49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2988 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2988  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
172 aa  355  1.9999999999999998e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.885762  normal  0.907931 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1021  acetyltransferase  48.26 
 
 
173 aa  159  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.179395  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1056  acetyltransferase  47.67 
 
 
173 aa  157  7e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2143  GCN5-related N-acetyltransferase  46.2 
 
 
173 aa  155  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.827643  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1427  GCN5-related N-acetyltransferase  45.78 
 
 
191 aa  143  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  45.45 
 
 
477 aa  131  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7066  hypothetical protein  43.64 
 
 
197 aa  128  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300924  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3543  GCN5-related N-acetyltransferase  40.12 
 
 
197 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0684165  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0029  GCN5-related N-acetyltransferase  40.48 
 
 
186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.908503 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1435  putative acetyltransferase protein  42.77 
 
 
186 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1614  putative acetyltransferase protein  42.17 
 
 
186 aa  124  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0508699  normal  0.786708 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1366  GCN5-related N-acetyltransferase  39.24 
 
 
187 aa  121  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560531  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3949  GCN5-related N-acetyltransferase  43.87 
 
 
193 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0114107  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1743  hypothetical protein  45.06 
 
 
200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.543402  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3037  GCN5-related N-acetyltransferase  40.79 
 
 
196 aa  112  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.191152 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0932  GCN5-related N-acetyltransferase  39.63 
 
 
203 aa  108  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0604455  normal  0.0176306 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1399  GCN5-related N-acetyltransferase  40.74 
 
 
201 aa  103  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  0.145547 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3533  GCN5-related N-acetyltransferase  36.77 
 
 
162 aa  100  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00867976 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1600  GCN5-related N-acetyltransferase  37.01 
 
 
171 aa  99.8  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.35561  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0863  GCN5-related N-acetyltransferase  46.22 
 
 
199 aa  98.2  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0282724  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2535  GCN5-related N-acetyltransferase  38.36 
 
 
208 aa  95.5  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.911959  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2386  GCN5-related N-acetyltransferase  37.11 
 
 
191 aa  95.1  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.162404  normal  0.592718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3619  GCN5-related N-acetyltransferase  46.55 
 
 
198 aa  92  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145227  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2540  acetyltransferase  34.97 
 
 
165 aa  91.7  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11282  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0968  GCN5-related N-acetyltransferase  45.76 
 
 
206 aa  91.3  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3680  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
175 aa  87.4  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135055  normal  0.0207882 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2656  GCN5-related N-acetyltransferase  30.97 
 
 
181 aa  85.1  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.312645  hitchhiker  0.00701873 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4026  GCN5-related N-acetyltransferase  32.92 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4582  GCN5-related N-acetyltransferase  33.74 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7078  histone acetyltransferase HPA2-like acetyltransferase  34.59 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0167  GCN5-related N-acetyltransferase  31.14 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000022315  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2568  GCN5-related N-acetyltransferase  35.51 
 
 
289 aa  58.2  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.372205  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2758  GCN5-related N-acetyltransferase  34.85 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.014762 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3162  acetyltransferase, GNAT family  34.85 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1930  GCN5-related N-acetyltransferase  36.47 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.525718  hitchhiker  0.000000154732 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2603  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  37.04 
 
 
152 aa  43.5  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2893  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  40 
 
 
181 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4807  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
182 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.370573  normal  0.130595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5807  hypothetical protein  35.8 
 
 
164 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1761  GCN5-related N-acetyltransferase  34.43 
 
 
194 aa  42.4  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2631  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.5 
 
 
153 aa  42  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0709643  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4262  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.7 
 
 
162 aa  42  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0943  GCN5-related N-acetyltransferase  34.88 
 
 
152 aa  42  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0839  GCN5-related N-acetyltransferase  32.26 
 
 
165 aa  41.6  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.020664 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3764  GCN5-related N-acetyltransferase  40.68 
 
 
169 aa  41.6  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4255  GCN5-related N-acetyltransferase  34.74 
 
 
181 aa  41.2  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.179135  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0481  GCN5-related N-acetyltransferase  32.05 
 
 
287 aa  40.8  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2616  GCN5-related N-acetyltransferase  34.31 
 
 
367 aa  40.8  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.719016  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2393  GCN5-related N-acetyltransferase  31.45 
 
 
170 aa  40.8  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0945541  hitchhiker  0.000263761 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>