44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1600 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1600  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 171 aa  360  6e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.35561  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2540  acetyltransferase  58.9 
 
 		 165 aa  214  5e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11282  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3533  GCN5-related N-acetyltransferase  52.47 
 
 		 162 aa  186  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00867976 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4582  GCN5-related N-acetyltransferase  48.41 
 
 		 170 aa  157  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2656  GCN5-related N-acetyltransferase  44.31 
 
 		 181 aa  154  7e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.312645  hitchhiker  0.00701873 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2386  GCN5-related N-acetyltransferase  42.68 
 
 		 191 aa  143  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.162404  normal  0.592718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7078  histone acetyltransferase HPA2-like acetyltransferase  45.73 
 
 		 201 aa  135  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3680  GCN5-related N-acetyltransferase  43.31 
 
 		 175 aa  128  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135055  normal  0.0207882 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4026  GCN5-related N-acetyltransferase  43.95 
 
 		 178 aa  125  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0167  GCN5-related N-acetyltransferase  42.26 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000022315  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  46.34 
 
 		 477 aa  109  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1614  putative acetyltransferase protein  44.8 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0508699  normal  0.786708 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1435  putative acetyltransferase protein  39.24 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1366  GCN5-related N-acetyltransferase  38.82 
 
 		 187 aa  103  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1427  GCN5-related N-acetyltransferase  39.69 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1021  acetyltransferase  38.82 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.179395  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7066  hypothetical protein  33.74 
 
 		 197 aa  98.6  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300924  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1056  acetyltransferase  38.16 
 
 		 173 aa  97.8  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3949  GCN5-related N-acetyltransferase  31.9 
 
 		 193 aa  94  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0114107  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2988  GCN5-related N-acetyltransferase  41.32 
 
 		 172 aa  92.8  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.885762  normal  0.907931 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3543  GCN5-related N-acetyltransferase  31.29 
 
 		 197 aa  88.2  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0684165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2143  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 		 173 aa  87.8  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.827643  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3619  GCN5-related N-acetyltransferase  36.43 
 
 		 198 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145227  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0968  GCN5-related N-acetyltransferase  37.98 
 
 		 206 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0029  GCN5-related N-acetyltransferase  30.12 
 
 		 186 aa  84.3  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.908503 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1743  hypothetical protein  31.45 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.543402  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0863  GCN5-related N-acetyltransferase  38.71 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0282724  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2535  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.911959  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1399  GCN5-related N-acetyltransferase  32.31 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  0.145547 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0932  GCN5-related N-acetyltransferase  28.75 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0604455  normal  0.0176306 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3037  GCN5-related N-acetyltransferase  30.5 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.191152 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2568  GCN5-related N-acetyltransferase  35.51 
 
 		 289 aa  50.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.372205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1632  acetyltransferase, GNAT family  33.33 
 
 		 155 aa  42  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00321176  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3713  acetyltransferase, GNAT family  31.03 
 
 		 153 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1276  GCN5-related N-acetyltransferase  28.32 
 
 		 270 aa  42  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0846  putative acetyltransferase  29.79 
 
 		 169 aa  41.6  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1597  acetyltransferase  33.33 
 
 		 155 aa  41.2  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1480  acetyltransferase  33.33 
 
 		 155 aa  41.2  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2430  GCN5-related N-acetyltransferase  27.18 
 
 		 180 aa  41.2  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000254083  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1453  acetyltransferase  33.33 
 
 		 155 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1667  acetyltransferase, GNAT family  33.33 
 
 		 155 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5404  GCN5-related N-acetyltransferase  32.08 
 
 		 166 aa  40.8  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0298216  normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4677  GCN5-related N-acetyltransferase  32.93 
 
 		 168 aa  40.8  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000068421 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4857  GCN5-related N-acetyltransferase  31.19 
 
 		 166 aa  40.8  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>