33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2540 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2540  acetyltransferase  100 
 
 		 165 aa  345  1e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11282  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1600  GCN5-related N-acetyltransferase  58.9 
 
 		 171 aa  214  4e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.35561  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3533  GCN5-related N-acetyltransferase  60 
 
 		 162 aa  209  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00867976 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4582  GCN5-related N-acetyltransferase  48.73 
 
 		 170 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2656  GCN5-related N-acetyltransferase  47.85 
 
 		 181 aa  157  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.312645  hitchhiker  0.00701873 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2386  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 		 191 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.162404  normal  0.592718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7078  histone acetyltransferase HPA2-like acetyltransferase  45.61 
 
 		 201 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0167  GCN5-related N-acetyltransferase  44.44 
 
 		 184 aa  122  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000022315  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4026  GCN5-related N-acetyltransferase  43.21 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3680  GCN5-related N-acetyltransferase  43.67 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135055  normal  0.0207882 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1427  GCN5-related N-acetyltransferase  34.16 
 
 		 191 aa  98.2  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0863  GCN5-related N-acetyltransferase  33.54 
 
 		 199 aa  93.2  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0282724  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3949  GCN5-related N-acetyltransferase  30.82 
 
 		 193 aa  92  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0114107  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1399  GCN5-related N-acetyltransferase  36.8 
 
 		 201 aa  91.7  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  0.145547 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3619  GCN5-related N-acetyltransferase  37.9 
 
 		 198 aa  90.9  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145227  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2535  GCN5-related N-acetyltransferase  34.15 
 
 		 208 aa  90.5  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.911959  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0029  GCN5-related N-acetyltransferase  29.38 
 
 		 186 aa  87.4  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.908503 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3543  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 		 197 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0684165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  43.1 
 
 		 477 aa  85.5  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1021  acetyltransferase  34.15 
 
 		 173 aa  84.3  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.179395  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7066  hypothetical protein  31.39 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2988  GCN5-related N-acetyltransferase  38.58 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.885762  normal  0.907931 
 
 
-
 
NC_004310  BR1056  acetyltransferase  33.54 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1743  hypothetical protein  28.3 
 
 		 200 aa  77.4  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.543402  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3037  GCN5-related N-acetyltransferase  29.3 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.191152 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1435  putative acetyltransferase protein  37.29 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1614  putative acetyltransferase protein  38.14 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0508699  normal  0.786708 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1366  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2143  GCN5-related N-acetyltransferase  30.92 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.827643  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0932  GCN5-related N-acetyltransferase  30.19 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0604455  normal  0.0176306 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0968  GCN5-related N-acetyltransferase  33.87 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  34.15 
 
 		 306 aa  43.9  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06378  spermidine n1-acetyltransferase  25.17 
 
 		 176 aa  42.4  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>