More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4550 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4550  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  100 
 
 
419 aa  826    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.757162 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1417  thiosulfate sulfurtransferase  54.21 
 
 
289 aa  273  3e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2381  rhodanese domain-containing protein  56 
 
 
275 aa  271  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1631  Rhodanese domain protein  57.3 
 
 
291 aa  271  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00167409  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7064  thiosulfate sulfurtransferase  55.15 
 
 
270 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27500  rhodanese-related sulfurtransferase  51.45 
 
 
280 aa  263  4e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1860  Rhodanese domain protein  56.43 
 
 
282 aa  258  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0293763  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1421  rhodanese domain-containing protein  54.64 
 
 
288 aa  253  6e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  decreased coverage  0.00000340615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1460  rhodanese domain-containing protein  53.18 
 
 
288 aa  248  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.058733  normal  0.145252 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1466  Rhodanese domain protein  53.73 
 
 
282 aa  242  9e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0394652  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2019  ketopantoate reductase ApbA/PanE  48.75 
 
 
627 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2918  thiosulfate sulfurtransferase  49.82 
 
 
276 aa  225  9e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4306  Rhodanese domain protein  53.85 
 
 
272 aa  219  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.913868  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5604  Rhodanese domain protein  50.19 
 
 
287 aa  216  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3789  Rhodanese domain protein  48.8 
 
 
301 aa  216  7e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0279123  normal  0.459796 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2415  ketopantoate reductase ApbA/PanE-like  47.96 
 
 
687 aa  210  4e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.427729  normal  0.379727 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0177  Rhodanese domain-containing protein  45.36 
 
 
278 aa  206  5e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000691288  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2636  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.22 
 
 
292 aa  206  5e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.488566  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4806  thiosulfate sulfurtransferase  49.64 
 
 
279 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404932  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29210  rhodanese-related sulfurtransferase  48.55 
 
 
297 aa  204  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2596  Rhodanese domain protein  48.19 
 
 
282 aa  203  4e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.126951  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5322  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.96 
 
 
281 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.710111 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1326  Rhodanese domain protein  44.44 
 
 
283 aa  200  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0377463  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1776  Rhodanese domain protein  46.58 
 
 
301 aa  200  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4720  thiosulfate sulfurtransferase  49.63 
 
 
270 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.190744  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0631  Rhodanese domain protein  41.24 
 
 
305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0797433  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5105  thiosulfate sulfurtransferase  50.55 
 
 
269 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.384708  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  44.72 
 
 
285 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0610  rhodanese domain-containing protein  43.88 
 
 
289 aa  195  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4099  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.44 
 
 
284 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0325  rhodanese domain-containing protein  43.93 
 
 
289 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2397  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.93 
 
 
289 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0847  rhodanese domain-containing protein  43.93 
 
 
289 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0359  rhodanese domain-containing protein  43.93 
 
 
289 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1701  rhodanese domain-containing protein  43.93 
 
 
289 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2539  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.93 
 
 
289 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920072  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1507  rhodanese domain-containing protein  43.93 
 
 
289 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47500  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.06 
 
 
284 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2635  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.8 
 
 
278 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.273027  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0593  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.05 
 
 
285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0877  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.94 
 
 
287 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0305  Rhodanese domain protein  40.21 
 
 
285 aa  189  7e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07810  rhodanese-related sulfurtransferase  45.59 
 
 
375 aa  189  8e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1769  rhodanese domain-containing protein  44.06 
 
 
284 aa  189  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000405789  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2038  Rhodanese domain protein  41.4 
 
 
295 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1452  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.95 
 
 
282 aa  187  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4824  rhodanese domain-containing protein  43.88 
 
 
289 aa  186  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0196782  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3246  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.81 
 
 
289 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0068458 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2431  Rhodanese domain protein  41.75 
 
 
295 aa  186  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0677  Rhodanese domain protein  49.43 
 
 
299 aa  186  9e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2427  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.52 
 
 
280 aa  185  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.244086 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2226  thiosulfate sulfurtransferase protein  42.31 
 
 
296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4149  Rhodanese domain protein  46.26 
 
 
283 aa  184  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3069  Rhodanese domain protein  47.67 
 
 
277 aa  183  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12314  thiosulfate sulfurtransferase sseB  42.45 
 
 
284 aa  181  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11880  rhodanese-related sulfurtransferase  46.18 
 
 
307 aa  181  2.9999999999999997e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0631029  normal  0.808545 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32980  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase protein  43.75 
 
 
284 aa  180  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2489  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.79 
 
 
282 aa  180  4e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06480  rhodanese-related sulfurtransferase  45 
 
 
310 aa  180  4e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3652  rhodanese domain-containing protein  45.2 
 
 
289 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865325  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4490  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.2 
 
 
289 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3772  rhodanese domain-containing protein  42.81 
 
 
289 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0206148 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3875  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.2 
 
 
289 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.403807 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  37.55 
 
 
278 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6785  Rhodanese domain protein  42.75 
 
 
289 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0412413  hitchhiker  0.0000256266 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2831  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.64 
 
 
289 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1745  rhodanese-like domain protein  37.5 
 
 
277 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000561696  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1705  rhodanese-like domain-containing protein  37.13 
 
 
277 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165982  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  41.13 
 
 
288 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0952  Rhodanese domain protein  41.3 
 
 
284 aa  177  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63885  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  42.55 
 
 
291 aa  177  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2620  rhodanese-like protein  42.46 
 
 
285 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3952  rhodanese domain-containing protein  41.49 
 
 
290 aa  176  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0764  Rhodanese domain protein  40.21 
 
 
281 aa  176  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1455  thiosulfate sulfurtransferase  36.03 
 
 
277 aa  176  8e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3367  rhodanese domain-containing protein  42.07 
 
 
312 aa  175  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1669  rhodanese-like domain protein  36.4 
 
 
277 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1483  rhodanese-like domain-containing protein  36.4 
 
 
277 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1455  thiosulfate sulfurtransferase  36.4 
 
 
277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2215  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.38 
 
 
289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255157  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1599  rhodanese-like domain-containing protein  36.4 
 
 
277 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.317702  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1779  rhodanese-like protein  38.06 
 
 
272 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0268693  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1310  rhodanese domain-containing protein  35.06 
 
 
276 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.965267  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0420  rhodanese-like domain protein  39.58 
 
 
285 aa  173  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3055  rhodanese-like protein  41.52 
 
 
279 aa  173  5.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.403851  normal  0.0127336 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1708  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.45 
 
 
276 aa  172  6.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1496  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.76 
 
 
300 aa  172  7.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4756  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.98 
 
 
284 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0846963 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39 
 
 
300 aa  172  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1634  rhodanese-like domain protein  36.4 
 
 
277 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0494002  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5343  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.75 
 
 
284 aa  169  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1566  Rhodanese domain protein  39.07 
 
 
302 aa  169  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2010  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.33 
 
 
299 aa  169  6e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0121868  hitchhiker  0.0031153 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1319  Rhodanese domain protein  44.44 
 
 
300 aa  168  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.147779  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1048  Rhodanese domain protein  42.29 
 
 
281 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2880  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.95 
 
 
289 aa  169  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518579  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2237  rhodanese domain-containing protein  40.27 
 
 
304 aa  168  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.814145  normal  0.0284823 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0347  rhodanese domain-containing protein  39.07 
 
 
284 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.772652  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2370  Rhodanese domain protein  45.91 
 
 
298 aa  167  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000188451 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3212  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.54 
 
 
299 aa  167  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389078  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>