37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0932 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_0932  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
203 aa  416  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0604455  normal  0.0176306 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3543  GCN5-related N-acetyltransferase  44.62 
 
 
197 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0684165  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7066  hypothetical protein  45.18 
 
 
197 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300924  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1399  GCN5-related N-acetyltransferase  44.85 
 
 
201 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  0.145547 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0968  GCN5-related N-acetyltransferase  50.51 
 
 
206 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3949  GCN5-related N-acetyltransferase  45.08 
 
 
193 aa  161  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0114107  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1743  hypothetical protein  45.36 
 
 
200 aa  151  8e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.543402  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2535  GCN5-related N-acetyltransferase  41.95 
 
 
208 aa  143  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.911959  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3619  GCN5-related N-acetyltransferase  45.13 
 
 
198 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145227  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0029  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
186 aa  107  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.908503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2988  GCN5-related N-acetyltransferase  39.63 
 
 
172 aa  101  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.885762  normal  0.907931 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  35.63 
 
 
477 aa  97.1  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1427  GCN5-related N-acetyltransferase  36.47 
 
 
191 aa  95.5  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3680  GCN5-related N-acetyltransferase  36.91 
 
 
175 aa  92.8  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135055  normal  0.0207882 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3037  GCN5-related N-acetyltransferase  34.44 
 
 
196 aa  91.3  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.191152 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0863  GCN5-related N-acetyltransferase  35.43 
 
 
199 aa  90.1  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0282724  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2143  GCN5-related N-acetyltransferase  32.54 
 
 
173 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.827643  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1021  acetyltransferase  33.93 
 
 
173 aa  87.8  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.179395  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3533  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
162 aa  87  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00867976 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2656  GCN5-related N-acetyltransferase  31.71 
 
 
181 aa  86.3  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.312645  hitchhiker  0.00701873 
 
 
-
 
NC_004310  BR1056  acetyltransferase  33.33 
 
 
173 aa  85.9  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4026  GCN5-related N-acetyltransferase  33.94 
 
 
178 aa  84.7  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2386  GCN5-related N-acetyltransferase  34.23 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.162404  normal  0.592718 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0167  GCN5-related N-acetyltransferase  31.93 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000022315  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1614  putative acetyltransferase protein  32.08 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0508699  normal  0.786708 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1600  GCN5-related N-acetyltransferase  28.75 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.35561  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2540  acetyltransferase  30.19 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11282  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7078  histone acetyltransferase HPA2-like acetyltransferase  37.59 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1435  putative acetyltransferase protein  29.52 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1366  GCN5-related N-acetyltransferase  32.68 
 
 
187 aa  68.9  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560531  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4582  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
170 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1179  GCN5-related N-acetyltransferase  39.71 
 
 
155 aa  43.9  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.242924 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2758  GCN5-related N-acetyltransferase  34.33 
 
 
161 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.014762 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3162  acetyltransferase, GNAT family  34.33 
 
 
161 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03080  putative acetyltransferase  36.84 
 
 
148 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.043111  hitchhiker  0.000000418367 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2234  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  33.82 
 
 
314 aa  42.4  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.406017 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4881  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 
197 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>