37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4582 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4582  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 170 aa  357  4e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3533  GCN5-related N-acetyltransferase  54.55 
 
 		 162 aa  174  5e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00867976 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2540  acetyltransferase  48.73 
 
 		 165 aa  164  6.9999999999999995e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11282  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1600  GCN5-related N-acetyltransferase  48.41 
 
 		 171 aa  157  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.35561  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2656  GCN5-related N-acetyltransferase  46.34 
 
 		 181 aa  142  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.312645  hitchhiker  0.00701873 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2386  GCN5-related N-acetyltransferase  45.03 
 
 		 191 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.162404  normal  0.592718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7078  histone acetyltransferase HPA2-like acetyltransferase  42.69 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0167  GCN5-related N-acetyltransferase  43.02 
 
 		 184 aa  116  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000022315  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3680  GCN5-related N-acetyltransferase  43.79 
 
 		 175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135055  normal  0.0207882 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4026  GCN5-related N-acetyltransferase  43.4 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3949  GCN5-related N-acetyltransferase  36.15 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0114107  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2535  GCN5-related N-acetyltransferase  37.75 
 
 		 208 aa  77.4  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.911959  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0029  GCN5-related N-acetyltransferase  31.68 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.908503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7066  hypothetical protein  32.47 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3543  GCN5-related N-acetyltransferase  31.45 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0684165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  34.57 
 
 		 477 aa  75.5  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1427  GCN5-related N-acetyltransferase  34.51 
 
 		 191 aa  74.3  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2988  GCN5-related N-acetyltransferase  33.54 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.885762  normal  0.907931 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1614  putative acetyltransferase protein  33.78 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0508699  normal  0.786708 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1435  putative acetyltransferase protein  33.11 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3619  GCN5-related N-acetyltransferase  36.22 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145227  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1021  acetyltransferase  34.44 
 
 		 173 aa  67.4  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.179395  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2143  GCN5-related N-acetyltransferase  37.07 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.827643  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1366  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560531  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1056  acetyltransferase  33.77 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1743  hypothetical protein  32.48 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.543402  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0932  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0604455  normal  0.0176306 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1399  GCN5-related N-acetyltransferase  33.07 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  0.145547 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0863  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0282724  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3037  GCN5-related N-acetyltransferase  27.33 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.191152 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0968  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3713  acetyltransferase, GNAT family  28.43 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1667  acetyltransferase, GNAT family  27.27 
 
 		 155 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1453  acetyltransferase  27.27 
 
 		 155 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1632  acetyltransferase, GNAT family  28.43 
 
 		 155 aa  41.2  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00321176  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1597  acetyltransferase  27.27 
 
 		 155 aa  41.2  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1480  acetyltransferase  27.27 
 
 		 155 aa  41.2  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>