More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1047 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1047  Rhodanese domain protein  100 
 
 
289 aa  599  1e-170  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28290  rhodanese-related sulfurtransferase  39.02 
 
 
310 aa  186  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0430  Rhodanese domain protein  38.38 
 
 
286 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2916  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.67 
 
 
286 aa  168  9e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5914  thiosulfate sulfurtransferase  36.49 
 
 
283 aa  168  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259229  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7251  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.52 
 
 
292 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0312238  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3017  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.37 
 
 
281 aa  166  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.439328  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0030  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.38 
 
 
287 aa  165  6.9999999999999995e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.918889 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0454  Rhodanese domain protein  39.49 
 
 
298 aa  162  6e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  36.68 
 
 
286 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.17 
 
 
285 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2263  rhodanese domain-containing protein  35.21 
 
 
284 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.552964  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1555  mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.98 
 
 
316 aa  159  5e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6256  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.62 
 
 
285 aa  159  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2802  thiosulfate sulfurtransferase  35.21 
 
 
290 aa  158  9e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1253  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.69 
 
 
289 aa  157  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2490  rhodanese-related sulfurtransferase  36.64 
 
 
292 aa  158  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36636  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2673  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.99 
 
 
281 aa  158  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121629  normal  0.540659 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3021  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.04 
 
 
289 aa  158  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02413  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.99 
 
 
281 aa  156  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1147  Rhodanese domain protein  35.99 
 
 
281 aa  156  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02375  hypothetical protein  35.99 
 
 
281 aa  156  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3775  rhodanese domain-containing protein  36.04 
 
 
288 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1156  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.99 
 
 
281 aa  156  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2805  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.99 
 
 
281 aa  156  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3750  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.99 
 
 
281 aa  156  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2989  rhodanese domain-containing protein  35.69 
 
 
281 aa  155  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.700254 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0405  rhodanese-like protein  35.99 
 
 
284 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.484971  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3630  rhodanese-like protein  34.16 
 
 
282 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.69295  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2672  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.64 
 
 
281 aa  154  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2896  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.64 
 
 
281 aa  153  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1915  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.83 
 
 
285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.021654  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0146  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.56 
 
 
291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.717164  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.88 
 
 
284 aa  151  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3061  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.97 
 
 
279 aa  150  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122579  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0885  thiosulfate sulfurtransferase, rhodanese-like  36.27 
 
 
282 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2544  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.27 
 
 
282 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2728  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.64 
 
 
280 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2791  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.64 
 
 
280 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2634  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.92 
 
 
283 aa  149  5e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2772  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.64 
 
 
280 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573482  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2904  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.64 
 
 
280 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.823076  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2685  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.64 
 
 
280 aa  148  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362659  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0122  rhodanese domain-containing protein  35.21 
 
 
282 aa  148  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1333  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.45 
 
 
284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2866  rhodanese domain-containing protein  33.45 
 
 
284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0100  rhodanese domain-containing protein  33.79 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.602678  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2787  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.1 
 
 
284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2925  rhodanese domain-containing protein  32.99 
 
 
283 aa  146  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1436  Rhodanese domain protein  32.19 
 
 
289 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.506053  normal  0.624415 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0631  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.51 
 
 
286 aa  145  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2127  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.1 
 
 
285 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.312853  hitchhiker  0.0057571 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6380  Rhodanese domain protein  34.86 
 
 
280 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1113  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.35 
 
 
284 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5874  rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 
280 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  32.61 
 
 
291 aa  143  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1365  rhodanese domain-containing protein  33.1 
 
 
287 aa  142  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.247662  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  31.82 
 
 
291 aa  142  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1219  rhodanese domain-containing protein  34.03 
 
 
284 aa  142  7e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.315032  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2500  Rhodanese domain protein  33.1 
 
 
282 aa  142  8e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585045  normal  0.552129 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1426  rhodanese-like protein  33.1 
 
 
281 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3798  rhodanese domain-containing protein  34.07 
 
 
281 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.0625377 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2553  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.22 
 
 
289 aa  141  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650161  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1615  Rhodanese domain protein  31.51 
 
 
289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  31.85 
 
 
477 aa  139  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2791  Rhodanese domain protein  32.75 
 
 
282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.798975  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  32.99 
 
 
285 aa  138  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0854  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.31 
 
 
289 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2568  rhodanese domain-containing protein  32.39 
 
 
282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1432  rhodanese domain-containing protein  34.41 
 
 
281 aa  136  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4678  rhodanese domain-containing protein  33.94 
 
 
284 aa  136  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1615  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.76 
 
 
285 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0193  Rhodanese domain protein  33.45 
 
 
284 aa  133  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0926264  normal  0.228732 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  31.47 
 
 
288 aa  133  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  31.46 
 
 
285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  32.31 
 
 
283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2642  rhodanese-like protein  29.93 
 
 
286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3747  rhodanese-like protein  29.43 
 
 
290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.745396  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1421  sulfurtransferase (rhodanese-like protein)  32.87 
 
 
276 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2142  rhodanese domain-containing protein  29.58 
 
 
284 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557885  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1055  rhodanese family protein  29.58 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  28.32 
 
 
280 aa  126  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0968  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.85 
 
 
284 aa  125  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2221  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.72 
 
 
283 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.28427  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1088  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.9 
 
 
285 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.73004  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2489  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.85 
 
 
282 aa  124  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  28.38 
 
 
288 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  30.23 
 
 
286 aa  123  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1020  rhodanese family protein  29.23 
 
 
284 aa  123  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.85738  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32980  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase protein  32.06 
 
 
284 aa  122  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4099  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.8 
 
 
284 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1631  Rhodanese domain protein  36.84 
 
 
291 aa  122  8e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00167409  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1239  Rhodanese domain protein  32.42 
 
 
284 aa  121  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.954881  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  32.31 
 
 
281 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0593  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.88 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0305  Rhodanese domain protein  30.31 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000488  rhodanese-related sulfurtransferase  30.63 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.572454  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3198  Rhodanese domain protein  30.24 
 
 
285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.387721 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  31.97 
 
 
281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1192  rhodanese domain-containing protein  29.9 
 
 
285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0358282  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>