37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1743 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1743  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  399  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.543402  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3543  GCN5-related N-acetyltransferase  50.26 
 
 		 197 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0684165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3949  GCN5-related N-acetyltransferase  52.28 
 
 		 193 aa  186  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0114107  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7066  hypothetical protein  48.99 
 
 		 197 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1399  GCN5-related N-acetyltransferase  47.15 
 
 		 201 aa  170  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  0.145547 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0968  GCN5-related N-acetyltransferase  56.19 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0932  GCN5-related N-acetyltransferase  45.36 
 
 		 203 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0604455  normal  0.0176306 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3619  GCN5-related N-acetyltransferase  54.59 
 
 		 198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145227  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2535  GCN5-related N-acetyltransferase  46.04 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.911959  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2988  GCN5-related N-acetyltransferase  45.06 
 
 		 172 aa  118  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.885762  normal  0.907931 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0863  GCN5-related N-acetyltransferase  39.78 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0282724  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0029  GCN5-related N-acetyltransferase  39.66 
 
 		 186 aa  102  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.908503 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1427  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 		 191 aa  99.8  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3037  GCN5-related N-acetyltransferase  38.89 
 
 		 196 aa  99.4  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.191152 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1021  acetyltransferase  34.71 
 
 		 173 aa  97.8  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.179395  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2143  GCN5-related N-acetyltransferase  34.32 
 
 		 173 aa  97.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.827643  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1056  acetyltransferase  34.12 
 
 		 173 aa  95.5  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  35.29 
 
 		 477 aa  95.1  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1600  GCN5-related N-acetyltransferase  31.45 
 
 		 171 aa  90.1  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.35561  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2540  acetyltransferase  28.3 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11282  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1435  putative acetyltransferase protein  34.16 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1614  putative acetyltransferase protein  34.36 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0508699  normal  0.786708 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1366  GCN5-related N-acetyltransferase  34.16 
 
 		 187 aa  81.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3680  GCN5-related N-acetyltransferase  35.92 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135055  normal  0.0207882 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3533  GCN5-related N-acetyltransferase  27.52 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00867976 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4582  GCN5-related N-acetyltransferase  32.48 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2386  GCN5-related N-acetyltransferase  30.86 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.162404  normal  0.592718 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4026  GCN5-related N-acetyltransferase  31.52 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0167  GCN5-related N-acetyltransferase  29.52 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000022315  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2656  GCN5-related N-acetyltransferase  25.15 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.312645  hitchhiker  0.00701873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7078  histone acetyltransferase HPA2-like acetyltransferase  30.06 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1930  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 156 aa  43.5  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.525718  hitchhiker  0.000000154732 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2568  GCN5-related N-acetyltransferase  34.43 
 
 		 289 aa  43.5  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.372205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2234  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  29.89 
 
 		 314 aa  43.1  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.406017 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3029  GCN5-related N-acetyltransferase  30.23 
 
 		 297 aa  43.1  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2975  acetyltransferase  34.12 
 
 		 164 aa  42  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4186  GCN5-related N-acetyltransferase  35.1 
 
 		 168 aa  41.6  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>