More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0677 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0677  Rhodanese domain protein  100 
 
 
299 aa  579  1e-164  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2019  ketopantoate reductase ApbA/PanE  66.91 
 
 
627 aa  323  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2415  ketopantoate reductase ApbA/PanE-like  62.77 
 
 
687 aa  305  6e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.427729  normal  0.379727 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2596  Rhodanese domain protein  64.26 
 
 
282 aa  300  1e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.126951  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29210  rhodanese-related sulfurtransferase  57.89 
 
 
297 aa  287  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2381  rhodanese domain-containing protein  56.79 
 
 
275 aa  275  7e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2635  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  57.58 
 
 
278 aa  274  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.273027  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1631  Rhodanese domain protein  57.04 
 
 
291 aa  270  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00167409  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4306  Rhodanese domain protein  59.39 
 
 
272 aa  270  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.913868  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7064  thiosulfate sulfurtransferase  58.08 
 
 
270 aa  265  5.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3069  Rhodanese domain protein  63.88 
 
 
277 aa  263  4e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0631  Rhodanese domain protein  49.83 
 
 
305 aa  262  4.999999999999999e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0797433  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1860  Rhodanese domain protein  54.98 
 
 
282 aa  259  4e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0293763  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2370  Rhodanese domain protein  60.92 
 
 
298 aa  253  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000188451 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4149  Rhodanese domain protein  55.21 
 
 
283 aa  246  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07810  rhodanese-related sulfurtransferase  48.9 
 
 
375 aa  245  6.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2918  thiosulfate sulfurtransferase  52.26 
 
 
276 aa  245  8e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1417  thiosulfate sulfurtransferase  50.7 
 
 
289 aa  243  3e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5322  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  52.9 
 
 
281 aa  240  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.710111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1466  Rhodanese domain protein  53.14 
 
 
282 aa  236  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0394652  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27500  rhodanese-related sulfurtransferase  49.83 
 
 
280 aa  235  7e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1776  Rhodanese domain protein  50.85 
 
 
301 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1421  rhodanese domain-containing protein  53.1 
 
 
288 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  decreased coverage  0.00000340615 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  48.11 
 
 
288 aa  231  9e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  47.92 
 
 
291 aa  231  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1452  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  52.9 
 
 
282 aa  230  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1460  rhodanese domain-containing protein  53.29 
 
 
288 aa  229  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.058733  normal  0.145252 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4806  thiosulfate sulfurtransferase  54.08 
 
 
279 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404932  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12314  thiosulfate sulfurtransferase sseB  49.49 
 
 
284 aa  224  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5604  Rhodanese domain protein  48.45 
 
 
287 aa  223  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4720  thiosulfate sulfurtransferase  54.85 
 
 
270 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.190744  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06480  rhodanese-related sulfurtransferase  48.51 
 
 
310 aa  210  2e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5105  thiosulfate sulfurtransferase  55.6 
 
 
269 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.384708  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3789  Rhodanese domain protein  47.64 
 
 
301 aa  208  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0279123  normal  0.459796 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0325  rhodanese domain-containing protein  44.81 
 
 
289 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0847  rhodanese domain-containing protein  44.81 
 
 
289 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0359  rhodanese domain-containing protein  44.81 
 
 
289 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2397  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.81 
 
 
289 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1507  rhodanese domain-containing protein  44.81 
 
 
289 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1701  rhodanese domain-containing protein  44.81 
 
 
289 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2539  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.81 
 
 
289 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920072  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6785  Rhodanese domain protein  45.56 
 
 
289 aa  206  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0412413  hitchhiker  0.0000256266 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4099  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.37 
 
 
284 aa  205  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0610  rhodanese domain-containing protein  44.07 
 
 
289 aa  204  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4824  rhodanese domain-containing protein  45.36 
 
 
289 aa  202  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0196782  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3367  rhodanese domain-containing protein  45.12 
 
 
312 aa  202  8e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1769  rhodanese domain-containing protein  45.14 
 
 
284 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000405789  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3246  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.33 
 
 
289 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0068458 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47500  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.02 
 
 
284 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0877  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.91 
 
 
287 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32980  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase protein  48.48 
 
 
284 aa  199  7e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0354  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  50 
 
 
285 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5118  rhodanese domain protein  45.14 
 
 
284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4550  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  49.43 
 
 
419 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.757162 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00777  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.35 
 
 
290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0224116  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0420  rhodanese-like domain protein  43.4 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5168  rhodanese domain-containing protein  46.79 
 
 
284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  46.07 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0347  rhodanese domain-containing protein  44.79 
 
 
284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.772652  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2831  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.1 
 
 
289 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3952  rhodanese domain-containing protein  43.8 
 
 
290 aa  196  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5343  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.6 
 
 
284 aa  195  7e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4992  rhodanese domain-containing protein  44.79 
 
 
284 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0305  Rhodanese domain protein  41.03 
 
 
285 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4756  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.75 
 
 
284 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0846963 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2038  Rhodanese domain protein  42.44 
 
 
295 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2431  Rhodanese domain protein  42.49 
 
 
295 aa  192  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3485  rhodanese domain-containing protein  39.3 
 
 
278 aa  192  6e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1319  Rhodanese domain protein  43.23 
 
 
300 aa  191  9e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.147779  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0952  Rhodanese domain protein  42.01 
 
 
284 aa  191  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63885  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1326  Rhodanese domain protein  45.63 
 
 
283 aa  190  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0377463  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2489  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.84 
 
 
282 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4490  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.02 
 
 
289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3875  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.02 
 
 
289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.403807 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3652  rhodanese domain-containing protein  45.02 
 
 
289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865325  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2226  thiosulfate sulfurtransferase protein  41.06 
 
 
296 aa  189  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0593  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.89 
 
 
285 aa  189  5e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5179  Rhodanese domain protein  48.71 
 
 
283 aa  188  9e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3772  rhodanese domain-containing protein  43.3 
 
 
289 aa  188  9e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0206148 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2215  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.99 
 
 
289 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255157  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2620  rhodanese-like protein  43.9 
 
 
285 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3212  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.91 
 
 
299 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389078  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2523  rhodanese-like protein  49.79 
 
 
266 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2568  rhodanese domain-containing protein  49.79 
 
 
266 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5334  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0177  Rhodanese domain-containing protein  43.94 
 
 
278 aa  181  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000691288  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1496  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.8 
 
 
300 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2636  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.4 
 
 
292 aa  181  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.488566  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2560  rhodanese domain-containing protein  49.16 
 
 
266 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1776  Rhodanese domain protein  45.93 
 
 
335 aa  178  9e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305984  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1095  Rhodanese domain protein  36.02 
 
 
271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1239  Rhodanese domain protein  44.26 
 
 
284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.954881  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1566  Rhodanese domain protein  41.26 
 
 
302 aa  172  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.51 
 
 
300 aa  169  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0764  Rhodanese domain protein  41.6 
 
 
281 aa  167  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2623  rhodanese domain-containing protein  36.9 
 
 
283 aa  166  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3515  thiosulfate sulfurtransferase  45.67 
 
 
278 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.432298  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2237  rhodanese domain-containing protein  38.34 
 
 
304 aa  166  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.814145  normal  0.0284823 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  38.4 
 
 
278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1048  Rhodanese domain protein  42.91 
 
 
281 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2346  rhodanese domain-containing protein  39.92 
 
 
272 aa  162  6e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>