33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1399 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1399  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
201 aa  404  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  0.145547 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2535  GCN5-related N-acetyltransferase  56.15 
 
 
208 aa  209  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.911959  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3949  GCN5-related N-acetyltransferase  57.59 
 
 
193 aa  202  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0114107  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3543  GCN5-related N-acetyltransferase  47.89 
 
 
197 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0684165  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1743  hypothetical protein  50.26 
 
 
200 aa  174  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.543402  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3619  GCN5-related N-acetyltransferase  55.5 
 
 
198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145227  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0932  GCN5-related N-acetyltransferase  45.36 
 
 
203 aa  170  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0604455  normal  0.0176306 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7066  hypothetical protein  48.15 
 
 
197 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300924  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0968  GCN5-related N-acetyltransferase  56.84 
 
 
206 aa  167  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0029  GCN5-related N-acetyltransferase  38.92 
 
 
186 aa  104  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.908503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2988  GCN5-related N-acetyltransferase  41.14 
 
 
172 aa  104  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.885762  normal  0.907931 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  36.36 
 
 
477 aa  99  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3037  GCN5-related N-acetyltransferase  34.44 
 
 
196 aa  94.7  7e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.191152 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0863  GCN5-related N-acetyltransferase  37.29 
 
 
199 aa  94.7  9e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0282724  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1427  GCN5-related N-acetyltransferase  32.93 
 
 
191 aa  92.8  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2540  acetyltransferase  36.8 
 
 
165 aa  91.7  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11282  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2143  GCN5-related N-acetyltransferase  36.13 
 
 
173 aa  90.9  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.827643  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1021  acetyltransferase  34.36 
 
 
173 aa  87.4  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.179395  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1600  GCN5-related N-acetyltransferase  29.59 
 
 
171 aa  87  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.35561  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3680  GCN5-related N-acetyltransferase  36.64 
 
 
175 aa  86.7  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135055  normal  0.0207882 
 
 
-
 
NC_004310  BR1056  acetyltransferase  33.74 
 
 
173 aa  85.5  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1614  putative acetyltransferase protein  34.19 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0508699  normal  0.786708 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4026  GCN5-related N-acetyltransferase  31.36 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1435  putative acetyltransferase protein  33.55 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3533  GCN5-related N-acetyltransferase  34.19 
 
 
162 aa  78.2  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00867976 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2656  GCN5-related N-acetyltransferase  25.44 
 
 
181 aa  78.6  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.312645  hitchhiker  0.00701873 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2386  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
191 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.162404  normal  0.592718 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1366  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560531  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0167  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000022315  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4582  GCN5-related N-acetyltransferase  29.3 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7078  histone acetyltransferase HPA2-like acetyltransferase  33.87 
 
 
201 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2770  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 
136 aa  42.4  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5047  GCN5-related N-acetyltransferase  30.95 
 
 
175 aa  42  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.608856  normal  0.868904 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>