33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7078 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7078  histone acetyltransferase HPA2-like acetyltransferase  100 
 
 
201 aa  404  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2386  GCN5-related N-acetyltransferase  74.74 
 
 
191 aa  279  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.162404  normal  0.592718 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2656  GCN5-related N-acetyltransferase  46.24 
 
 
181 aa  161  7e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.312645  hitchhiker  0.00701873 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3533  GCN5-related N-acetyltransferase  48.78 
 
 
162 aa  151  5.9999999999999996e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00867976 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0167  GCN5-related N-acetyltransferase  46.24 
 
 
184 aa  143  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000022315  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1600  GCN5-related N-acetyltransferase  45.73 
 
 
171 aa  135  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.35561  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2540  acetyltransferase  45.61 
 
 
165 aa  135  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11282  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4026  GCN5-related N-acetyltransferase  46.15 
 
 
178 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3680  GCN5-related N-acetyltransferase  47.92 
 
 
175 aa  123  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135055  normal  0.0207882 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4582  GCN5-related N-acetyltransferase  42.69 
 
 
170 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1427  GCN5-related N-acetyltransferase  35.92 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1021  acetyltransferase  34.39 
 
 
173 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.179395  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1614  putative acetyltransferase protein  33.55 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0508699  normal  0.786708 
 
 
-
 
NC_004310  BR1056  acetyltransferase  33.76 
 
 
173 aa  75.9  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1366  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 
187 aa  75.1  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560531  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  35.21 
 
 
477 aa  75.1  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1435  putative acetyltransferase protein  32.9 
 
 
186 aa  75.1  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2988  GCN5-related N-acetyltransferase  34.59 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.885762  normal  0.907931 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0932  GCN5-related N-acetyltransferase  37.59 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0604455  normal  0.0176306 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0029  GCN5-related N-acetyltransferase  32.35 
 
 
186 aa  71.2  0.000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.908503 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2143  GCN5-related N-acetyltransferase  33.12 
 
 
173 aa  70.9  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.827643  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3949  GCN5-related N-acetyltransferase  34.81 
 
 
193 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0114107  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7066  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300924  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3619  GCN5-related N-acetyltransferase  34.87 
 
 
198 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145227  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0968  GCN5-related N-acetyltransferase  35.25 
 
 
206 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2535  GCN5-related N-acetyltransferase  33.57 
 
 
208 aa  62.4  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.911959  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1743  hypothetical protein  30.06 
 
 
200 aa  58.9  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.543402  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1399  GCN5-related N-acetyltransferase  33.87 
 
 
201 aa  56.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  0.145547 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3543  GCN5-related N-acetyltransferase  27.81 
 
 
197 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0684165  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0863  GCN5-related N-acetyltransferase  37.23 
 
 
199 aa  50.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0282724  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3037  GCN5-related N-acetyltransferase  31.75 
 
 
196 aa  47.4  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.191152 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2568  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
289 aa  47.4  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.372205  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1840  GCN5-related N-acetyltransferase  30.67 
 
 
369 aa  42.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.422252  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>