35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3543 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3543  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 197 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0684165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7066  hypothetical protein  60.41 
 
 		 197 aa  259  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1743  hypothetical protein  50.26 
 
 		 200 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.543402  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3949  GCN5-related N-acetyltransferase  47.15 
 
 		 193 aa  179  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0114107  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0932  GCN5-related N-acetyltransferase  44.62 
 
 		 203 aa  177  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0604455  normal  0.0176306 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0968  GCN5-related N-acetyltransferase  47.72 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3619  GCN5-related N-acetyltransferase  50.26 
 
 		 198 aa  174  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145227  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1399  GCN5-related N-acetyltransferase  47.89 
 
 		 201 aa  169  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  0.145547 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2535  GCN5-related N-acetyltransferase  44.72 
 
 		 208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.911959  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2988  GCN5-related N-acetyltransferase  40.12 
 
 		 172 aa  119  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.885762  normal  0.907931 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1021  acetyltransferase  38.75 
 
 		 173 aa  115  5e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.179395  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1056  acetyltransferase  38.12 
 
 		 173 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  37.06 
 
 		 477 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1427  GCN5-related N-acetyltransferase  36.57 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2143  GCN5-related N-acetyltransferase  34.59 
 
 		 173 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.827643  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0029  GCN5-related N-acetyltransferase  34.5 
 
 		 186 aa  105  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.908503 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0863  GCN5-related N-acetyltransferase  35.48 
 
 		 199 aa  99  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0282724  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3037  GCN5-related N-acetyltransferase  37.43 
 
 		 196 aa  98.6  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.191152 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1366  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 187 aa  90.5  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1600  GCN5-related N-acetyltransferase  31.29 
 
 		 171 aa  88.2  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.35561  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2540  acetyltransferase  30 
 
 		 165 aa  87  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11282  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1614  putative acetyltransferase protein  32.08 
 
 		 186 aa  84.7  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0508699  normal  0.786708 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1435  putative acetyltransferase protein  31.25 
 
 		 186 aa  84.7  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3680  GCN5-related N-acetyltransferase  34.07 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135055  normal  0.0207882 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4582  GCN5-related N-acetyltransferase  31.45 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4026  GCN5-related N-acetyltransferase  29.78 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3533  GCN5-related N-acetyltransferase  30.17 
 
 		 162 aa  72  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00867976 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2656  GCN5-related N-acetyltransferase  26.77 
 
 		 181 aa  72  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.312645  hitchhiker  0.00701873 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2386  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.162404  normal  0.592718 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0167  GCN5-related N-acetyltransferase  30.47 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000022315  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7078  histone acetyltransferase HPA2-like acetyltransferase  27.81 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2568  GCN5-related N-acetyltransferase  30.3 
 
 		 289 aa  45.4  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.372205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1326  GCN5-related N-acetyltransferase  28.74 
 
 		 169 aa  42  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160898  normal  0.179627 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1453  acetyltransferase  31.33 
 
 		 155 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1667  acetyltransferase, GNAT family  31.33 
 
 		 155 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>