212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2761 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  100 
 
 
305 aa  620  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.688792 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2507  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  89.84 
 
 
305 aa  560  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  50.34 
 
 
314 aa  292  5e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  47.33 
 
 
309 aa  291  9e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  46.82 
 
 
312 aa  279  3e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  46.82 
 
 
326 aa  275  7e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3019  MarR family transcriptional regulator  46.36 
 
 
316 aa  272  4.0000000000000004e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  47.16 
 
 
307 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4364  MarR family transcriptional regulator  46.05 
 
 
308 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258723  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5167  MarR family transcriptional regulator  46.05 
 
 
314 aa  261  8e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0893639  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  41.28 
 
 
305 aa  245  8e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4525  MarR family transcriptional regulator  43.29 
 
 
315 aa  243  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2224  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  43.18 
 
 
320 aa  242  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  40.73 
 
 
310 aa  242  7e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3717  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  41.67 
 
 
310 aa  238  8e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  43.67 
 
 
309 aa  233  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2753  MarR family transcriptional regulator  41.14 
 
 
299 aa  229  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  41.2 
 
 
304 aa  228  9e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0978  MarR family transcriptional regulator  40.67 
 
 
310 aa  227  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.154037  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0291  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 
307 aa  210  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2134  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  39.75 
 
 
322 aa  210  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4157  MarR family transcriptional regulator  34.9 
 
 
308 aa  195  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.963186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2115  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  40.13 
 
 
317 aa  193  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0559  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  33.56 
 
 
308 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  34.01 
 
 
306 aa  188  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0779  transcriptional regulator  35.2 
 
 
318 aa  159  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119696  normal  0.0560901 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4388  GCN5-related N-acetyltransferase  50.34 
 
 
163 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0210  GCN5-related N-acetyltransferase  46.54 
 
 
162 aa  146  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.312763 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3649  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.29 
 
 
311 aa  135  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00196269  normal  0.251982 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  29.68 
 
 
325 aa  123  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.06 
 
 
325 aa  116  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  28.25 
 
 
321 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2874  hypothetical protein  27.69 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
336 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  26.58 
 
 
329 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0752  acetyltransferase  39.6 
 
 
161 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2409  GCN5-related N-acetyltransferase  39.6 
 
 
161 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  27.65 
 
 
326 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  27.65 
 
 
326 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  27.65 
 
 
326 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2651  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 
143 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2471  MarR family transcriptional regulator  26.35 
 
 
321 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.536093  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1745  MarR family transcriptional regulator  31.6 
 
 
291 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550965  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
326 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  37.24 
 
 
161 aa  99.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.036557 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  30.93 
 
 
290 aa  99  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5296  MarR family transcriptional regulator  24.92 
 
 
337 aa  97.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2529  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.41 
 
 
291 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0971  MarR family transcriptional regulator  30.72 
 
 
291 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  36.03 
 
 
166 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.499326  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5800  Peptidyl-dipeptidase Dcp  31.88 
 
 
848 aa  86.7  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.882586 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2501  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.5 
 
 
289 aa  85.1  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8209  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.02 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2004  transcriptional regulator  32.62 
 
 
142 aa  82  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.112591  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  25.52 
 
 
320 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 
322 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2226  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.76 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326568  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  25.75 
 
 
352 aa  79  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  28.86 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
326 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 
309 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
340 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.45 
 
 
349 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3472  MarR family transcriptional regulator  25.82 
 
 
326 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  26.07 
 
 
349 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5083  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25 
 
 
294 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.569191  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  23.95 
 
 
283 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 
347 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0349  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
189 aa  67  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000326393 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  23.72 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  23.65 
 
 
319 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  23.99 
 
 
319 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  24.37 
 
 
313 aa  62  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2131  GCN5-related N-acetyltransferase  26.25 
 
 
162 aa  60.8  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.649673  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0402  GCN5-related N-acetyltransferase  27.75 
 
 
196 aa  58.9  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  26.35 
 
 
312 aa  58.5  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 
159 aa  57.4  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0267  GCN5-related N-acetyltransferase  31.43 
 
 
162 aa  57  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0284  GCN5-related N-acetyltransferase  30.65 
 
 
171 aa  56.2  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00100588  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2487  acetyltransferase  39.68 
 
 
160 aa  55.8  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184909  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0289  GCN5-related N-acetyltransferase  30.65 
 
 
171 aa  55.8  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000757903 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4186  GCN5-related N-acetyltransferase  31.51 
 
 
168 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1344  GCN5-related N-acetyltransferase  34.51 
 
 
167 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000016688 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0188  putative acetyltransferase  33.88 
 
 
169 aa  53.5  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340862  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1301  GCN5-related N-acetyltransferase  38.3 
 
 
167 aa  52.8  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0231275  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3178  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
173 aa  52.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
159 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 
153 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12708  putative acetyltransferase  31.08 
 
 
163 aa  51.6  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
156 aa  50.4  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 
141 aa  50.8  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1363  GCN5-related N-acetyltransferase  31.39 
 
 
222 aa  50.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  30.77 
 
 
153 aa  49.7  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  34.19 
 
 
153 aa  49.7  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0840  hypothetical protein  29.47 
 
 
161 aa  49.3  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581009  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 
145 aa  49.3  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
165 aa  48.9  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>