More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0146 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0146  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  100 
 
 		 291 aa  588  1e-167  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.717164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0885  thiosulfate sulfurtransferase, rhodanese-like  78.21 
 
 		 282 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2544  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  78.21 
 
 		 282 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0030  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  75.97 
 
 		 287 aa  447  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.918889 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2634  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  75 
 
 		 283 aa  442  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0122  rhodanese domain-containing protein  75.71 
 
 		 282 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0631  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  71.79 
 
 		 286 aa  414  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2925  rhodanese domain-containing protein  58.18 
 
 		 283 aa  333  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2989  rhodanese domain-containing protein  56.99 
 
 		 281 aa  319  3e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.700254 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3798  rhodanese domain-containing protein  57.25 
 
 		 281 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.0625377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6380  Rhodanese domain protein  58.7 
 
 		 280 aa  295  5e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5874  rhodanese domain-containing protein  57.61 
 
 		 280 aa  293  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2500  Rhodanese domain protein  56.88 
 
 		 282 aa  289  4e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585045  normal  0.552129 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2568  rhodanese domain-containing protein  56.52 
 
 		 282 aa  288  6e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2791  Rhodanese domain protein  56.52 
 
 		 282 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.798975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1365  rhodanese domain-containing protein  53.02 
 
 		 287 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.247662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3061  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  52.73 
 
 		 279 aa  280  2e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1436  Rhodanese domain protein  49.12 
 
 		 289 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.506053  normal  0.624415 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3775  rhodanese domain-containing protein  52 
 
 		 288 aa  275  7e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1615  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.94 
 
 		 285 aa  270  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1615  Rhodanese domain protein  48.06 
 
 		 289 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6256  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  53.02 
 
 		 285 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  51.09 
 
 		 286 aa  269  4e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  49.3 
 
 		 285 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1426  rhodanese-like protein  49.45 
 
 		 281 aa  265  5e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1219  rhodanese domain-containing protein  49.82 
 
 		 284 aa  265  7e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.315032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1915  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  50.89 
 
 		 285 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.021654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2142  rhodanese domain-containing protein  48 
 
 		 284 aa  263  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557885  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0430  Rhodanese domain protein  48.36 
 
 		 286 aa  263  3e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2916  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  50.88 
 
 		 286 aa  263  3e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2553  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.81 
 
 		 289 aa  261  8.999999999999999e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650161  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1055  rhodanese family protein  47.27 
 
 		 284 aa  260  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1020  rhodanese family protein  47.27 
 
 		 284 aa  259  3e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.85738  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4678  rhodanese domain-containing protein  51.99 
 
 		 284 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2490  rhodanese-related sulfurtransferase  50 
 
 		 292 aa  258  8e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36636  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  45.07 
 
 		 477 aa  256  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2263  rhodanese domain-containing protein  49.28 
 
 		 284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.552964  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0405  rhodanese-like protein  46.57 
 
 		 284 aa  239  4e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.484971  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1113  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.32 
 
 		 284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2127  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.61 
 
 		 285 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.312853  hitchhiker  0.0057571 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1333  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.34 
 
 		 284 aa  223  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2866  rhodanese domain-containing protein  42.34 
 
 		 284 aa  223  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2787  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.34 
 
 		 284 aa  223  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1555  mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.93 
 
 		 316 aa  223  3e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2685  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.22 
 
 		 280 aa  215  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362659  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5914  thiosulfate sulfurtransferase  40.99 
 
 		 283 aa  216  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0854  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.37 
 
 		 289 aa  215  5.9999999999999996e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02413  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.86 
 
 		 281 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1147  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 		 281 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2805  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.86 
 
 		 281 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1156  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.86 
 
 		 281 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2673  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.49 
 
 		 281 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121629  normal  0.540659 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3750  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.86 
 
 		 281 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02375  hypothetical protein  42.86 
 
 		 281 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0100  rhodanese domain-containing protein  41.61 
 
 		 286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.602678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2728  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.86 
 
 		 280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2791  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.86 
 
 		 280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3021  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.05 
 
 		 289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2772  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.86 
 
 		 280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2904  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.86 
 
 		 280 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.823076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2672  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.49 
 
 		 281 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2896  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.49 
 
 		 281 aa  211  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1253  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.22 
 
 		 289 aa  210  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3017  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.49 
 
 		 281 aa  209  4e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.439328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1432  rhodanese domain-containing protein  42.7 
 
 		 281 aa  209  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_13229  predicted protein  41.4 
 
 		 304 aa  208  8e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.33 
 
 		 284 aa  207  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1494  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.16 
 
 		 276 aa  206  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.732763 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0193  Rhodanese domain protein  44.77 
 
 		 284 aa  205  6e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0926264  normal  0.228732 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2642  rhodanese-like protein  41.73 
 
 		 286 aa  205  9e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3630  rhodanese-like protein  40.07 
 
 		 282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.69295  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000488  rhodanese-related sulfurtransferase  39.85 
 
 		 276 aa  192  7e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.572454  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3019  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.07 
 
 		 277 aa  187  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01483  hypothetical protein  41.28 
 
 		 255 aa  186  5e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0968  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.71 
 
 		 284 aa  185  7e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2221  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.64 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.28427  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06252  thiosulfate sulfurtransferase SseA  38.1 
 
 		 276 aa  181  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3006  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.7 
 
 		 285 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.148603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3103  rhodanese domain-containing protein  39.38 
 
 		 285 aa  179  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2924  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.58 
 
 		 285 aa  176  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.860252  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1261  mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.81 
 
 		 285 aa  175  7e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0562  putative thiosulfate sulfurtransferase SseA  36.59 
 
 		 276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1192  rhodanese domain-containing protein  38.6 
 
 		 285 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0358282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1421  sulfurtransferase (rhodanese-like protein)  36.36 
 
 		 276 aa  172  6.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1088  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.52 
 
 		 285 aa  171  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.73004  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1160  rhodanese domain-containing protein  38.6 
 
 		 285 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  40.21 
 
 		 288 aa  168  8e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3198  Rhodanese domain protein  36.9 
 
 		 285 aa  168  9e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.387721 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2802  thiosulfate sulfurtransferase  38.73 
 
 		 290 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02073  rhodanese-related sulfurtransferase  39.44 
 
 		 276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.161687  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3747  rhodanese-like protein  38.35 
 
 		 290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.745396  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  38.01 
 
 		 291 aa  159  7e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2620  rhodanese-like protein  42.34 
 
 		 285 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2489  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.79 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2038  Rhodanese domain protein  39.73 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2431  Rhodanese domain protein  40.07 
 
 		 295 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  36.46 
 
 		 291 aa  155  7e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  35.92 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1047  Rhodanese domain protein  35.56 
 
 		 289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2226  thiosulfate sulfurtransferase protein  40.96 
 
 		 296 aa  152  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>