36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1366 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1366  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 187 aa  384  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1614  putative acetyltransferase protein  63.89 
 
 		 186 aa  264  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0508699  normal  0.786708 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1435  putative acetyltransferase protein  62.78 
 
 		 186 aa  256  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  61.67 
 
 		 477 aa  242  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1427  GCN5-related N-acetyltransferase  48 
 
 		 191 aa  162  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1021  acetyltransferase  45.83 
 
 		 173 aa  157  8e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.179395  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1056  acetyltransferase  45.24 
 
 		 173 aa  155  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2143  GCN5-related N-acetyltransferase  42.51 
 
 		 173 aa  148  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.827643  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2988  GCN5-related N-acetyltransferase  38.22 
 
 		 172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.885762  normal  0.907931 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1600  GCN5-related N-acetyltransferase  38.82 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.35561  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7066  hypothetical protein  36.48 
 
 		 197 aa  99.8  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3037  GCN5-related N-acetyltransferase  39.38 
 
 		 196 aa  99.8  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.191152 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0029  GCN5-related N-acetyltransferase  37.87 
 
 		 186 aa  95.9  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.908503 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2535  GCN5-related N-acetyltransferase  37.13 
 
 		 208 aa  94.4  8e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.911959  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3949  GCN5-related N-acetyltransferase  35.98 
 
 		 193 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0114107  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3543  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 197 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0684165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3680  GCN5-related N-acetyltransferase  39.86 
 
 		 175 aa  86.3  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135055  normal  0.0207882 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0863  GCN5-related N-acetyltransferase  39.61 
 
 		 199 aa  84.7  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0282724  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4026  GCN5-related N-acetyltransferase  37.86 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3533  GCN5-related N-acetyltransferase  31.08 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00867976 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2540  acetyltransferase  34.48 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11282  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7078  histone acetyltransferase HPA2-like acetyltransferase  33.55 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2656  GCN5-related N-acetyltransferase  31.97 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.312645  hitchhiker  0.00701873 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1399  GCN5-related N-acetyltransferase  34.71 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  0.145547 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1743  hypothetical protein  34.16 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.543402  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2386  GCN5-related N-acetyltransferase  30.32 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.162404  normal  0.592718 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0932  GCN5-related N-acetyltransferase  32.68 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0604455  normal  0.0176306 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4582  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0968  GCN5-related N-acetyltransferase  36 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3619  GCN5-related N-acetyltransferase  34.11 
 
 		 198 aa  62  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145227  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0167  GCN5-related N-acetyltransferase  33.91 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000022315  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3029  GCN5-related N-acetyltransferase  30.32 
 
 		 297 aa  52.4  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4103  GCN5-related N-acetyltransferase  30.53 
 
 		 291 aa  43.9  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.131748 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3260  acetyltransferase  35.71 
 
 		 168 aa  42.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0647  GCN5-related N-acetyltransferase  25.27 
 
 		 148 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1445  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.95 
 
 		 157 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>