53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3680 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3680  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
175 aa  358  3e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135055  normal  0.0207882 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4026  GCN5-related N-acetyltransferase  87.28 
 
 
178 aa  317  7e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2656  GCN5-related N-acetyltransferase  43.2 
 
 
181 aa  147  6e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.312645  hitchhiker  0.00701873 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2386  GCN5-related N-acetyltransferase  45.76 
 
 
191 aa  138  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.162404  normal  0.592718 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0167  GCN5-related N-acetyltransferase  44.97 
 
 
184 aa  130  9e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000022315  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1600  GCN5-related N-acetyltransferase  43.31 
 
 
171 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.35561  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7078  histone acetyltransferase HPA2-like acetyltransferase  45.03 
 
 
201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3533  GCN5-related N-acetyltransferase  42.33 
 
 
162 aa  120  9e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00867976 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2540  acetyltransferase  43.21 
 
 
165 aa  120  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11282  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4582  GCN5-related N-acetyltransferase  43.68 
 
 
170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1427  GCN5-related N-acetyltransferase  38.6 
 
 
191 aa  111  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2143  GCN5-related N-acetyltransferase  34.52 
 
 
173 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.827643  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3949  GCN5-related N-acetyltransferase  37.28 
 
 
193 aa  102  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0114107  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1021  acetyltransferase  35 
 
 
173 aa  100  8e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.179395  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  42.03 
 
 
477 aa  100  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1056  acetyltransferase  34.38 
 
 
173 aa  98.6  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0863  GCN5-related N-acetyltransferase  37.87 
 
 
199 aa  96.7  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0282724  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0932  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
203 aa  95.9  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0604455  normal  0.0176306 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2535  GCN5-related N-acetyltransferase  39.86 
 
 
208 aa  94  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.911959  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7066  hypothetical protein  33.13 
 
 
197 aa  88.2  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300924  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2988  GCN5-related N-acetyltransferase  34.36 
 
 
172 aa  87.8  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.885762  normal  0.907931 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0029  GCN5-related N-acetyltransferase  34.68 
 
 
186 aa  87.4  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.908503 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1614  putative acetyltransferase protein  40.6 
 
 
186 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0508699  normal  0.786708 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1399  GCN5-related N-acetyltransferase  36.64 
 
 
201 aa  87.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  0.145547 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1366  GCN5-related N-acetyltransferase  39.86 
 
 
187 aa  87  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560531  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1435  putative acetyltransferase protein  40.6 
 
 
186 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3619  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
198 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145227  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3543  GCN5-related N-acetyltransferase  30.18 
 
 
197 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0684165  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3037  GCN5-related N-acetyltransferase  36.17 
 
 
196 aa  82  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.191152 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1743  hypothetical protein  34.34 
 
 
200 aa  72.4  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.543402  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0968  GCN5-related N-acetyltransferase  36.09 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0481  GCN5-related N-acetyltransferase  33.04 
 
 
287 aa  57.8  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3029  GCN5-related N-acetyltransferase  36.73 
 
 
297 aa  55.5  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2568  GCN5-related N-acetyltransferase  35.42 
 
 
289 aa  55.5  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.372205  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2952  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 1  26.83 
 
 
172 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.538845  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3252  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 1  26.45 
 
 
172 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3282  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 1  25.62 
 
 
172 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1503  GCN5-related N-acetyltransferase  30.19 
 
 
170 aa  44.3  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.528782 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3731  GCN5-related N-acetyltransferase  26.92 
 
 
172 aa  44.3  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0613  hypothetical protein  29.09 
 
 
170 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0834  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25.76 
 
 
318 aa  43.9  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0786078  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3275  acetyltransferase  25.62 
 
 
172 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266027  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3645  GCN5-related N-acetyltransferase  28.21 
 
 
174 aa  44.3  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5404  GCN5-related N-acetyltransferase  25.31 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0298216  normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4857  GCN5-related N-acetyltransferase  25.31 
 
 
166 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1840  GCN5-related N-acetyltransferase  26.47 
 
 
369 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.422252  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3031  sporulation transcriptional regulator  25.49 
 
 
144 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417018  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0460  putative acetyltransferase  35.24 
 
 
157 aa  43.5  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2602  GCN5-related N-acetyltransferase  34.07 
 
 
151 aa  42.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229806  normal  0.0357892 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1998  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 1  27.72 
 
 
172 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0056  GCN5-related N-acetyltransferase  32.97 
 
 
295 aa  41.6  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1530  acetyltransferase  33.71 
 
 
162 aa  41.2  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1080  Prolyl aminopeptidase  28.83 
 
 
331 aa  40.8  0.01  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>