More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3021 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3021  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  100 
 
 		 289 aa  588  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1253  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  92.04 
 
 		 289 aa  543  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  74.25 
 
 		 284 aa  407  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1113  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  71.06 
 
 		 284 aa  395  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3017  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  63.9 
 
 		 281 aa  372  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.439328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2673  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  61.76 
 
 		 281 aa  354  1e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121629  normal  0.540659 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2728  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  62.5 
 
 		 280 aa  352  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2904  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  62.5 
 
 		 280 aa  352  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.823076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2791  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  62.5 
 
 		 280 aa  352  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2685  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  62.5 
 
 		 280 aa  352  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362659  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2772  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  62.5 
 
 		 280 aa  352  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573482  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02413  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  61.03 
 
 		 281 aa  352  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1147  Rhodanese domain protein  61.03 
 
 		 281 aa  352  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02375  hypothetical protein  61.03 
 
 		 281 aa  352  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1156  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  61.03 
 
 		 281 aa  352  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2805  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  61.03 
 
 		 281 aa  352  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3750  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  61.03 
 
 		 281 aa  351  7e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2672  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  60.66 
 
 		 281 aa  349  3e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2896  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  60.29 
 
 		 281 aa  347  1e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2866  rhodanese domain-containing protein  52.38 
 
 		 284 aa  311  5.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1333  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  52.38 
 
 		 284 aa  311  5.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2787  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  52.01 
 
 		 284 aa  310  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1432  rhodanese domain-containing protein  48.01 
 
 		 281 aa  279  4e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1219  rhodanese domain-containing protein  48.38 
 
 		 284 aa  279  5e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.315032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0430  Rhodanese domain protein  48.35 
 
 		 286 aa  277  1e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  47.16 
 
 		 286 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  47.08 
 
 		 477 aa  257  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.18 
 
 		 285 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5874  rhodanese domain-containing protein  49.27 
 
 		 280 aa  256  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6256  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.06 
 
 		 285 aa  254  9e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1915  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.55 
 
 		 285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.021654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2916  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.18 
 
 		 286 aa  252  5.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2127  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.24 
 
 		 285 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.312853  hitchhiker  0.0057571 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1365  rhodanese domain-containing protein  43.01 
 
 		 287 aa  247  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.247662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1615  Rhodanese domain protein  43.68 
 
 		 289 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6380  Rhodanese domain protein  46.38 
 
 		 280 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1436  Rhodanese domain protein  43.68 
 
 		 289 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.506053  normal  0.624415 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2500  Rhodanese domain protein  45.42 
 
 		 282 aa  241  9e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585045  normal  0.552129 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2490  rhodanese-related sulfurtransferase  43.06 
 
 		 292 aa  236  3e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36636  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2142  rhodanese domain-containing protein  42.8 
 
 		 284 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557885  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2568  rhodanese domain-containing protein  43.59 
 
 		 282 aa  235  8e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2634  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.84 
 
 		 283 aa  234  9e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2791  Rhodanese domain protein  43.59 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.798975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3798  rhodanese domain-containing protein  44.94 
 
 		 281 aa  233  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.0625377 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4678  rhodanese domain-containing protein  43.61 
 
 		 284 aa  231  9e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1055  rhodanese family protein  41.7 
 
 		 284 aa  229  5e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1020  rhodanese family protein  41.7 
 
 		 284 aa  228  7e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.85738  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0885  thiosulfate sulfurtransferase, rhodanese-like  44.04 
 
 		 282 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2544  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.04 
 
 		 282 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2925  rhodanese domain-containing protein  40.88 
 
 		 283 aa  223  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3061  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.7 
 
 		 279 aa  223  4e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2989  rhodanese domain-containing protein  41.09 
 
 		 281 aa  222  4.9999999999999996e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.700254 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0122  rhodanese domain-containing protein  43.68 
 
 		 282 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2553  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.3 
 
 		 289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650161  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0631  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.96 
 
 		 286 aa  218  6e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1615  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.29 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3775  rhodanese domain-containing protein  41.97 
 
 		 288 aa  216  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0405  rhodanese-like protein  42.7 
 
 		 284 aa  216  5e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.484971  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0030  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.16 
 
 		 287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.918889 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1426  rhodanese-like protein  40.59 
 
 		 281 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0146  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.05 
 
 		 291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.717164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2263  rhodanese domain-containing protein  40.22 
 
 		 284 aa  211  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.552964  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5914  thiosulfate sulfurtransferase  39.49 
 
 		 283 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2642  rhodanese-like protein  42.03 
 
 		 286 aa  207  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0854  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.27 
 
 		 289 aa  206  4e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1555  mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.78 
 
 		 316 aa  206  5e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0100  rhodanese domain-containing protein  37.59 
 
 		 286 aa  205  8e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.602678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06252  thiosulfate sulfurtransferase SseA  37.68 
 
 		 276 aa  194  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0562  putative thiosulfate sulfurtransferase SseA  37.68 
 
 		 276 aa  188  8e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02073  rhodanese-related sulfurtransferase  36.59 
 
 		 276 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.161687  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3630  rhodanese-like protein  38.27 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.69295  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000488  rhodanese-related sulfurtransferase  36.93 
 
 		 276 aa  183  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.572454  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2221  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.92 
 
 		 283 aa  178  8e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.28427  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1494  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.82 
 
 		 276 aa  176  4e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.732763 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1192  rhodanese domain-containing protein  36.88 
 
 		 285 aa  175  6e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0358282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0193  Rhodanese domain protein  37.59 
 
 		 284 aa  175  7e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0926264  normal  0.228732 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1421  sulfurtransferase (rhodanese-like protein)  35.21 
 
 		 276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  40.21 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3103  rhodanese domain-containing protein  34.74 
 
 		 285 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1160  rhodanese domain-containing protein  36.52 
 
 		 285 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1088  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.46 
 
 		 285 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.73004  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3198  Rhodanese domain protein  35.82 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.387721 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_13229  predicted protein  34.63 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2924  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.51 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.860252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3006  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.19 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.148603  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1261  mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.74 
 
 		 285 aa  168  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0968  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.69 
 
 		 284 aa  160  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  37.77 
 
 		 291 aa  159  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1047  Rhodanese domain protein  36.04 
 
 		 289 aa  158  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3019  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.67 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3747  rhodanese-like protein  34.43 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.745396  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17215  predicted protein  35.89 
 
 		 297 aa  155  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10395  thiosulfate sulfurtransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01370)  36.43 
 
 		 344 aa  153  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0802234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  35.48 
 
 		 278 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5179  Rhodanese domain protein  37.97 
 
 		 283 aa  152  8.999999999999999e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60020  thiosulfate sulfurtransferase  34.15 
 
 		 310 aa  149  4e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.509685  normal  0.0271874 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01483  hypothetical protein  32.76 
 
 		 255 aa  148  8e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1326  Rhodanese domain protein  35.62 
 
 		 283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0377463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27500  rhodanese-related sulfurtransferase  35.34 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2802  thiosulfate sulfurtransferase  31.94 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>