74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3972 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3972  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
292 aa  560  1.0000000000000001e-159  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.562302  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1521  GCN5-related N-acetyltransferase  60.14 
 
 
280 aa  315  6e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.76241  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7759  GCN5-related N-acetyltransferase  58.84 
 
 
286 aa  306  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1171  GCN5-related N-acetyltransferase  60.14 
 
 
283 aa  302  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1967  acetyltransferase-like protein  56.83 
 
 
280 aa  296  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1043  GCN5-related N-acetyltransferase  56.12 
 
 
294 aa  294  1e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0110092 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3615  GCN5-related N-acetyltransferase  57.61 
 
 
277 aa  287  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10010  predicted acyltransferase  54.48 
 
 
282 aa  286  4e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.516107  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3572  GCN5-related N-acetyltransferase  59.42 
 
 
283 aa  283  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0751  hypothetical protein  55.07 
 
 
280 aa  275  9e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3368  GCN5-related N-acetyltransferase  55.07 
 
 
282 aa  268  8.999999999999999e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00536144  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5887  GCN5-related N-acetyltransferase  54.45 
 
 
284 aa  264  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1353  GCN5-related N-acetyltransferase  52.05 
 
 
279 aa  242  6e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1310  GCN5-related N-acetyltransferase  51.71 
 
 
279 aa  239  5.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0605973 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2186  GCN5-related N-acetyltransferase  50.9 
 
 
278 aa  238  5.999999999999999e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0322958  hitchhiker  0.00131223 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2120  GCN5-related N-acetyltransferase  49.26 
 
 
278 aa  231  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.210858  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1430  GCN5-related N-acetyltransferase  50.18 
 
 
291 aa  223  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.934568 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1685  GCN5-related N-acetyltransferase  47.78 
 
 
277 aa  219  5e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0171402  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1502  GCN5-related N-acetyltransferase  46.82 
 
 
300 aa  216  5e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23510  predicted acyltransferase  47.7 
 
 
294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.823988  normal  0.0338808 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2497  GCN5-related protein N-acetyltransferase  49.12 
 
 
289 aa  212  4.9999999999999996e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455734  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3198  GCN5-related N-acetyltransferase  46.74 
 
 
281 aa  211  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2263  GCN5-related N-acetyltransferase  50.18 
 
 
287 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0309855  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4080  GCN5-related N-acetyltransferase  47.39 
 
 
284 aa  203  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2028  GCN5-related N-acetyltransferase  48.54 
 
 
284 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.15014 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2045  GCN5-related N-acetyltransferase  48.54 
 
 
284 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2091  GCN5-related N-acetyltransferase  48.54 
 
 
284 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.440051 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12883  hypothetical protein  49.82 
 
 
284 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1405  GCN5-related N-acetyltransferase  44.96 
 
 
295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.72524  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10230  predicted acyltransferase  47.1 
 
 
291 aa  194  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1417  GCN5-related N-acetyltransferase  45.07 
 
 
296 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000286063 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1203  GCN5-related N-acetyltransferase  46.74 
 
 
310 aa  190  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1014  GCN5-related N-acetyltransferase  38.77 
 
 
299 aa  176  4e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11380  predicted acyltransferase  41.14 
 
 
294 aa  172  5e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0373363  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06950  predicted acyltransferase  46.35 
 
 
310 aa  135  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.246585  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22560  predicted acyltransferase  45 
 
 
105 aa  51.2  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0035  GCN5-related N-acetyltransferase  40.91 
 
 
176 aa  48.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4235  GCN5-related N-acetyltransferase  43.86 
 
 
162 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.815435  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12708  putative acetyltransferase  31.94 
 
 
163 aa  47.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2877  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  42.11 
 
 
165 aa  47.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.199566  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0613  hypothetical protein  41.27 
 
 
170 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19270  sortase-like acyltransferase  44.93 
 
 
160 aa  47  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.426501  normal  0.456867 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0813  putative acetyltransferase  45.16 
 
 
161 aa  46.2  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.425962  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0987  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  42.11 
 
 
150 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.229607  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1840  GCN5-related N-acetyltransferase  37.23 
 
 
369 aa  46.2  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.422252  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
314 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07340  predicted acyltransferase  36.67 
 
 
161 aa  45.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.633713  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2409  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
143 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06850  acetyltransferase  36.21 
 
 
154 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1160  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  42.11 
 
 
162 aa  43.9  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2524  hypothetical protein  41.67 
 
 
167 aa  43.9  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.210905 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0234  GCN5-related N-acetyltransferase  42.11 
 
 
229 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.149769  normal  0.204982 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  25.49 
 
 
309 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3209  GCN5-related N-acetyltransferase  37.36 
 
 
150 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.675647  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  27.66 
 
 
326 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0701  GCN5-related N-acetyltransferase  38.6 
 
 
230 aa  43.5  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000510917 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0983  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  40.35 
 
 
150 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.570176  normal  0.0327101 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1810  GCN5-related N-acetyltransferase  46.43 
 
 
251 aa  43.5  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000508978  normal  0.534907 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0666  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
186 aa  43.5  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0127  hypothetical protein  23.03 
 
 
391 aa  43.1  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3070  GCN5-related N-acetyltransferase  27.32 
 
 
287 aa  43.5  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0798  GCN5-related N-acetyltransferase  42.19 
 
 
174 aa  43.1  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.631657  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1811  acetyltransferase  44.83 
 
 
169 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0625  GCN5-related N-acetyltransferase  45 
 
 
195 aa  43.1  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0094  GCN5-related N-acetyltransferase  42.11 
 
 
180 aa  42.7  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22184  normal  0.0577704 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1041  GCN5-related N-acetyltransferase  44.44 
 
 
200 aa  42.7  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0696041  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3837  GCN5-related N-acetyltransferase  39.34 
 
 
166 aa  42.7  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000098197 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1897  putative acetyltransferase protein  44.83 
 
 
187 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.385143  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.15 
 
 
148 aa  42.4  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.967932  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0628  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.81 
 
 
195 aa  42.7  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.313725  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  27.21 
 
 
309 aa  42.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3977  acetyltransferase  39.29 
 
 
267 aa  42.4  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2396  GCN5-related N-acetyltransferase  41.33 
 
 
254 aa  42.4  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.672343  normal  0.631296 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5144  Phosphinothricin acetyltransferase  34.38 
 
 
170 aa  42.4  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324669  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>