More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4677 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4677  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
168 aa  345  1e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068421 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0731  Carbonate dehydratase  52.17 
 
 
380 aa  157  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0099  GCN5-related N-acetyltransferase:carbonic anhydrase  51.61 
 
 
387 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.609712  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3535  GCN5-related N-acetyltransferase  51.68 
 
 
164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0151129 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5915  GCN5-related N-acetyltransferase  47.06 
 
 
162 aa  138  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1275  GCN5-related N-acetyltransferase  51.75 
 
 
163 aa  138  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308513  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0402  GCN5-related N-acetyltransferase  47.95 
 
 
196 aa  135  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0188  putative acetyltransferase  50 
 
 
169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340862  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3784  GCN5-related N-acetyltransferase  47.33 
 
 
162 aa  134  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.316492  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1562  GCN5-related N-acetyltransferase  48.2 
 
 
171 aa  134  5e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.233246 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1340  GCN5-related N-acetyltransferase  42.41 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000436515 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1358  GCN5-related N-acetyltransferase  46.21 
 
 
157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0289  GCN5-related N-acetyltransferase  47.14 
 
 
171 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000757903 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0284  GCN5-related N-acetyltransferase  47.14 
 
 
171 aa  127  6e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00100588  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0349  GCN5-related N-acetyltransferase  41.51 
 
 
189 aa  125  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000326393 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0214  GCN5-related N-acetyltransferase  47.4 
 
 
162 aa  125  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.159498 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00969  GNAT family N-acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01380)  41.25 
 
 
238 aa  120  7e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0267  GCN5-related N-acetyltransferase  45.58 
 
 
162 aa  119  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4902  GCN5-related N-acetyltransferase  38.89 
 
 
195 aa  114  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185466  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3701  GCN5-related N-acetyltransferase  39.13 
 
 
167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2923  GCN5-related N-acetyltransferase  40.79 
 
 
156 aa  106  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00551848  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2929  GCN5-related N-acetyltransferase  39.58 
 
 
161 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0333345  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4712  GCN5-related N-acetyltransferase  38.56 
 
 
166 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577703  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  38.56 
 
 
166 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.733249  normal  0.303303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2461  GCN5-related N-acetyltransferase  38.56 
 
 
175 aa  100  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3318  GCN5-related N-acetyltransferase  37.24 
 
 
157 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0859673 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3870  GCN5-related N-acetyltransferase  37.58 
 
 
154 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.47616 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0669  GCN5-related N-acetyltransferase  37.59 
 
 
154 aa  95.5  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0840  hypothetical protein  34.44 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581009  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0618  GCN5-related N-acetyltransferase  34.81 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.971308  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1745  MarR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550965  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06630  acetyltransferase, N-acetylglutamate synthase  35.04 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300608  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2042  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
170 aa  73.9  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236915  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  34.75 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8209  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  33.05 
 
 
291 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0943  GCN5-related N-acetyltransferase  38.54 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4636  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 
166 aa  71.2  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2487  acetyltransferase  29.25 
 
 
160 aa  70.5  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184909  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0015  GCN5-related N-acetyltransferase  33.88 
 
 
153 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1054  putative acetyltransferase  29.37 
 
 
164 aa  70.5  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0971  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
291 aa  68.6  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2529  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  32.2 
 
 
291 aa  68.6  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3727  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20380  acetyltransferase  26.06 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4512  acetyltransferase  36.56 
 
 
167 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0128967  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4827  acetyltransferase  36.56 
 
 
167 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
340 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  28.19 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5056  GCN5-related N-acetyltransferase  25.85 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  28.48 
 
 
334 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
352 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0376  GCN5-related N-acetyltransferase  32.08 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4772  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 
166 aa  63.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0163448  hitchhiker  0.000161675 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5914  GCN5-related N-acetyltransferase  36.26 
 
 
167 aa  63.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0450  GCN5-related N-acetyltransferase  33.93 
 
 
158 aa  63.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3682  GCN5-related N-acetyltransferase  30.36 
 
 
167 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.98699  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4039  GCN5-related N-acetyltransferase  29.38 
 
 
169 aa  62.8  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.880939  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0377  GCN5-related N-acetyltransferase  36.67 
 
 
162 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.294177  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  31.19 
 
 
312 aa  62.8  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
347 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2927  GCN5-related N-acetyltransferase  22.39 
 
 
310 aa  62.4  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4044  acetyltransferase  30.36 
 
 
167 aa  62  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3546  acetyltransferase  30.36 
 
 
167 aa  62  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04790  Predicted acetyltransferase  35.11 
 
 
152 aa  61.6  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.45 
 
 
349 aa  61.2  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04122  predicted acetyltransferase  42.19 
 
 
167 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5777  acetyltransferase, GNAT family  42.19 
 
 
167 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04086  hypothetical protein  42.19 
 
 
167 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5083  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.83 
 
 
294 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.569191  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0559  GCN5-related N-acetyltransferase  30.19 
 
 
177 aa  60.5  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.518435  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7297  GCN5-related N-acetyltransferase  36.7 
 
 
156 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.537656 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  25.81 
 
 
349 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0387  putative acetyltransferase  25.62 
 
 
182 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.47745  normal  0.489685 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1166  GCN5-related N-acetyltransferase  35.05 
 
 
155 aa  58.2  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.486231  unclonable  0.0000000237165 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 
313 aa  57.8  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3907  GCN5-related N-acetyltransferase  35.48 
 
 
203 aa  57.8  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.586477  normal  0.215987 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3741  GCN5-related N-acetyltransferase  39.06 
 
 
167 aa  57.8  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3756  GCN5-related N-acetyltransferase  39.06 
 
 
167 aa  57.8  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4736  acetyltransferase  39.06 
 
 
167 aa  57.8  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal  0.688624 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3555  GCN5-related N-acetyltransferase  33.68 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.561204  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1922  acetyltransferase (GNAT) family protein  27.36 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641628  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1757  GCN5-related N-acetyltransferase  34.52 
 
 
155 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4352  GCN5-related N-acetyltransferase  24.67 
 
 
183 aa  57  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.873897  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3564  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
167 aa  57.4  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2134  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.25 
 
 
322 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4166  GCN5-related N-acetyltransferase  30.93 
 
 
156 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2428  GCN5-related N-acetyltransferase  25.69 
 
 
178 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0313038  normal  0.321055 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 
307 aa  56.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2563  GCN5-related N-acetyltransferase  33.94 
 
 
149 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.108624 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3178  GCN5-related N-acetyltransferase  29.75 
 
 
173 aa  56.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2501  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  32.98 
 
 
289 aa  56.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  26.25 
 
 
309 aa  55.5  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1535  GCN5-related N-acetyltransferase  26.14 
 
 
188 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.120552 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09200  acetyltransferase  32.74 
 
 
163 aa  55.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0795063  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3374  GCN5-related N-acetyltransferase  30.53 
 
 
149 aa  55.1  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0078715  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0288  GCN5-related N-acetyltransferase  34.83 
 
 
160 aa  55.1  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4729  acetyltransferase, gnat family  37.7 
 
 
167 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.900741  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4759  acetyltransferase, gnat family  37.7 
 
 
167 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4878  GNAT family acetyltransferase  37.7 
 
 
167 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>