More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000488 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000488  rhodanese-related sulfurtransferase  100 
 
 
276 aa  571  1.0000000000000001e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.572454  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06252  thiosulfate sulfurtransferase SseA  76.81 
 
 
276 aa  453  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0562  putative thiosulfate sulfurtransferase SseA  53.87 
 
 
276 aa  304  1.0000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2221  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.88 
 
 
283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.28427  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1421  sulfurtransferase (rhodanese-like protein)  42.18 
 
 
276 aa  229  4e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0854  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.36 
 
 
289 aa  229  5e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3019  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.03 
 
 
277 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1219  rhodanese domain-containing protein  42.53 
 
 
284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.315032  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6256  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.01 
 
 
285 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3198  Rhodanese domain protein  43.26 
 
 
285 aa  209  6e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.387721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1160  rhodanese domain-containing protein  43.26 
 
 
285 aa  208  8e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1261  mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.16 
 
 
285 aa  207  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1192  rhodanese domain-containing protein  42.91 
 
 
285 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0358282  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2500  Rhodanese domain protein  39.11 
 
 
282 aa  205  5e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585045  normal  0.552129 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.13 
 
 
285 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3103  rhodanese domain-containing protein  40.64 
 
 
285 aa  205  6e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2791  Rhodanese domain protein  38.66 
 
 
282 aa  205  7e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.798975  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2924  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.64 
 
 
285 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.860252  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2568  rhodanese domain-containing protein  38.66 
 
 
282 aa  203  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1088  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.61 
 
 
285 aa  204  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.73004  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3006  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.64 
 
 
285 aa  203  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.148603  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3798  rhodanese domain-containing protein  39.63 
 
 
281 aa  202  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.0625377 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0968  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.29 
 
 
284 aa  202  6e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02073  rhodanese-related sulfurtransferase  41.03 
 
 
276 aa  202  6e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.161687  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1494  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.74 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.732763 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1915  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.77 
 
 
285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.021654  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0430  Rhodanese domain protein  41.42 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01483  hypothetical protein  42.31 
 
 
255 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  37.41 
 
 
286 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2925  rhodanese domain-containing protein  38.77 
 
 
283 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2989  rhodanese domain-containing protein  37.59 
 
 
281 aa  192  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.700254 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0146  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.85 
 
 
291 aa  192  6e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.717164  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5874  rhodanese domain-containing protein  38.06 
 
 
280 aa  191  8e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1436  Rhodanese domain protein  37.09 
 
 
289 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.506053  normal  0.624415 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2490  rhodanese-related sulfurtransferase  40.53 
 
 
292 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36636  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2142  rhodanese domain-containing protein  35.66 
 
 
284 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557885  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2916  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.93 
 
 
286 aa  187  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2634  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.04 
 
 
283 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1615  Rhodanese domain protein  36.23 
 
 
289 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6380  Rhodanese domain protein  37.69 
 
 
280 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02413  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.05 
 
 
281 aa  186  5e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1147  Rhodanese domain protein  37.05 
 
 
281 aa  186  5e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3750  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.05 
 
 
281 aa  186  5e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02375  hypothetical protein  37.05 
 
 
281 aa  186  5e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1156  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.05 
 
 
281 aa  186  5e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2805  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.05 
 
 
281 aa  186  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0405  rhodanese-like protein  39.11 
 
 
284 aa  185  6e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.484971  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2673  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.69 
 
 
281 aa  185  6e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121629  normal  0.540659 
 
 
-
 
NC_004310  BR1055  rhodanese family protein  36.06 
 
 
284 aa  185  7e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2263  rhodanese domain-containing protein  36.69 
 
 
284 aa  185  7e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.552964  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1020  rhodanese family protein  36.06 
 
 
284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.85738  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3017  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.7 
 
 
281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.439328  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4678  rhodanese domain-containing protein  38.15 
 
 
284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1253  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.82 
 
 
289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3021  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.93 
 
 
289 aa  183  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2672  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.69 
 
 
281 aa  183  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1365  rhodanese domain-containing protein  35.64 
 
 
287 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.247662  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2896  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.69 
 
 
281 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1432  rhodanese domain-containing protein  41.41 
 
 
281 aa  181  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0885  thiosulfate sulfurtransferase, rhodanese-like  38.57 
 
 
282 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1615  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.1 
 
 
285 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0030  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.68 
 
 
287 aa  181  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.918889 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2544  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.57 
 
 
282 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2866  rhodanese domain-containing protein  35.64 
 
 
284 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1333  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.64 
 
 
284 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2787  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.64 
 
 
284 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  34.91 
 
 
477 aa  179  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2127  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.51 
 
 
285 aa  178  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.312853  hitchhiker  0.0057571 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0122  rhodanese domain-containing protein  37.14 
 
 
282 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.21 
 
 
284 aa  176  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1426  rhodanese-like protein  35.34 
 
 
281 aa  176  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2685  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.69 
 
 
280 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362659  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1113  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.28 
 
 
284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2791  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.69 
 
 
280 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2728  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.69 
 
 
280 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0631  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.23 
 
 
286 aa  172  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2904  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.69 
 
 
280 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.823076  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2772  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.69 
 
 
280 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573482  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0193  Rhodanese domain protein  35.48 
 
 
284 aa  172  6.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0926264  normal  0.228732 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1555  mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.28 
 
 
316 aa  161  9e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3775  rhodanese domain-containing protein  36.67 
 
 
288 aa  158  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  32.12 
 
 
291 aa  156  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_13229  predicted protein  37.23 
 
 
304 aa  156  4e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0305  Rhodanese domain protein  34.4 
 
 
285 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00777  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.98 
 
 
290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0224116  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3061  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.18 
 
 
279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122579  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5914  thiosulfate sulfurtransferase  34.32 
 
 
283 aa  151  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259229  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2381  rhodanese domain-containing protein  35.25 
 
 
275 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17215  predicted protein  36.52 
 
 
297 aa  149  4e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  33.21 
 
 
285 aa  149  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  30.55 
 
 
288 aa  148  8e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0877  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.09 
 
 
287 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60020  thiosulfate sulfurtransferase  36.47 
 
 
310 aa  144  2e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.509685  normal  0.0271874 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2642  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
286 aa  142  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2038  Rhodanese domain protein  33.8 
 
 
295 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2431  Rhodanese domain protein  33.68 
 
 
295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0100  rhodanese domain-containing protein  33.57 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.602678  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4099  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.05 
 
 
284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2620  rhodanese-like protein  34.52 
 
 
285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32980  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase protein  33.93 
 
 
284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>