More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1080 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_1080  Prolyl aminopeptidase  100 
 
 
331 aa  682    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1635  acetyltransferase  46.25 
 
 
183 aa  151  1e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.964206 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0431  Prolyl aminopeptidase  41.42 
 
 
170 aa  144  3e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3731  GCN5-related N-acetyltransferase  39.63 
 
 
172 aa  139  7e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3252  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 1  40 
 
 
172 aa  129  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3300  GCN5-related N-acetyltransferase  40.12 
 
 
175 aa  128  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0928337  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3282  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 1  40 
 
 
172 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3275  acetyltransferase  40 
 
 
172 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2952  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 1  40 
 
 
172 aa  125  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.538845  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1998  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 1  39.02 
 
 
172 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2639  GCN5-related N-acetyltransferase  40.24 
 
 
173 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.806103 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1269  acetyltransferase  37.87 
 
 
172 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3645  GCN5-related N-acetyltransferase  38.69 
 
 
174 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0870  acetyltransferase  37.58 
 
 
173 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0427112  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1961  acetyltransferase  35.93 
 
 
179 aa  112  9e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2450  GCN5-related N-acetyltransferase  36.3 
 
 
146 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325798  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2363  Prolyl aminopeptidase  36.59 
 
 
171 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2393  GCN5-related N-acetyltransferase  35.93 
 
 
171 aa  110  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2439  GCN5-related N-acetyltransferase  35.93 
 
 
171 aa  110  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3031  sporulation transcriptional regulator  37.98 
 
 
144 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417018  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0363  GCN5-related N-acetyltransferase  35.98 
 
 
175 aa  97.1  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791622  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2020  GCN5-related N-acetyltransferase  35.46 
 
 
152 aa  93.6  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00823373  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05330  predicted acyltransferase  35.62 
 
 
143 aa  91.3  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1336  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 
158 aa  85.5  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2021  GCN5-related N-acetyltransferase  35.46 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000198692  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3298  GCN5-related N-acetyltransferase  32.62 
 
 
148 aa  82.4  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.181842  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1129  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
163 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0674  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
163 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1153  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
163 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4265  GCN5-related N-acetyltransferase  34.04 
 
 
161 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.439553  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2152  GCN5-related N-acetyltransferase  33.58 
 
 
163 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0827437  normal  0.735996 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0566  GCN5-related N-acetyltransferase  28.87 
 
 
152 aa  78.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1031  GCN5-related N-acetyltransferase  33.58 
 
 
163 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1069  acetyltransferase  36.22 
 
 
149 aa  78.2  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0161  GCN5-related N-acetyltransferase  32.61 
 
 
152 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0647025  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1035  GCN5-related N-acetyltransferase  33.58 
 
 
163 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.292838  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  34.38 
 
 
155 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1307  GCN5-related N-acetyltransferase  28.07 
 
 
184 aa  75.1  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3130  GCN5-related N-acetyltransferase  28.39 
 
 
173 aa  75.1  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2870  GCN5-related N-acetyltransferase  32.85 
 
 
156 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.495328  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1849  GCN5-related N-acetyltransferase  29.1 
 
 
149 aa  73.9  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.524385 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01553  acetyltransferase  27.92 
 
 
175 aa  72.8  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133022  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1748  acetyltransferase  32.12 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.396141  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3107  GCN5-related N-acetyltransferase  25.32 
 
 
170 aa  72.4  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296377  normal  0.792826 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2221  GCN5-related N-acetyltransferase  29.07 
 
 
179 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2267  GCN5-related N-acetyltransferase  29.07 
 
 
179 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0656952  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2373  hypothetical protein  32.84 
 
 
152 aa  70.9  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0512  GCN5-related N-acetyltransferase  29.66 
 
 
152 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5252  GCN5-related N-acetyltransferase  29.93 
 
 
150 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2885  GCN5-related N-acetyltransferase  29.46 
 
 
164 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.502905 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1654  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
152 aa  70.9  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.670285  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2817  hypothetical protein  31.34 
 
 
154 aa  71.2  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2520  hypothetical protein  32.84 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2507  acetyltransferase protein  28.47 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3798  ElaA protein  31.54 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00631314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2210  GCN5-related N-acetyltransferase  28.49 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245509  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4518  GCN5-related N-acetyltransferase  28.79 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0561  acetyltransferase  32.12 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2142  acetyltransferase  35.04 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000170191  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2448  acetyltransferase  32.12 
 
 
176 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03440  probable acetyltransferase YybD  29.08 
 
 
147 aa  68.6  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.149506  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2761  acetyltransferase  32.12 
 
 
225 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326782  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2876  acetyltransferase  32.12 
 
 
222 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3913  GCN5-related N-acetyltransferase  32.79 
 
 
142 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1771  acetyltransferase  32.12 
 
 
176 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.290563  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1397  GCN5-related N-acetyltransferase  32.85 
 
 
151 aa  69.3  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2820  acetyltransferase  32.12 
 
 
225 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.91191  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2562  GCN5-related N-acetyltransferase  27.2 
 
 
150 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.459668  normal  0.179333 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2833  acetyltransferase  32.12 
 
 
176 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5011  acetyltransferase, GNAT family  28.97 
 
 
152 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl607  acyltransferase  30.28 
 
 
146 aa  67.8  0.0000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0568  GCN5-related N-acetyltransferase  27.75 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
157 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1719  GCN5-related N-acetyltransferase  29.2 
 
 
147 aa  67  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4523  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
151 aa  67  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0916694 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1856  GCN5-related N-acetyltransferase  33.61 
 
 
155 aa  67  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01400  hypothetical protein  29.79 
 
 
150 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1787  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
177 aa  67  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.999117  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0190  hypothetical protein  29.79 
 
 
150 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12684  hypothetical protein  29.38 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0010108  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2471  GCN5-related N-acetyltransferase  30.63 
 
 
173 aa  67  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.583315 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3507  GCN5-related N-acetyltransferase  31.16 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1634  acetyltransferase  28.67 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.927882 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0525  GCN5-related N-acetyltransferase  29.71 
 
 
157 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0404  acetyltransferase  30.77 
 
 
152 aa  65.1  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0143  GCN5-related N-acetyltransferase  29.01 
 
 
157 aa  65.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0550185  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06200  predicted acyltransferase  28.57 
 
 
152 aa  65.1  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00761  hypothetical protein  29.71 
 
 
150 aa  64.3  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2646  hypothetical protein  29.1 
 
 
153 aa  63.9  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.236259  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3750  GCN5-related N-acetyltransferase  28.03 
 
 
172 aa  63.9  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2455  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
188 aa  63.5  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.189095  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2448  hypothetical protein  29.85 
 
 
153 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.60595  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2498  hypothetical protein  29.85 
 
 
153 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.705212  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2422  hypothetical protein  29.1 
 
 
153 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.527979  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2656  hypothetical protein  29.85 
 
 
153 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.483858  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0854  GCN5-related N-acetyltransferase  29.58 
 
 
166 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2540  hypothetical protein  29.85 
 
 
153 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.131258  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3911  GCN5-related N-acetyltransferase  26.04 
 
 
178 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17227  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2492  GCN5-related N-acetyltransferase  27.38 
 
 
178 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.314517 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1303  GCN5-related N-acetyltransferase  26.14 
 
 
196 aa  63.2  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>