More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2553 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2553  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  100 
 
 
289 aa  594  1e-169  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650161  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3061  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  68.21 
 
 
279 aa  398  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122579  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3775  rhodanese domain-containing protein  59.07 
 
 
288 aa  344  8e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0631  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  51.99 
 
 
286 aa  283  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2634  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  49.28 
 
 
283 aa  278  8e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0122  rhodanese domain-containing protein  49.44 
 
 
282 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2989  rhodanese domain-containing protein  47.6 
 
 
281 aa  273  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.700254 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0885  thiosulfate sulfurtransferase, rhodanese-like  49.44 
 
 
282 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2544  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  49.44 
 
 
282 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0430  Rhodanese domain protein  46.93 
 
 
286 aa  267  1e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0146  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.81 
 
 
291 aa  261  8.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.717164  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0030  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.46 
 
 
287 aa  259  5.0000000000000005e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.918889 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2925  rhodanese domain-containing protein  47.31 
 
 
283 aa  259  5.0000000000000005e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  45.94 
 
 
286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45 
 
 
285 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2916  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.36 
 
 
286 aa  246  3e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2568  rhodanese domain-containing protein  45.68 
 
 
282 aa  246  4e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2791  Rhodanese domain protein  45.68 
 
 
282 aa  245  6e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.798975  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  43.68 
 
 
477 aa  244  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2500  Rhodanese domain protein  45.68 
 
 
282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585045  normal  0.552129 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3798  rhodanese domain-containing protein  44.93 
 
 
281 aa  243  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.0625377 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0405  rhodanese-like protein  46.15 
 
 
284 aa  242  5e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.484971  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6256  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.71 
 
 
285 aa  241  9e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1915  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.29 
 
 
285 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.021654  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2263  rhodanese domain-containing protein  45.13 
 
 
284 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.552964  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5874  rhodanese domain-containing protein  47.83 
 
 
280 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6380  Rhodanese domain protein  46.74 
 
 
280 aa  236  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2127  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.53 
 
 
285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.312853  hitchhiker  0.0057571 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1365  rhodanese domain-containing protein  42.65 
 
 
287 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.247662  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2490  rhodanese-related sulfurtransferase  44.29 
 
 
292 aa  233  3e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36636  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1436  Rhodanese domain protein  41.7 
 
 
289 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.506053  normal  0.624415 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1615  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.84 
 
 
285 aa  230  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1615  Rhodanese domain protein  40.99 
 
 
289 aa  229  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2142  rhodanese domain-containing protein  44.04 
 
 
284 aa  229  5e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557885  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1219  rhodanese domain-containing protein  43.37 
 
 
284 aa  229  6e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.315032  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1055  rhodanese family protein  44.04 
 
 
284 aa  228  8e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4678  rhodanese domain-containing protein  45.28 
 
 
284 aa  226  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1020  rhodanese family protein  43.68 
 
 
284 aa  224  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.85738  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.65 
 
 
284 aa  223  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3021  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.3 
 
 
289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1113  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.32 
 
 
284 aa  219  6e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1253  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.86 
 
 
289 aa  214  9e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0100  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 
286 aa  212  7e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.602678  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3017  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.17 
 
 
281 aa  211  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.439328  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1426  rhodanese-like protein  40.73 
 
 
281 aa  209  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2673  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.07 
 
 
281 aa  200  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121629  normal  0.540659 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02413  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.71 
 
 
281 aa  199  5e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1147  Rhodanese domain protein  39.71 
 
 
281 aa  199  5e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02375  hypothetical protein  39.71 
 
 
281 aa  199  5e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2805  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.71 
 
 
281 aa  199  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1156  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.71 
 
 
281 aa  199  5e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3750  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.71 
 
 
281 aa  199  5e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2672  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.34 
 
 
281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2896  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.34 
 
 
281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2866  rhodanese domain-containing protein  37.86 
 
 
284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2685  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.03 
 
 
280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362659  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1333  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.86 
 
 
284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2791  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.66 
 
 
280 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2787  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.5 
 
 
284 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2728  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.66 
 
 
280 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2904  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.66 
 
 
280 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.823076  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2772  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.66 
 
 
280 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573482  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_13229  predicted protein  38.73 
 
 
304 aa  194  2e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2642  rhodanese-like protein  38.27 
 
 
286 aa  193  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1432  rhodanese domain-containing protein  38.66 
 
 
281 aa  192  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3630  rhodanese-like protein  38.35 
 
 
282 aa  192  8e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.69295  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0193  Rhodanese domain protein  37.63 
 
 
284 aa  191  8e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0926264  normal  0.228732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5914  thiosulfate sulfurtransferase  37.83 
 
 
283 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259229  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1555  mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.14 
 
 
316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1494  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.2 
 
 
276 aa  167  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.732763 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2221  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.74 
 
 
283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.28427  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  36.79 
 
 
288 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2802  thiosulfate sulfurtransferase  35.19 
 
 
290 aa  158  8e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  36.4 
 
 
291 aa  157  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3747  rhodanese-like protein  34.04 
 
 
290 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.745396  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2924  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.66 
 
 
285 aa  156  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.860252  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1261  mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.52 
 
 
285 aa  155  7e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1421  sulfurtransferase (rhodanese-like protein)  34.66 
 
 
276 aa  155  7e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3103  rhodanese domain-containing protein  35.54 
 
 
285 aa  154  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  35.34 
 
 
278 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0562  putative thiosulfate sulfurtransferase SseA  31.64 
 
 
276 aa  154  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  35.89 
 
 
285 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47500  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.76 
 
 
284 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0854  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.73 
 
 
289 aa  154  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06252  thiosulfate sulfurtransferase SseA  31.65 
 
 
276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3006  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.84 
 
 
285 aa  152  7e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.148603  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4099  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.68 
 
 
284 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01483  hypothetical protein  34.29 
 
 
255 aa  151  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32980  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase protein  38.46 
 
 
284 aa  150  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  33.57 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3019  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.1 
 
 
277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17215  predicted protein  32.85 
 
 
297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4335  rhodanese domain-containing protein  35.97 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0968  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.27 
 
 
284 aa  147  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1496  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.22 
 
 
300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1488  rhodanese domain-containing protein  36.13 
 
 
355 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305791  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2489  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.49 
 
 
282 aa  145  8.000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02073  rhodanese-related sulfurtransferase  35.8 
 
 
276 aa  145  8.000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.161687  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3212  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37 
 
 
299 aa  143  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389078  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0177  Rhodanese domain-containing protein  36.9 
 
 
278 aa  142  5e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000691288  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>