252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4251 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_4251  Histone acetyl transferase protein  100 
 
 
150 aa  308  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2652  putative acetyltransferase  58 
 
 
150 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1310  GCN5-related N-acetyltransferase  58 
 
 
150 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.939241  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1190  GCN5-related N-acetyltransferase  56 
 
 
150 aa  174  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.806576 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1882  putative acetyltransferase  59.03 
 
 
152 aa  164  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0785639  normal  0.209526 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5119  GCN5-related N-acetyltransferase  47.62 
 
 
148 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000288207  normal  0.236457 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5393  GCN5-related N-acetyltransferase  47.3 
 
 
148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.650664  hitchhiker  0.00916992 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5785  GCN5-related N-acetyltransferase  47.65 
 
 
400 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316473  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3849  GCN5-related N-acetyltransferase  47.65 
 
 
414 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156281  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4519  GCN5-related N-acetyltransferase  47.65 
 
 
414 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20129  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1329  GCN5-related N-acetyltransferase  47.62 
 
 
414 aa  137  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4135  GCN5-related N-acetyltransferase  47.65 
 
 
399 aa  136  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0441895  normal  0.143629 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0132  GCN5-related N-acetyltransferase  47.22 
 
 
146 aa  134  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5635  GCN5-related N-acetyltransferase  43.92 
 
 
148 aa  134  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0013842  normal  0.201231 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5344  acetyltransferase  46.94 
 
 
148 aa  133  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00407792 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5253  GCN5-related N-acetyltransferase  46.94 
 
 
148 aa  133  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4414  GCN5-related N-acetyltransferase  46.31 
 
 
413 aa  133  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0279389  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1141  GCN5-related N-acetyltransferase  46.67 
 
 
149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.884922 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0549  GCN5-related N-acetyltransferase  47.26 
 
 
146 aa  131  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5506  acetyltransferase, GNAT family  44.59 
 
 
148 aa  130  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3951  GCN5-related N-acetyltransferase  44.97 
 
 
413 aa  130  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2165  GCN5-related N-acetyltransferase  47.92 
 
 
148 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0161004  normal  0.0731596 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2683  GCN5-related N-acetyltransferase  46.62 
 
 
149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.454456  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1954  GCN5-related N-acetyltransferase  47.62 
 
 
148 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0219812  normal  0.336797 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2044  GCN5-related N-acetyltransferase  45.39 
 
 
153 aa  126  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.624808  normal  0.277662 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5058  GCN5-related N-acetyltransferase  44.59 
 
 
148 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153522  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2583  GCN5-related N-acetyltransferase  47.02 
 
 
151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0675931  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0310  GCN5-related N-acetyltransferase  44.67 
 
 
154 aa  124  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132707  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0836  GCN5-related N-acetyltransferase  41.61 
 
 
158 aa  122  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5176  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  45.86 
 
 
335 aa  121  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.472651 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0193  putative acetyltransferase  44.81 
 
 
153 aa  121  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71690  GNAT family acetyltransferase  42 
 
 
149 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2785  GCN5-related N-acetyltransferase  43.06 
 
 
147 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4438  GCN5-related N-acetyltransferase  46.75 
 
 
153 aa  120  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2696  GCN5-related N-acetyltransferase  49.66 
 
 
148 aa  120  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.771243  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6220  putative acetyltransferase  41.33 
 
 
149 aa  120  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3262  GCN5-related N-acetyltransferase  49.31 
 
 
148 aa  120  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3851  GCN5-related N-acetyltransferase  44.97 
 
 
154 aa  119  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.619468  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1796  putative histone acetyltransferase (HAT)  41.61 
 
 
148 aa  117  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1109  GCN5-related N-acetyltransferase  42.28 
 
 
152 aa  117  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7075  GCN5-related N-acetyltransferase  41.56 
 
 
153 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2964  GCN5-related N-acetyltransferase  43.45 
 
 
147 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2018  GCN5-related N-acetyltransferase  38.26 
 
 
150 aa  114  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406329  normal  0.262902 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5125  GCN5-related N-acetyltransferase  44.67 
 
 
158 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4515  GCN5-related N-acetyltransferase  41.83 
 
 
155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4647  GCN5-related N-acetyltransferase  41.83 
 
