More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2924 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2924  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  100 
 
 		 285 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.860252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3006  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  97.54 
 
 		 285 aa  567  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.148603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3103  rhodanese domain-containing protein  96.49 
 
 		 285 aa  566  1e-160  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1261  mercaptopyruvate sulfurtransferase  84.56 
 
 		 285 aa  512  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1160  rhodanese domain-containing protein  75.27 
 
 		 285 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1192  rhodanese domain-containing protein  75.27 
 
 		 285 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0358282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3198  Rhodanese domain protein  74.91 
 
 		 285 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.387721 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1088  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  75.62 
 
 		 285 aa  462  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.73004  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0968  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  62.24 
 
 		 284 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1421  sulfurtransferase (rhodanese-like protein)  51.06 
 
 		 276 aa  293  3e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3019  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  52.82 
 
 		 277 aa  292  5e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0562  putative thiosulfate sulfurtransferase SseA  44.95 
 
 		 276 aa  256  3e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0854  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.99 
 
 		 289 aa  230  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1100  rhodanese domain-containing protein  78.03 
 
 		 152 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2221  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.19 
 
 		 283 aa  224  8e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.28427  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06252  thiosulfate sulfurtransferase SseA  42.76 
 
 		 276 aa  218  8.999999999999998e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1101  rhodanese domain-containing protein  74.05 
 
 		 133 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000488  rhodanese-related sulfurtransferase  40.64 
 
 		 276 aa  204  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.572454  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3798  rhodanese domain-containing protein  39.78 
 
 		 281 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.0625377 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.49 
 
 		 285 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0631  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.35 
 
 		 286 aa  185  7e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1219  rhodanese domain-containing protein  39.02 
 
 		 284 aa  185  7e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.315032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1915  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.8 
 
 		 285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.021654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2673  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.69 
 
 		 281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121629  normal  0.540659 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02413  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.34 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1147  Rhodanese domain protein  35.34 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3750  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.34 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02375  hypothetical protein  35.34 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1156  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.34 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2805  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.34 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2634  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.93 
 
 		 283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6256  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.72 
 
 		 285 aa  182  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0122  rhodanese domain-containing protein  39.72 
 
 		 282 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1055  rhodanese family protein  37.54 
 
 		 284 aa  181  8.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0885  thiosulfate sulfurtransferase, rhodanese-like  40.35 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1020  rhodanese family protein  37.54 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.85738  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2544  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.35 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6380  Rhodanese domain protein  37.89 
 
 		 280 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01483  hypothetical protein  38.46 
 
 		 255 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2672  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.98 
 
 		 281 aa  180  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2142  rhodanese domain-containing protein  37.01 
 
 		 284 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557885  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1365  rhodanese domain-containing protein  37.24 
 
 		 287 aa  179  4.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.247662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2896  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.63 
 
 		 281 aa  179  5.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2925  rhodanese domain-containing protein  38.25 
 
 		 283 aa  178  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  38.11 
 
 		 286 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1432  rhodanese domain-containing protein  36.93 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1253  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.27 
 
 		 289 aa  176  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0146  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.58 
 
 		 291 aa  176  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.717164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0430  Rhodanese domain protein  36.4 
 
 		 286 aa  175  7e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  36.04 
 
 		 477 aa  175  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2989  rhodanese domain-containing protein  36.59 
 
 		 281 aa  175  9e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.700254 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5874  rhodanese domain-containing protein  37.8 
 
 		 280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2263  rhodanese domain-containing protein  35.64 
 
 		 284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.552964  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2791  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.63 
 
 		 280 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2728  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.63 
 
 		 280 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2904  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.63 
 
 		 280 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.823076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1436  Rhodanese domain protein  36.97 
 
 		 289 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.506053  normal  0.624415 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2916  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.86 
 
 		 286 aa  172  5.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2772  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.63 
 
 		 280 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.84 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3021  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.51 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2685  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.63 
 
 		 280 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362659  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1615  Rhodanese domain protein  36.65 
 
 		 289 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3017  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.98 
 
 		 281 aa  170  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.439328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0405  rhodanese-like protein  39.65 
 
 		 284 aa  169  6e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.484971  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2791  Rhodanese domain protein  34.28 
 
 		 282 aa  168  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.798975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2568  rhodanese domain-containing protein  34.63 
 
 		 282 aa  168  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02073  rhodanese-related sulfurtransferase  32.75 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.161687  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1113  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.98 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2866  rhodanese domain-containing protein  35.66 
 
 		 284 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1333  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.66 
 
 		 284 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2787  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.66 
 
 		 284 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2500  Rhodanese domain protein  34.63 
 
 		 282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585045  normal  0.552129 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2127  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.08 
 
 		 285 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.312853  hitchhiker  0.0057571 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1494  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.54 
 
 		 276 aa  165  6.9999999999999995e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.732763 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0030  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.36 
 
 		 287 aa  165  9e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.918889 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4678  rhodanese domain-containing protein  35.51 
 
 		 284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0193  Rhodanese domain protein  37.63 
 
 		 284 aa  162  8.000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0926264  normal  0.228732 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3061  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.63 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2490  rhodanese-related sulfurtransferase  36.68 
 
 		 292 aa  159  4e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36636  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1426  rhodanese-like protein  34.88 
 
 		 281 aa  159  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2553  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.66 
 
 		 289 aa  156  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650161  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1615  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.6 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3775  rhodanese domain-containing protein  35 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1555  mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.84 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2642  rhodanese-like protein  32.76 
 
 		 286 aa  142  7e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0100  rhodanese domain-containing protein  32.99 
 
 		 286 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.602678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_13229  predicted protein  33.22 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03690  thiosulfate sulfurtransferase, putative  36.86 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.376114  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1095  Rhodanese domain protein  37.39 
 
 		 271 aa  132  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1745  rhodanese-like domain protein  29.35 
 
 		 277 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000561696  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00777  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.54 
 
 		 290 aa  132  7.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0224116  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1705  rhodanese-like domain-containing protein  29.35 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165982  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5914  thiosulfate sulfurtransferase  31.38 
 
 		 283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1498  rhodanese domain-containing protein  28.47 
 
 		 277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125768  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1319  Rhodanese domain protein  33.86 
 
 		 300 aa  128  9.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.147779  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1455  thiosulfate sulfurtransferase  28.91 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1455  thiosulfate sulfurtransferase  29.59 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  32.06 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1669  rhodanese-like domain protein  28.91 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>