More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2652 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 166 aa  340  7e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.499326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5800  Peptidyl-dipeptidase Dcp  55.7 
 
 		 848 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.882586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  38.51 
 
 		 306 aa  139  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3649  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  42.07 
 
 		 311 aa  137  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00196269  normal  0.251982 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2224  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  39.07 
 
 		 320 aa  117  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3019  MarR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 316 aa  110  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4525  MarR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 315 aa  108  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 314 aa  103  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 305 aa  101  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  37.27 
 
 		 309 aa  99.4  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5296  MarR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 337 aa  97.4  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4364  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 308 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258723  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4388  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 163 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2753  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 299 aa  95.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0779  transcriptional regulator  33.54 
 
 		 318 aa  95.5  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119696  normal  0.0560901 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 		 161 aa  94  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.036557 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 307 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0210  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 		 162 aa  92.4  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.312763 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  33.33 
 
 		 312 aa  90.9  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2874  hypothetical protein  31.85 
 
 		 313 aa  90.5  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0752  acetyltransferase  29.45 
 
 		 161 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2409  GCN5-related N-acetyltransferase  29.45 
 
 		 161 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2134  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.88 
 
 		 322 aa  89.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  31.33 
 
 		 304 aa  89.4  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 326 aa  88.2  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  36.03 
 
 		 305 aa  87.8  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.688792 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  32.67 
 
 		 326 aa  87.8  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 326 aa  87.8  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 326 aa  87.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 326 aa  87.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2507  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  33.56 
 
 		 305 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 329 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3717  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  31.37 
 
 		 310 aa  84.3  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5167  MarR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0893639  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  31.97 
 
 		 325 aa  82.4  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0978  MarR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 310 aa  81.6  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.154037  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 325 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2471  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.536093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 310 aa  78.6  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 326 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2115  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  31.54 
 
 		 317 aa  67.8  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0559  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  23.33 
 
 		 308 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0291  MarR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 307 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.95 
 
 		 156 aa  67  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4157  MarR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.963186 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2487  acetyltransferase  38.46 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184909  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 320 aa  57.4  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0867  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.21 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2131  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.649673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2394  GCN5-related N-acetyltransferase  32.61 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000199537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1301  GCN5-related N-acetyltransferase  27.15 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0231275  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1389  GCN5-related N-acetyltransferase  28.26 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00377993  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1314  GCN5-related N-acetyltransferase  30.93 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3917  GCN5-related N-acetyltransferase  27.08 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  39.02 
 
 		 349 aa  54.3  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  35.16 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 340 aa  54.3  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0758  putative acetyltransferase  29.09 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2711  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.695476  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 322 aa  53.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64320  hypothetical protein  31.25 
 
 		 150 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.161713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0486  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 		 270 aa  52.4  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.636948 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  28.67 
 
 		 312 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 349 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0325  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 		 156 aa  52  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0755  GCN5-related N-acetyltransferase  31.86 
 
 		 170 aa  52  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0994  putative acetyltransferase  28.18 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0768  GCN5-related N-acetyltransferase  26.8 
 
 		 155 aa  51.6  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633559 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1763  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.2 
 
 		 138 aa  51.6  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  28.03 
 
 		 283 aa  51.6  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 347 aa  51.6  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12708  putative acetyltransferase  31.36 
 
 		 163 aa  51.2  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0813  GCN5-related N-acetyltransferase  40.91 
 
 		 210 aa  50.8  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3472  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 326 aa  50.8  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5584  hypothetical protein  29.7 
 
 		 150 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3289  putative acetyltransferase  26.85 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.834546  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2616  GCN5-related N-acetyltransferase  33.65 
 
 		 367 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.719016  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 313 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3701  GCN5-related N-acetyltransferase  25.17 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1054  putative acetyltransferase  34.21 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0460  putative acetyltransferase  29.47 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0559  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.518435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4177  GCN5-related N-acetyltransferase  28.18 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.9061 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3210  putative acetyltransferase  27.78 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3450  GCN5-related N-acetyltransferase  25.74 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0546  amino acid adenylation domain-containing protein  33.33 
 
 		 2151 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0028  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0376  GCN5-related N-acetyltransferase  34.07 
 
 		 167 aa  49.3  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0895  hypothetical protein  26.81 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3178  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 173 aa  48.9  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1457  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 		 283 aa  48.9  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.715432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3727  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 167 aa  48.5  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3992  GCN5-related N-acetyltransferase  32.98 
 
 		 161 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0146762 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0913  N-acetyltransferase-like  26.38 
 
 		 164 aa  48.1  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.981182 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2373  GCN5-related N-acetyltransferase  35.63 
 
 		 162 aa  48.1  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.86437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>