More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1877 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  100 
 
 		 477 aa  983    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1365  rhodanese domain-containing protein  64.41 
 
 		 287 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.247662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2142  rhodanese domain-containing protein  64.89 
 
 		 284 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557885  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1615  Rhodanese domain protein  63.96 
 
 		 289 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_004310  BR1055  rhodanese family protein  65.6 
 
 		 284 aa  393  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1020  rhodanese family protein  65.6 
 
 		 284 aa  392  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.85738  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1436  Rhodanese domain protein  62.19 
 
 		 289 aa  388  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.506053  normal  0.624415 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1426  rhodanese-like protein  57.86 
 
 		 281 aa  334  3e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0430  Rhodanese domain protein  51.42 
 
 		 286 aa  298  2e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2866  rhodanese domain-containing protein  46.62 
 
 		 284 aa  274  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1333  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.62 
 
 		 284 aa  274  3e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2787  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.62 
 
 		 284 aa  273  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5874  rhodanese domain-containing protein  52.92 
 
 		 280 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1219  rhodanese domain-containing protein  47.31 
 
 		 284 aa  273  5.000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.315032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2925  rhodanese domain-containing protein  50.36 
 
 		 283 aa  273  5.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6256  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  49.28 
 
 		 285 aa  272  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2791  Rhodanese domain protein  49.64 
 
 		 282 aa  272  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.798975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6380  Rhodanese domain protein  51.09 
 
 		 280 aa  272  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2568  rhodanese domain-containing protein  49.64 
 
 		 282 aa  271  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2500  Rhodanese domain protein  49.64 
 
 		 282 aa  270  4e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585045  normal  0.552129 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2989  rhodanese domain-containing protein  48.74 
 
 		 281 aa  270  5e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.700254 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  48.2 
 
 		 286 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2634  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.49 
 
 		 283 aa  263  6e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2544  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.04 
 
 		 282 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0885  thiosulfate sulfurtransferase, rhodanese-like  48.04 
 
 		 282 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1113  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.18 
 
 		 284 aa  262  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2916  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.9 
 
 		 286 aa  261  2e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3798  rhodanese domain-containing protein  48 
 
 		 281 aa  258  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.0625377 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3021  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.08 
 
 		 289 aa  257  4e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0146  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.07 
 
 		 291 aa  256  7e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.717164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0122  rhodanese domain-containing protein  46.62 
 
 		 282 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1253  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.08 
 
 		 289 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.96 
 
 		 285 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4678  rhodanese domain-containing protein  48.86 
 
 		 284 aa  252  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1614  putative acetyltransferase protein  61.96 
 
 		 186 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0508699  normal  0.786708 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2490  rhodanese-related sulfurtransferase  46.4 
 
 		 292 aa  250  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36636  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2673  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.09 
 
 		 281 aa  251  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121629  normal  0.540659 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3750  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.09 
 
 		 281 aa  249  7e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02413  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.09 
 
 		 281 aa  249  9e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1147  Rhodanese domain protein  45.09 
 
 		 281 aa  249  9e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1156  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.09 
 
 		 281 aa  249  9e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2805  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.09 
 
 		 281 aa  249  9e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02375  hypothetical protein  45.09 
 
 		 281 aa  249  9e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2672  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.73 
 
 		 281 aa  247  4e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2896  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.73 
 
 		 281 aa  246  6e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1435  putative acetyltransferase protein  60.87 
 
 		 186 aa  246  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3017  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.68 
 
 		 281 aa  246  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.439328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1915  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.24 
 
 		 285 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.021654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2553  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.68 
 
 		 289 aa  244  3e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650161  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1366  GCN5-related N-acetyltransferase  61.67 
 
 		 187 aa  242  9e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.49 
 
 		 284 aa  242  9e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1432  rhodanese domain-containing protein  45.39 
 
 		 281 aa  242  9e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0631  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.46 
 
 		 286 aa  240  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2791  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.59 
 
 		 280 aa  236  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2728  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.59 
 
 		 280 aa  236  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1555  mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.29 
 
 		 316 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2685  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.59 
 
 		 280 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362659  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2904  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.59 
 
 		 280 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.823076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2772  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.59 
 
 		 280 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0405  rhodanese-like protein  42.7 
 
 		 284 aa  234  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.484971  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0030  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.21 
 
 		 287 aa  232  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.918889 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2263  rhodanese domain-containing protein  47.46 
 
 		 284 aa  232  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.552964  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1615  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.7 
 
 		 285 aa  231  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3061  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.96 
 
 		 279 aa  228  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0854  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.82 
 
 		 289 aa  228  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3775  rhodanese domain-containing protein  42.2 
 
 		 288 aa  225  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2127  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.67 
 
 		 285 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.312853  hitchhiker  0.0057571 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0100  rhodanese domain-containing protein  43.22 
 
 		 286 aa  216  5.9999999999999996e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.602678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5914  thiosulfate sulfurtransferase  41.84 
 
 		 283 aa  216  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0193  Rhodanese domain protein  41.67 
 
 		 284 aa  204  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0926264  normal  0.228732 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0562  putative thiosulfate sulfurtransferase SseA  37 
 
 		 276 aa  199  9e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2642  rhodanese-like protein  39.43 
 
 		 286 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06252  thiosulfate sulfurtransferase SseA  36.73 
 
 		 276 aa  192  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02073  rhodanese-related sulfurtransferase  42.55 
 
 		 276 aa  192  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.161687  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1494  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.01 
 
 		 276 aa  191  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.732763 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_13229  predicted protein  39.64 
 
 		 304 aa  187  5e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2221  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.65 
 
 		 283 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.28427  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1261  mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.65 
 
 		 285 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000488  rhodanese-related sulfurtransferase  34.91 
 
 		 276 aa  179  7e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.572454  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3103  rhodanese domain-containing protein  36.27 
 
 		 285 aa  176  7e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2924  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.04 
 
 		 285 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.860252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0968  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.59 
 
 		 284 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3006  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.21 
 
 		 285 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.148603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1421  sulfurtransferase (rhodanese-like protein)  35.04 
 
 		 276 aa  171  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01483  hypothetical protein  38.4 
 
 		 255 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1088  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.4 
 
 		 285 aa  170  5e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.73004  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3198  Rhodanese domain protein  35.44 
 
 		 285 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.387721 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1192  rhodanese domain-containing protein  34.4 
 
 		 285 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0358282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1160  rhodanese domain-containing protein  34.75 
 
 		 285 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1021  acetyltransferase  50.9 
 
 		 173 aa  168  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.179395  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3747  rhodanese-like protein  36.55 
 
 		 290 aa  168  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.745396  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3019  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.66 
 
 		 277 aa  168  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1056  acetyltransferase  50.3 
 
 		 173 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3630  rhodanese-like protein  33.94 
 
 		 282 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.69295  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1427  GCN5-related N-acetyltransferase  47.75 
 
 		 191 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2143  GCN5-related N-acetyltransferase  48.5 
 
 		 173 aa  162  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.827643  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  37.01 
 
 		 288 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.183819 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10395  thiosulfate sulfurtransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01370)  38.58 
 
 		 344 aa  160  5e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0802234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  38.2 
 
 		 291 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17215  predicted protein  34.16 
 
 		 297 aa  152  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>