206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4388 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4388  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 163 aa  328  2e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 314 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4525  MarR family transcriptional regulator  59.33 
 
 		 315 aa  180  7e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  55.63 
 
 		 304 aa  178  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2753  MarR family transcriptional regulator  59.87 
 
 		 299 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  54.3 
 
 		 312 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  55.78 
 
 		 305 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3019  MarR family transcriptional regulator  52.7 
 
 		 316 aa  171  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2224  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  52.8 
 
 		 320 aa  169  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1078  MarR family transcriptional regulator  51.66 
 
 		 307 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.273595 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4364  MarR family transcriptional regulator  52.98 
 
 		 308 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258723  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  51.3 
 
 		 326 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5167  MarR family transcriptional regulator  53.59 
 
 		 314 aa  162  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0893639  normal  0.0785126 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  51.32 
 
 		 309 aa  161  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 309 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3717  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  52.38 
 
 		 310 aa  159  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 310 aa  155  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2134  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  54.19 
 
 		 322 aa  155  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  50.34 
 
 		 305 aa  154  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.688792 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2507  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  48.3 
 
 		 305 aa  146  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0210  GCN5-related N-acetyltransferase  44.03 
 
 		 162 aa  137  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.312763 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4157  MarR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 308 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.963186 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0978  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 310 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.154037  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  41.1 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.036557 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0779  transcriptional regulator  40.85 
 
 		 318 aa  122  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119696  normal  0.0560901 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0559  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  39.19 
 
 		 308 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0752  acetyltransferase  36.3 
 
 		 161 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2409  GCN5-related N-acetyltransferase  36.3 
 
 		 161 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.999952 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0291  MarR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2115  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  37.82 
 
 		 317 aa  99  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 166 aa  95.9  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.499326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  29.14 
 
 		 306 aa  96.3  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5800  Peptidyl-dipeptidase Dcp  29.68 
 
 		 848 aa  82.4  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.882586 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2471  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 321 aa  78.2  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.536093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5296  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 337 aa  77.4  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 326 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 326 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 326 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 336 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2874  hypothetical protein  30.07 
 
 		 313 aa  73.9  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3649  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25.16 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00196269  normal  0.251982 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2131  GCN5-related N-acetyltransferase  31.9 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.649673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 326 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 329 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  35.06 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 325 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 321 aa  67  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1275  GCN5-related N-acetyltransferase  32.68 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0349  GCN5-related N-acetyltransferase  33.85 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000326393 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5056  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3784  GCN5-related N-acetyltransferase  36.97 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.316492  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0402  GCN5-related N-acetyltransferase  33.61 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1952  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 		 192 aa  57  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.941364 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0267  GCN5-related N-acetyltransferase  32.81 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3646  GCN5-related N-acetyltransferase  33.7 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0284  GCN5-related N-acetyltransferase  32.58 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00100588  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0289  GCN5-related N-acetyltransferase  32.58 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000757903 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12708  putative acetyltransferase  35.48 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1389  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 212 aa  52.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00377993  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3701  GCN5-related N-acetyltransferase  36.71 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3318  GCN5-related N-acetyltransferase  33.58 
 
 		 157 aa  52.4  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859673 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1363  GCN5-related N-acetyltransferase  35.64 
 
 		 222 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2123  GCN5-related N-acetyltransferase  30.91 
 
 		 148 aa  52  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4902  GCN5-related N-acetyltransferase  30.66 
 
 		 195 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185466  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0376  GCN5-related N-acetyltransferase  33.05 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2487  acetyltransferase  31.46 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184909  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1239  GCN5-related N-acetyltransferase  32.67 
 
 		 153 aa  50.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3572  GCN5-related N-acetyltransferase  30.82 
 
 		 283 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0214  GCN5-related N-acetyltransferase  32.54 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.159498 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01922  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  35.14 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0828281  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3682  GCN5-related N-acetyltransferase  32.76 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.98699  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0731  Carbonate dehydratase  35.65 
 
 		 380 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5083  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.84 
 
 		 294 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.569191  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4044  acetyltransferase  32.76 
 
 		 167 aa  48.9  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3546  acetyltransferase  32.76 
 
 		 167 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1171  GCN5-related N-acetyltransferase  45.9 
 
 		 283 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3535  GCN5-related N-acetyltransferase  34.15 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0151129 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3801  GCN5-related N-acetyltransferase  27.34 
 
 		 172 aa  48.5  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.54281  decreased coverage  0.000138892 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4186  GCN5-related N-acetyltransferase  39.68 
 
 		 168 aa  48.5  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3711  GCN5-related N-acetyltransferase  48.28 
 
 		 167 aa  48.5  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4092  GCN5-related N-acetyltransferase  37.8 
 
 		 167 aa  48.5  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4203  GCN5-related N-acetyltransferase  32.63 
 
 		 160 aa  47.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.814573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0971  MarR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 291 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0639  GCN5-related N-acetyltransferase  32.77 
 
 		 163 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2529  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  33.33 
 
 		 291 aa  47.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 340 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 347 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0935  acetyltransferase  37.68 
 
 		 173 aa  47.4  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000592178  normal  0.287398 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1709  GCN5-related N-acetyltransferase  34.83 
 
 		 165 aa  47.4  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.674932  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0598  GCN5-related N-acetyltransferase  31.54 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.408696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0475  GCN5-related N-acetyltransferase  27.56 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.207035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0755  GCN5-related N-acetyltransferase  32.1 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1314  GCN5-related N-acetyltransferase  34.52 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2106  GCN5-related N-acetyltransferase  28.78 
 
 		 327 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115072 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1054  putative acetyltransferase  36.07 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5388  GCN5-related N-acetyltransferase  28.26 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.395987 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4898  GCN5-related N-acetyltransferase  28.26 
 
 		 197 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  31.16 
 
 		 312 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0188  putative acetyltransferase  33.61 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340862  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>