More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0916 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 309 aa  634    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  89 
 
 		 340 aa  543  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  85.53 
 
 		 320 aa  533  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  89.64 
 
 		 340 aa  526  1e-148  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  89.64 
 
 		 326 aa  526  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  82.72 
 
 		 349 aa  517  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  82.72 
 
 		 347 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  82.72 
 
 		 349 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  83.39 
 
 		 347 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  61.31 
 
 		 313 aa  386  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  61.49 
 
 		 312 aa  375  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  58.92 
 
 		 334 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  58.18 
 
 		 352 aa  365  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  59.67 
 
 		 322 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  53 
 
 		 283 aa  305  8.000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  53.54 
 
 		 301 aa  299  3e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3472  MarR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 326 aa  240  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 307 aa  239  5e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3178  GCN5-related N-acetyltransferase  63.22 
 
 		 173 aa  216  5e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4827  acetyltransferase  64.56 
 
 		 167 aa  209  5e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4512  acetyltransferase  63.92 
 
 		 167 aa  208  9e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0128967  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0376  GCN5-related N-acetyltransferase  63.64 
 
 		 167 aa  206  5e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  61.69 
 
 		 167 aa  205  8e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0755  GCN5-related N-acetyltransferase  66.24 
 
 		 170 aa  205  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0559  GCN5-related N-acetyltransferase  59.49 
 
 		 177 aa  197  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.518435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4858  GNAT family acetyltransferase  66.23 
 
 		 167 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.723134 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4822  acetyltransferase, gnat family  66.23 
 
 		 167 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4729  acetyltransferase, gnat family  66.23 
 
 		 167 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.900741  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4759  acetyltransferase, gnat family  66.23 
 
 		 167 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4044  acetyltransferase  59.35 
 
 		 167 aa  192  7e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4878  GNAT family acetyltransferase  65.58 
 
 		 167 aa  192  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3546  acetyltransferase  59.35 
 
 		 167 aa  192  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3682  GCN5-related N-acetyltransferase  58.71 
 
 		 167 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.98699  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3727  GCN5-related N-acetyltransferase  55.56 
 
 		 167 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  63.64 
 
 		 172 aa  186  6e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3756  GCN5-related N-acetyltransferase  65.82 
 
 		 167 aa  183  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3741  GCN5-related N-acetyltransferase  65.19 
 
 		 167 aa  182  7e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4736  acetyltransferase  65.19 
 
 		 167 aa  182  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal  0.688624 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04122  predicted acetyltransferase  65.82 
 
 		 167 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5777  acetyltransferase, GNAT family  65.82 
 
 		 167 aa  181  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04086  hypothetical protein  65.82 
 
 		 167 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3564  GCN5-related N-acetyltransferase  57.59 
 
 		 167 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5056  GCN5-related N-acetyltransferase  43.23 
 
 		 161 aa  132  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12708  putative acetyltransferase  41.14 
 
 		 163 aa  129  6e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0840  hypothetical protein  42.28 
 
 		 161 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581009  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2487  acetyltransferase  38.61 
 
 		 160 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184909  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2005  acetyltransferase  44.97 
 
 		 162 aa  121  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.145505  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1054  putative acetyltransferase  37.5 
 
 		 164 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6761  GCN5-related N-acetyltransferase  39.49 
 
 		 161 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  27.62 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 326 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 326 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 326 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 336 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1339  acetyltransferase  39.38 
 
 		 157 aa  98.6  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 326 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 325 aa  96.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2177  GCN5-related N-acetyltransferase  38.13 
 
 		 159 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2239  GCN5-related N-acetyltransferase  38.13 
 
 		 159 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 321 aa  92.8  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  26.88 
 
 		 319 aa  92.4  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  27.24 
 
 		 319 aa  91.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  24.38 
 
 		 306 aa  91.7  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3992  GCN5-related N-acetyltransferase  38.81 
 
 		 161 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0146762 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.87 
 
 		 312 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5167  MarR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 314 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0893639  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 329 aa  89.4  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2874  hypothetical protein  25.48 
 
 		 313 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1792  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 		 169 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184846  normal  0.722227 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 305 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 307 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0913  N-acetyltransferase-like  35.51 
 
 		 164 aa  85.5  9e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.981182 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25.62 
 
 		 325 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3019  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 316 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4525  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2507  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.05 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.79 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.688792 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2471  MarR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.536093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0977  GCN5-related N-acetyltransferase  35.46 
 
 		 160 aa  80.5  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00779954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4364  MarR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258723  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2224  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25.68 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3717  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  22.38 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  24.91 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25.57 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.673835  normal  0.26689 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  24.01 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0291  MarR family transcriptional regulator  22.76 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0978  MarR family transcriptional regulator  23.19 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.154037  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0154  MarR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 324 aa  72.4  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372672  normal  0.054252 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 		 150 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  24.64 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2134  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  22.6 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5296  MarR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2501  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25.17 
 
 		 289 aa  67  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  29.58 
 
 		 151 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  29.58 
 
 		 151 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1745  MarR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550965  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>