More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1156 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02413  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  100 
 
 
281 aa  569  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1147  Rhodanese domain protein  100 
 
 
281 aa  569  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02375  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  569  1e-161  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2672  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  99.64 
 
 
281 aa  568  1e-161  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3750  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  99.64 
 
 
281 aa  568  1e-161  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1156  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  100 
 
 
281 aa  569  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2805  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  100 
 
 
281 aa  569  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2896  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  99.29 
 
 
281 aa  566  1e-160  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2673  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  98.93 
 
 
281 aa  565  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121629  normal  0.540659 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2772  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  80.36 
 
 
280 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573482  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2791  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  80.65 
 
 
280 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2904  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  80.65 
 
 
280 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.823076  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2728  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  80.65 
 
 
280 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2685  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  80.29 
 
 
280 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362659  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3017  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  74.64 
 
 
281 aa  432  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.439328  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3021  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  61.03 
 
 
289 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1253  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  59.93 
 
 
289 aa  347  2e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1113  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  57.51 
 
 
284 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  55.43 
 
 
284 aa  310  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1333  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  50.54 
 
 
284 aa  297  2e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2866  rhodanese domain-containing protein  50.54 
 
 
284 aa  297  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2787  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  50.18 
 
 
284 aa  295  5e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0430  Rhodanese domain protein  48.74 
 
 
286 aa  276  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1432  rhodanese domain-containing protein  47.5 
 
 
281 aa  266  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1219  rhodanese domain-containing protein  47.29 
 
 
284 aa  256  3e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.315032  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5874  rhodanese domain-containing protein  49.64 
 
 
280 aa  256  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6380  Rhodanese domain protein  48.2 
 
 
280 aa  250  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  45.09 
 
 
477 aa  249  4e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6256  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.62 
 
 
285 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2142  rhodanese domain-containing protein  44.93 
 
 
284 aa  241  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557885  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1055  rhodanese family protein  44.2 
 
 
284 aa  240  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1020  rhodanese family protein  44.2 
 
 
284 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.85738  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2568  rhodanese domain-containing protein  45.52 
 
 
282 aa  238  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3798  rhodanese domain-containing protein  45.59 
 
 
281 aa  237  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.0625377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  46.18 
 
 
286 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2791  Rhodanese domain protein  45.52 
 
 
282 aa  236  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.798975  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2500  Rhodanese domain protein  45.16 
 
 
282 aa  236  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585045  normal  0.552129 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1365  rhodanese domain-containing protein  42.45 
 
 
287 aa  231  7.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.247662  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4678  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 
284 aa  229  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.73 
 
 
285 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2916  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.8 
 
 
286 aa  229  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2989  rhodanese domain-containing protein  42.09 
 
 
281 aa  228  7e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.700254 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1915  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.52 
 
 
285 aa  228  9e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.021654  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0885  thiosulfate sulfurtransferase, rhodanese-like  46.89 
 
 
282 aa  226  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2544  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.89 
 
 
282 aa  226  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2634  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.69 
 
 
283 aa  226  3e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0122  rhodanese domain-containing protein  45.42 
 
 
282 aa  225  7e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1615  Rhodanese domain protein  39.27 
 
 
289 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1436  Rhodanese domain protein  39.27 
 
 
289 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.506053  normal  0.624415 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2127  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.35 
 
 
285 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.312853  hitchhiker  0.0057571 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1555  mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.55 
 
 
316 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0405  rhodanese-like protein  43.32 
 
 
284 aa  219  5e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.484971  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2925  rhodanese domain-containing protein  42.12 
 
 
283 aa  218  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0854  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40 
 
 
289 aa  217  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1615  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.31 
 
 
285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0631  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.61 
 
 
286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0146  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.86 
 
 
291 aa  214  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.717164  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0562  putative thiosulfate sulfurtransferase SseA  41.01 
 
 
276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2490  rhodanese-related sulfurtransferase  42.7 
 
 
292 aa  212  5.999999999999999e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36636  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1426  rhodanese-like protein  40.73 
 
 
281 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0030  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.43 
 
 
287 aa  210  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.918889 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2263  rhodanese domain-containing protein  42.34 
 
 
284 aa  209  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.552964  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3061  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.81 
 
 
279 aa  207  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122579  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2221  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.57 
 
 
283 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.28427  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2553  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.71 
 
 
289 aa  199  5e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650161  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2642  rhodanese-like protein  39.64 
 
 
286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1494  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.43 
 
 
276 aa  198  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.732763 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06252  thiosulfate sulfurtransferase SseA  38.71 
 
 
276 aa  195  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0100  rhodanese domain-containing protein  37.68 
 
 
286 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.602678  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3775  rhodanese domain-containing protein  39.63 
 
 
288 aa  191  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5914  thiosulfate sulfurtransferase  36.56 
 
 
283 aa  189  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259229  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0193  Rhodanese domain protein  41.11 
 
 
284 aa  188  8e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0926264  normal  0.228732 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3103  rhodanese domain-containing protein  36.04 
 
 
285 aa  188  9e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3019  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.23 
 
 
277 aa  186  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000488  rhodanese-related sulfurtransferase  37.05 
 
 
276 aa  186  5e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.572454  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1160  rhodanese domain-containing protein  35.56 
 
 
285 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1192  rhodanese domain-containing protein  35.56 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0358282  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3198  Rhodanese domain protein  35.56 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.387721 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3006  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.79 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.148603  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3630  rhodanese-like protein  40.15 
 
 
282 aa  183  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.69295  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2924  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.34 
 
 
285 aa  183  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.860252  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1088  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.27 
 
 
285 aa  181  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.73004  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0968  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.97 
 
 
284 aa  179  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02073  rhodanese-related sulfurtransferase  35.96 
 
 
276 aa  179  5.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.161687  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1261  mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.56 
 
 
285 aa  178  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_13229  predicted protein  38.6 
 
 
304 aa  177  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1421  sulfurtransferase (rhodanese-like protein)  36.52 
 
 
276 aa  172  6.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  38.18 
 
 
288 aa  169  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10395  thiosulfate sulfurtransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01370)  39.61 
 
 
344 aa  163  4.0000000000000004e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0802234  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1047  Rhodanese domain protein  35.99 
 
 
289 aa  156  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3747  rhodanese-like protein  35.16 
 
 
290 aa  155  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.745396  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01483  hypothetical protein  36.4 
 
 
255 aa  155  8e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  37.09 
 
 
291 aa  154  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60020  thiosulfate sulfurtransferase  37.59 
 
 
310 aa  155  1e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.509685  normal  0.0271874 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  34.89 
 
 
278 aa  148  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17215  predicted protein  34.15 
 
 
297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3646  Rhodanese domain protein  33.58 
 
 
276 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1310  rhodanese domain-containing protein  32.98 
 
 
276 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.965267  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0556  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.61 
 
 
276 aa  141  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.593662 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4335  rhodanese domain-containing protein  32.16 
 
 
308 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>