 
155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20803  normal  0.0229692 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3266  GCN5-related N-acetyltransferase  44.67 
 
 
158 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3956  GCN5-related N-acetyltransferase  40.85 
 
 
402 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0442969 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0194  GCN5-related N-acetyltransferase  39.61 
 
 
153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0137  GCN5-related N-acetyltransferase  40.41 
 
 
147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09990  putative acetyltransferase  43.06 
 
 
152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0175715  normal  0.714198 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4113  GCN5-related N-acetyltransferase  42.58 
 
 
158 aa  110  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3514  GCN5-related N-acetyltransferase  38.93 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3664  GCN5-related N-acetyltransferase  36 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.671996  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3469  GCN5-related N-acetyltransferase  46.58 
 
 
158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.293029  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3138  GCN5-related N-acetyltransferase  42.66 
 
 
145 aa  108  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.644467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2912  GCN5-related N-acetyltransferase  42.66 
 
 
145 aa  108  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.196361 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2497  GCN5-related N-acetyltransferase  38.73 
 
 
147 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12144  normal  0.087022 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0274  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6192  GCN5-related N-acetyltransferase  42.36 
 
 
144 aa  107  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0311  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
148 aa  105  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.126839  normal  0.150201 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2917  GCN5-related N-acetyltransferase  42 
 
 
158 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3002  GCN5-related N-acetyltransferase  38.56 
 
 
152 aa  105  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.533457  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3351  GCN5-related N-acetyltransferase  39.6 
 
 
152 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1024  GCN5-related N-acetyltransferase  39.6 
 
 
152 aa  103  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.643013  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0028  GCN5-related N-acetyltransferase  44.76 
 
 
147 aa  103  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.578829 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1012  GCN5-related N-acetyltransferase  40.15 
 
 
152 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0990  GCN5-related N-acetyltransferase  40.15 
 
 
152 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1633  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
147 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.499665  normal  0.357486 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2987  acetyltransferase  40 
 
 
147 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.82546  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1866  GCN5-related N-acetyltransferase  41.13 
 
 
147 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.990958 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1820  GCN5-related N-acetyltransferase  36.05 
 
 
148 aa  100  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.209618  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3458  GCN5-related N-acetyltransferase  39.07 
 
 
153 aa  96.3  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.229516  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2017  GCN5-related N-acetyltransferase  36.81 
 
 
146 aa  95.9  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059884  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4542  GCN5-related N-acetyltransferase  37.06 
 
 
149 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.3744 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2598  GCN5-related N-acetyltransferase  36.99 
 
 
154 aa  93.6  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4277  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
147 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.701884 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60277  N-acetyltransferase HPA3  33.55 
 
 
154 aa  90.1  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.751079  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3036  GCN5-related N-acetyltransferase  45 
 
 
84 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134438  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1461  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1031  GCN5-related N-acetyltransferase  32.85 
 
 
159 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5609  GCN5-related N-acetyltransferase  34.03 
 
 
163 aa  67.4  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.460517 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0005  GCN5-related N-acetyltransferase  32.39 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4148  GCN5-related N-acetyltransferase  32.39 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.674163 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2905  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
131 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.655717 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2124  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
159 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160054  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5735  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
165 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.77189  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02661  putative N-acetyltransferase  30.07 
 
 
162 aa  59.3  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.967011  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2432  GCN5-related N-acetyltransferase  34.29 
 
 
176 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1796  GCN5-related N-acetyltransferase  33.91 
 
 
195 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2408  GCN5-related N-acetyltransferase  33.91 
 
 
165 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0178488  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0414  GCN5-related N-acetyltransferase  33.82 
 
 
159 aa  57  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.808997 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2412  GCN5-related N-acetyltransferase  33.91 
 
 
165 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700134 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2318  GCN5-related N-acetyltransferase  33.91 
 
 
165 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253918  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0886  acetyltransferase  33.01 
 
 
165 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  33.91 
 
 
165 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00150599  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5816  acetyltransferase  34.48 
 
 
160 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294644  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4231  GCN5-related N-acetyltransferase  32.31 
 
 
159 aa  55.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2444  acetyltransferase, GNAT family  30.22 
 
 
161 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2838  GCN5-related N-acetyltransferase  33.57 
 
 
176 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>