86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3572 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3572  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
283 aa  556  1e-157  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1171  GCN5-related N-acetyltransferase  88.34 
 
 
283 aa  499  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1521  GCN5-related N-acetyltransferase  65.23 
 
 
280 aa  370  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.76241  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7759  GCN5-related N-acetyltransferase  64.29 
 
 
286 aa  345  7e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1043  GCN5-related N-acetyltransferase  60.58 
 
 
294 aa  328  8e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0110092 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0751  hypothetical protein  60.22 
 
 
280 aa  320  9.999999999999999e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3615  GCN5-related N-acetyltransferase  59.86 
 
 
277 aa  315  6e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1967  acetyltransferase-like protein  57.35 
 
 
280 aa  314  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3368  GCN5-related N-acetyltransferase  58.42 
 
 
282 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00536144  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10010  predicted acyltransferase  52.67 
 
 
282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.516107  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5887  GCN5-related N-acetyltransferase  54.42 
 
 
284 aa  267  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3972  GCN5-related N-acetyltransferase  59.42 
 
 
292 aa  262  6e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.562302  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1430  GCN5-related N-acetyltransferase  52.48 
 
 
291 aa  257  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.934568 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2120  GCN5-related N-acetyltransferase  52.22 
 
 
278 aa  245  4.9999999999999997e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.210858  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23510  predicted acyltransferase  50.54 
 
 
294 aa  243  3e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.823988  normal  0.0338808 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2497  GCN5-related protein N-acetyltransferase  52.71 
 
 
289 aa  241  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455734  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3198  GCN5-related N-acetyltransferase  47.62 
 
 
281 aa  231  7.000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1353  GCN5-related N-acetyltransferase  47.65 
 
 
279 aa  229  5e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1502  GCN5-related N-acetyltransferase  48.61 
 
 
300 aa  229  5e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1203  GCN5-related N-acetyltransferase  51.03 
 
 
310 aa  229  6e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1685  GCN5-related N-acetyltransferase  48.21 
 
 
277 aa  224  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0171402  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1310  GCN5-related N-acetyltransferase  46.93 
 
 
279 aa  223  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0605973 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2186  GCN5-related N-acetyltransferase  45.2 
 
 
278 aa  217  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0322958  hitchhiker  0.00131223 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1405  GCN5-related N-acetyltransferase  46.91 
 
 
295 aa  217  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.72524  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1417  GCN5-related N-acetyltransferase  45.82 
 
 
296 aa  210  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000286063 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12883  hypothetical protein  47.39 
 
 
284 aa  208  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4080  GCN5-related N-acetyltransferase  47.14 
 
 
284 aa  198  7.999999999999999e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2263  GCN5-related N-acetyltransferase  48.34 
 
 
287 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0309855  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2091  GCN5-related N-acetyltransferase  46.29 
 
 
284 aa  195  7e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.440051 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2028  GCN5-related N-acetyltransferase  46.29 
 
 
284 aa  195  7e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.15014 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2045  GCN5-related N-acetyltransferase  46.29 
 
 
284 aa  195  7e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1014  GCN5-related N-acetyltransferase  40.2 
 
 
299 aa  194  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10230  predicted acyltransferase  45.65 
 
 
291 aa  191  8e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11380  predicted acyltransferase  41.81 
 
 
294 aa  182  6e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0373363  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06950  predicted acyltransferase  41.88 
 
 
310 aa  143  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.246585  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3070  GCN5-related N-acetyltransferase  24.65 
 
 
287 aa  52.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4388  GCN5-related N-acetyltransferase  30.82 
 
 
163 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1052  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.4 
 
 
304 aa  49.7  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0668577  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3266  GCN5-related N-acetyltransferase  30.5 
 
 
158 aa  49.3  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06850  acetyltransferase  39.66 
 
 
154 aa  49.3  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7336  acetyltransferase-like protein  31.33 
 
 
273 aa  48.9  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2524  hypothetical protein  41.56 
 
 
167 aa  48.9  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.210905 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
314 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0132  GCN5-related N-acetyltransferase  39.34 
 
 
146 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3222  GCN5-related N-acetyltransferase  42.62 
 
 
168 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.510558  normal  0.172445 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  28.38 
 
 
309 aa  47.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0120  hypothetical protein  29.88 
 
 
164 aa  46.6  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.856496 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.77 
 
 
312 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6192  GCN5-related N-acetyltransferase  36.62 
 
 
144 aa  46.6  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0032  GCN5-related N-acetyltransferase  28.46 
 
 
160 aa  46.2  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4251  Histone acetyl transferase protein  37.5 
 
 
150 aa  45.8  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5125  GCN5-related N-acetyltransferase  29.45 
 
 
158 aa  45.8  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2541  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
273 aa  45.8  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0234  GCN5-related N-acetyltransferase  31.87 
 
 
229 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.149769  normal  0.204982 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0023  acetyltransferase  30.25 
 
 
298 aa  44.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4525  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
315 aa  44.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0371  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.65 
 
 
167 aa  44.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4903  GCN5-related N-acetyltransferase  44.78 
 
 
168 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.322687 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3736  GCN5-related N-acetyltransferase  37.63 
 
 
252 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.944087  normal  0.406505 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4235  GCN5-related N-acetyltransferase  39.68 
 
 
162 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.815435  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0451  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  38.57 
 
 
295 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.237261  normal  0.21321 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0028  GCN5-related N-acetyltransferase  40.24 
 
 
147 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.578829 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0035  GCN5-related N-acetyltransferase  40.91 
 
 
176 aa  44.3  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  26.43 
 
 
312 aa  43.9  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1694  acetyltransferase  32.39 
 
 
157 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0193  putative acetyltransferase  27.86 
 
 
153 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0628  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.79 
 
 
195 aa  43.5  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.313725  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0449  GCN5-related N-acetyltransferase  30.15 
 
 
182 aa  43.5  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22560  predicted acyltransferase  39.39 
 
 
105 aa  43.5  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  24.52 
 
 
309 aa  43.5  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3051  GCN5-related N-acetyltransferase  37.14 
 
 
292 aa  43.5  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18900  acetyltransferase  40.98 
 
 
274 aa  43.5  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00834372  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5452  GCN5-related N-acetyltransferase  43.28 
 
 
168 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.522841  normal  0.579049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5047  GCN5-related N-acetyltransferase  40.3 
 
 
175 aa  43.5  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.608856  normal  0.868904 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7075  GCN5-related N-acetyltransferase  27.14 
 
 
153 aa  43.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0288  GCN5-related N-acetyltransferase  27.5 
 
 
160 aa  43.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0893  hypothetical protein  40 
 
 
337 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1733  acetyltransferase, GNAT family  33.8 
 
 
157 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000523581  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0047  hypothetical protein  36.92 
 
 
292 aa  43.1  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2753  MarR family transcriptional regulator  27.7 
 
 
299 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3935  GCN5-related N-acetyltransferase  36.26 
 
 
158 aa  43.1  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0049  hypothetical protein  36.92 
 
 
292 aa  42.7  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0355  GCN5-related N-acetyltransferase  26.8 
 
 
231 aa  42.7  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19270  sortase-like acyltransferase  48.53 
 
 
160 aa  42.4  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.426501  normal  0.456867 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1445  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.8 
 
 
157 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0669  GCN5-related N-acetyltransferase  27.64 
 
 
154 aa  42  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>