46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4026 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4026  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
178 aa  367  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3680  GCN5-related N-acetyltransferase  89.51 
 
 
175 aa  306  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135055  normal  0.0207882 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2656  GCN5-related N-acetyltransferase  42.17 
 
 
181 aa  141  5e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.312645  hitchhiker  0.00701873 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2386  GCN5-related N-acetyltransferase  49.38 
 
 
191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.162404  normal  0.592718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7078  histone acetyltransferase HPA2-like acetyltransferase  46.15 
 
 
201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1600  GCN5-related N-acetyltransferase  43.95 
 
 
171 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.35561  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2540  acetyltransferase  43.21 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11282  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0167  GCN5-related N-acetyltransferase  42.26 
 
 
184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000022315  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3533  GCN5-related N-acetyltransferase  43.48 
 
 
162 aa  114  6.9999999999999995e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00867976 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4582  GCN5-related N-acetyltransferase  43.4 
 
 
170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1427  GCN5-related N-acetyltransferase  44.53 
 
 
191 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  40.71 
 
 
477 aa  98.2  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2143  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
173 aa  95.9  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.827643  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1021  acetyltransferase  37.5 
 
 
173 aa  95.9  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.179395  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1056  acetyltransferase  36.72 
 
 
173 aa  94  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3949  GCN5-related N-acetyltransferase  35.12 
 
 
193 aa  92  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0114107  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0863  GCN5-related N-acetyltransferase  37.65 
 
 
199 aa  89  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0282724  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1614  putative acetyltransferase protein  40.3 
 
 
186 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0508699  normal  0.786708 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1435  putative acetyltransferase protein  40.6 
 
 
186 aa  85.1  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2535  GCN5-related N-acetyltransferase  39.23 
 
 
208 aa  85.1  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.911959  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0932  GCN5-related N-acetyltransferase  33.94 
 
 
203 aa  84.7  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0604455  normal  0.0176306 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2988  GCN5-related N-acetyltransferase  39.17 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.885762  normal  0.907931 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1366  GCN5-related N-acetyltransferase  37.86 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560531  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3619  GCN5-related N-acetyltransferase  38.64 
 
 
198 aa  77.8  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145227  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0029  GCN5-related N-acetyltransferase  32.56 
 
 
186 aa  77.8  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.908503 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1399  GCN5-related N-acetyltransferase  33.59 
 
 
201 aa  77.8  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  0.145547 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3037  GCN5-related N-acetyltransferase  35.46 
 
 
196 aa  77  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.191152 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7066  hypothetical protein  32.64 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300924  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3543  GCN5-related N-acetyltransferase  29.78 
 
 
197 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0684165  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0968  GCN5-related N-acetyltransferase  33.83 
 
 
206 aa  62  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1743  hypothetical protein  31.52 
 
 
200 aa  61.6  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.543402  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2568  GCN5-related N-acetyltransferase  36.46 
 
 
289 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.372205  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3029  GCN5-related N-acetyltransferase  38.78 
 
 
297 aa  59.7  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0481  GCN5-related N-acetyltransferase  34.57 
 
 
287 aa  55.5  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2952  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 1  28.03 
 
 
172 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.538845  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3252  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 1  27.69 
 
 
172 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3282  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 1  27.69 
 
 
172 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0460  putative acetyltransferase  37.14 
 
 
157 aa  47  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3275  acetyltransferase  26.92 
 
 
172 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266027  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3031  sporulation transcriptional regulator  27.03 
 
 
144 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417018  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1998  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 1  29.7 
 
 
172 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1840  GCN5-related N-acetyltransferase  25.93 
 
 
369 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.422252  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3645  GCN5-related N-acetyltransferase  26.19 
 
 
174 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3731  GCN5-related N-acetyltransferase  26.77 
 
 
172 aa  42  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1503  GCN5-related N-acetyltransferase  28.3 
 
 
170 aa  42  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.528782 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0210  GCN5-related N-acetyltransferase  23.74 
 
 
156 aa  41.6  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>