43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3619 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3619  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
198 aa  385  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145227  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3949  GCN5-related N-acetyltransferase  77.95 
 
 
193 aa  299  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0114107  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3543  GCN5-related N-acetyltransferase  50.26 
 
 
197 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0684165  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1399  GCN5-related N-acetyltransferase  55.5 
 
 
201 aa  190  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  0.145547 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1743  hypothetical protein  56.85 
 
 
200 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.543402  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0968  GCN5-related N-acetyltransferase  56.12 
 
 
206 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7066  hypothetical protein  49.24 
 
 
197 aa  174  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300924  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2535  GCN5-related N-acetyltransferase  48.22 
 
 
208 aa  164  9e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.911959  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0932  GCN5-related N-acetyltransferase  46.67 
 
 
203 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0604455  normal  0.0176306 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0863  GCN5-related N-acetyltransferase  42.53 
 
 
199 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0282724  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2988  GCN5-related N-acetyltransferase  40.25 
 
 
172 aa  107  8.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.885762  normal  0.907931 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3037  GCN5-related N-acetyltransferase  39.67 
 
 
196 aa  101  9e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.191152 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2540  acetyltransferase  34.81 
 
 
165 aa  98.2  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11282  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0029  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
186 aa  97.8  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.908503 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  34.86 
 
 
477 aa  97.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1600  GCN5-related N-acetyltransferase  34.15 
 
 
171 aa  97.1  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.35561  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3680  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
175 aa  95.1  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135055  normal  0.0207882 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1427  GCN5-related N-acetyltransferase  35.93 
 
 
191 aa  92.4  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2143  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
173 aa  89.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.827643  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3533  GCN5-related N-acetyltransferase  36.49 
 
 
162 aa  90.5  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00867976 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1021  acetyltransferase  35.76 
 
 
173 aa  89  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.179395  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1056  acetyltransferase  35.15 
 
 
173 aa  86.7  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4026  GCN5-related N-acetyltransferase  38.64 
 
 
178 aa  86.7  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2386  GCN5-related N-acetyltransferase  36.53 
 
 
191 aa  85.5  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.162404  normal  0.592718 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1366  GCN5-related N-acetyltransferase  32.32 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560531  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0167  GCN5-related N-acetyltransferase  36.72 
 
 
184 aa  80.9  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000022315  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2656  GCN5-related N-acetyltransferase  31.68 
 
 
181 aa  80.9  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.312645  hitchhiker  0.00701873 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1614  putative acetyltransferase protein  31.71 
 
 
186 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0508699  normal  0.786708 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1435  putative acetyltransferase protein  30.49 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4582  GCN5-related N-acetyltransferase  36.92 
 
 
170 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7078  histone acetyltransferase HPA2-like acetyltransferase  34.73 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1312  GCN5-related N-acetyltransferase  41.51 
 
 
178 aa  51.6  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.449601  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1094  GCN5-related N-acetyltransferase  34.91 
 
 
153 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3275  GCN5-related N-acetyltransferase  27.55 
 
 
171 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.668307 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2632  GCN5-related N-acetyltransferase  26.17 
 
 
168 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4638  GCN5-related N-acetyltransferase  33.94 
 
 
222 aa  42.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3471  GCN5-related N-acetyltransferase  26.17 
 
 
168 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0107886  normal  0.412384 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20380  acetyltransferase  32.79 
 
 
184 aa  43.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2221  GCN5-related N-acetyltransferase  33.65 
 
 
179 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2267  GCN5-related N-acetyltransferase  33.65 
 
 
179 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0656952  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4803  GCN5-related N-acetyltransferase  32.11 
 
 
163 aa  41.6  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.901496  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  33.87 
 
 
431 aa  41.6  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2210  GCN5-related N-acetyltransferase  32.69 
 
 
179 aa  41.2  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245509  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>