52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1056 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1056  acetyltransferase  100 
 
 
173 aa  358  2e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1021  acetyltransferase  99.42 
 
 
173 aa  357  4e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.179395  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2143  GCN5-related N-acetyltransferase  77.33 
 
 
173 aa  291  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.827643  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  50.3 
 
 
477 aa  166  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1366  GCN5-related N-acetyltransferase  45.24 
 
 
187 aa  155  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560531  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1427  GCN5-related N-acetyltransferase  46.15 
 
 
191 aa  155  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2988  GCN5-related N-acetyltransferase  45.61 
 
 
172 aa  153  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.885762  normal  0.907931 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1614  putative acetyltransferase protein  46.91 
 
 
186 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0508699  normal  0.786708 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1435  putative acetyltransferase protein  45.68 
 
 
186 aa  147  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3543  GCN5-related N-acetyltransferase  38.12 
 
 
197 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0684165  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7066  hypothetical protein  36.88 
 
 
197 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300924  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3037  GCN5-related N-acetyltransferase  38.71 
 
 
196 aa  100  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.191152 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1600  GCN5-related N-acetyltransferase  38.16 
 
 
171 aa  97.8  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.35561  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0029  GCN5-related N-acetyltransferase  38.36 
 
 
186 aa  97.1  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.908503 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3680  GCN5-related N-acetyltransferase  38.28 
 
 
175 aa  97.1  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135055  normal  0.0207882 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0863  GCN5-related N-acetyltransferase  38.61 
 
 
199 aa  95.5  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0282724  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4026  GCN5-related N-acetyltransferase  36.72 
 
 
178 aa  94  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3949  GCN5-related N-acetyltransferase  36.97 
 
 
193 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0114107  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1743  hypothetical protein  34.12 
 
 
200 aa  88.6  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.543402  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0932  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
203 aa  85.9  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0604455  normal  0.0176306 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3533  GCN5-related N-acetyltransferase  37.33 
 
 
162 aa  84  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00867976 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2535  GCN5-related N-acetyltransferase  33.53 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.911959  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2540  acetyltransferase  33.54 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11282  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1399  GCN5-related N-acetyltransferase  32.1 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481257  normal  0.145547 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0968  GCN5-related N-acetyltransferase  38.02 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7078  histone acetyltransferase HPA2-like acetyltransferase  33.76 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2386  GCN5-related N-acetyltransferase  33.12 
 
 
191 aa  74.7  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.162404  normal  0.592718 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2656  GCN5-related N-acetyltransferase  36.57 
 
 
181 aa  73.9  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.312645  hitchhiker  0.00701873 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3619  GCN5-related N-acetyltransferase  35.15 
 
 
198 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.145227  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4582  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2568  GCN5-related N-acetyltransferase  32.68 
 
 
289 aa  63.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.372205  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0167  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 
184 aa  62.4  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000022315  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1597  acetyltransferase  33.85 
 
 
155 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1453  acetyltransferase  33.85 
 
 
155 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1453  acetyltransferase  33.85 
 
 
155 aa  45.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1480  acetyltransferase  33.85 
 
 
155 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1667  acetyltransferase, GNAT family  33.85 
 
 
155 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1496  GCN5-related N-acetyltransferase  33.85 
 
 
155 aa  44.7  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.162375  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3029  GCN5-related N-acetyltransferase  29.11 
 
 
297 aa  44.3  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1743  acetyltransferase, GNAT family  32.31 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000234537  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4103  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
291 aa  43.9  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.131748 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1703  acetyltransferase  32.31 
 
 
155 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.579377  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0587  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.36 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5666  GCN5-related N-acetyltransferase  27.03 
 
 
158 aa  42.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00670708 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1308  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
133 aa  42.4  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1632  acetyltransferase, GNAT family  32.31 
 
 
155 aa  42  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00321176  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3713  acetyltransferase, GNAT family  32.31 
 
 
153 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3260  acetyltransferase  28.79 
 
 
168 aa  41.6  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5047  GCN5-related N-acetyltransferase  32.47 
 
 
175 aa  41.6  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.608856  normal  0.868904 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3429  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  27.21 
 
 
297 aa  41.2  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0731  GCN5-related N-acetyltransferase  31.11 
 
 
164 aa  40.8  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.2 
 
 
156 aa  41.2  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>