
 		 289 aa  346  3e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920072  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0610  rhodanese domain-containing protein  59.31 
 
 		 289 aa  340  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3772  rhodanese domain-containing protein  60.34 
 
 		 289 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0206148 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3652  rhodanese domain-containing protein  60.69 
 
 		 289 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4490  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  60.69 
 
 		 289 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3875  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  60.69 
 
 		 289 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.403807 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2215  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  60.34 
 
 		 289 aa  330  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1239  Rhodanese domain protein  57.79 
 
 		 284 aa  324  1e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.954881  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3212  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  58.65 
 
 		 299 aa  320  9.999999999999999e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1708  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  53.21 
 
 		 276 aa  289  4e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3055  rhodanese-like protein  52.82 
 
 		 279 aa  285  5e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.403851  normal  0.0127336 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2237  rhodanese domain-containing protein  51 
 
 		 304 aa  281  7.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.814145  normal  0.0284823 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2010  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  51.66 
 
 		 299 aa  280  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0121868  hitchhiker  0.0031153 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1426  Rhodanese domain protein  49.82 
 
 		 276 aa  275  6e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.630889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1566  Rhodanese domain protein  49.19 
 
 		 302 aa  275  7e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2636  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  52.9 
 
 		 292 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.488566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2880  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  49.48 
 
 		 289 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518579  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0951  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  49.5 
 
 		 299 aa  267  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2489  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  52.83 
 
 		 282 aa  267  1e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1496  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.87 
 
 		 300 aa  267  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1033  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  49.34 
 
 		 310 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0667917 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  52.79 
 
 		 285 aa  264  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.01 
 
 		 300 aa  263  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4099  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.43 
 
 		 284 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3278  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  49.66 
 
 		 330 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3367  rhodanese domain-containing protein  50.34 
 
 		 312 aa  253  4.0000000000000004e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5343  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.69 
 
 		 284 aa  250  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5168  rhodanese domain-containing protein  48.62 
 
 		 284 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4992  rhodanese domain-containing protein  47.39 
 
 		 284 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1769  rhodanese domain-containing protein  48.96 
 
 		 284 aa  248  9e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000405789  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0420  rhodanese-like domain protein  45.77 
 
 		 285 aa  246  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1319  Rhodanese domain protein  47.47 
 
 		 300 aa  246  3e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.147779  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47500  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.92 
 
 		 284 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0593  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.41 
 
 		 285 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5118  rhodanese domain protein  46.34 
 
 		 284 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32980  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase protein  50.94 
 
 		 284 aa  239  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0177  Rhodanese domain-containing protein  47.81 
 
 		 278 aa  233  3e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000691288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0305  Rhodanese domain protein  45.49 
 
 		 285 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4756  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.6 
 
 		 284 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0846963 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0952  Rhodanese domain protein  45.49 
 
 		 284 aa  231  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63885  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0347  rhodanese domain-containing protein  44.25 
 
 		 284 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.772652  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1326  Rhodanese domain protein  46.01 
 
 		 283 aa  226  5.0000000000000005e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0377463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2427  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.03 
 
 		 280 aa  220  3e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.244086 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00777  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.22 
 
 		 290 aa  218  8.999999999999998e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0224116  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1705  rhodanese-like domain-containing protein  41.79 
 
 		 277 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165982  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0764  Rhodanese domain protein  44.78 
 
 		 281 aa  214  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2381  rhodanese domain-containing protein  44.76 
 
 		 275 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1745  rhodanese-like domain protein  41.79 
 
 		 277 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000561696  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5604  Rhodanese domain protein  44.64 
 
 		 287 aa  213  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1455  thiosulfate sulfurtransferase  40.82 
 
 		 277 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1310  rhodanese domain-containing protein  38.49 
 
 		 276 aa  211  9e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.965267  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1483  rhodanese-like domain-containing protein  40.89 
 
 		 277 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1455  thiosulfate sulfurtransferase  40.89 
 
 		 277 aa  211  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1599  rhodanese-like domain-containing protein  40.89 
 
 		 277 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.317702  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1669  rhodanese-like domain protein  40.89 
 
 		 277 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2918  thiosulfate sulfurtransferase  47.4 
 
 		 276 aa  211  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1860  Rhodanese domain protein  43.6 
 
 		 282 aa  210  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0293763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  42.75 
 
 		 288 aa  209  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1048  Rhodanese domain protein  41.33 
 
 		 281 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3711  rhodanese-like domain protein  40.23 
 
 		 277 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.584837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  39.93 
 
 		 278 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1498  rhodanese domain-containing protein  40.51 
 
 		 277 aa  206  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125768  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3646  Rhodanese domain protein  42.15 
 
 		 276 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27500  rhodanese-related sulfurtransferase  42.86 
 
 		 280 aa  205  8e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 		 291 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1631  Rhodanese domain protein  44.37 
 
 		 291 aa  204  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00167409  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1634  rhodanese-like domain protein  40.45 
 
 		 277 aa  204  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0494002  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2346  rhodanese domain-containing protein  42.64 
 
 		 272 aa  204  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1872  Rhodanese domain protein  41.61 
 
 		 274 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.494935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1779  rhodanese-like protein  40.31 
 
 		 272 aa  203  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0268693  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1846  Rhodanese domain protein  41.24 
 
 		 274 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3485  rhodanese domain-containing protein  41.7 
 
 		 278 aa  201  9e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1776  Rhodanese domain protein  44.61 
 
 		 335 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305984  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06480  rhodanese-related sulfurtransferase  43.36 
 
 		 310 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3789  Rhodanese domain protein  45.32 
 
 		 301 aa  196  5.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0279123  normal  0.459796 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2415  ketopantoate reductase ApbA/PanE-like  42.65 
 
 		 687 aa  195  7e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.427729  normal  0.379727 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0556  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.99 
 
 		 276 aa  195  7e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.593662 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2635  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.33 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.273027  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1417  thiosulfate sulfurtransferase  41.7 
 
 		 289 aa  194  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7064  thiosulfate sulfurtransferase  43.66 
 
 		 270 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2019  ketopantoate reductase ApbA/PanE  43.3 
 
 		 627 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4306  Rhodanese domain protein  44.74 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.913868  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1421  rhodanese domain-containing protein  42.31 
 
 		 288 aa  190  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  decreased coverage  0.00000340615 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07810  rhodanese-related sulfurtransferase  40.07 
 
 		 375 aa  190  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>