243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2044 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_2044  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
153 aa  322  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.624808  normal  0.277662 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0194  GCN5-related N-acetyltransferase  66.89 
 
 
153 aa  224  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7075  GCN5-related N-acetyltransferase  64.9 
 
 
153 aa  216  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1796  putative histone acetyltransferase (HAT)  65.31 
 
 
148 aa  215  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4438  GCN5-related N-acetyltransferase  70.86 
 
 
153 aa  211  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0193  putative acetyltransferase  62.25 
 
 
153 aa  208  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3266  GCN5-related N-acetyltransferase  65.1 
 
 
158 aa  208  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2917  GCN5-related N-acetyltransferase  67.35 
 
 
158 aa  208  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4647  GCN5-related N-acetyltransferase  64.47 
 
 
155 aa  206  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20803  normal  0.0229692 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4515  GCN5-related N-acetyltransferase  64.47 
 
 
155 aa  206  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5125  GCN5-related N-acetyltransferase  63.76 
 
 
158 aa  202  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4113  GCN5-related N-acetyltransferase  62.5 
 
 
158 aa  202  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3851  GCN5-related N-acetyltransferase  62.91 
 
 
154 aa  199  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.619468  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3469  GCN5-related N-acetyltransferase  60.69 
 
 
158 aa  173  9e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.293029  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3956  GCN5-related N-acetyltransferase  55.1 
 
 
402 aa  165  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0442969 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1141  GCN5-related N-acetyltransferase  54.25 
 
 
149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.884922 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71690  GNAT family acetyltransferase  51.63 
 
 
149 aa  161  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0137  GCN5-related N-acetyltransferase  49.33 
 
 
147 aa  157  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5635  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
148 aa  156  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0013842  normal  0.201231 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6220  putative acetyltransferase  50.33 
 
 
149 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5176  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  48.34 
 
 
335 aa  155  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.472651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3262  GCN5-related N-acetyltransferase  54.67 
 
 
148 aa  151  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4135  GCN5-related N-acetyltransferase  52.03 
 
 
399 aa  150  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0441895  normal  0.143629 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0132  GCN5-related N-acetyltransferase  48.32 
 
 
146 aa  150  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5393  GCN5-related N-acetyltransferase  47.97 
 
 
148 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.650664  hitchhiker  0.00916992 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2696  GCN5-related N-acetyltransferase  54.42 
 
 
148 aa  148  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.771243  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1954  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
148 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0219812  normal  0.336797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5344  acetyltransferase  48.65 
 
 
148 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00407792 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5253  GCN5-related N-acetyltransferase  48.65 
 
 
148 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5058  GCN5-related N-acetyltransferase  48.67 
 
 
148 aa  147  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153522  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4414  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
413 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0279389  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2165  GCN5-related N-acetyltransferase  49.32 
 
 
148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0161004  normal  0.0731596 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3951  GCN5-related N-acetyltransferase  49.32 
 
 
413 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5506  acetyltransferase, GNAT family  44.67 
 
 
148 aa  144  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2785  GCN5-related N-acetyltransferase  48.98 
 
 
147 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3849  GCN5-related N-acetyltransferase  49.66 
 
 
414 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156281  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4519  GCN5-related N-acetyltransferase  49.66 
 
 
414 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20129  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5119  GCN5-related N-acetyltransferase  44.67 
 
 
148 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000288207  normal  0.236457 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5785  GCN5-related N-acetyltransferase  49.66 
 
 
400 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316473  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1329  GCN5-related N-acetyltransferase  49.66 
 
 
414 aa  142  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0310  GCN5-related N-acetyltransferase  45.75 
 
 
154 aa  142  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132707  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3664  GCN5-related N-acetyltransferase  44 
 
 
151 aa  140  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.671996  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3514  GCN5-related N-acetyltransferase  45.89 
 
 
152 aa  140  9e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3351  GCN5-related N-acetyltransferase  44.22 
 
 
152 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1012  GCN5-related N-acetyltransferase  44.22 
 
 
152 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0990  GCN5-related N-acetyltransferase  44.22 
 
 
152 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1024  GCN5-related N-acetyltransferase  43.54 
 
 
152 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.643013  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2964  GCN5-related N-acetyltransferase  46.94 
 
 
147 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2497  GCN5-related N-acetyltransferase  44.9 
 
 
147 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12144  normal  0.087022 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1109  GCN5-related N-acetyltransferase  46.05 
 
 
152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3002  GCN5-related N-acetyltransferase  44.97 
 
 
152 aa  132  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.533457  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09990  putative acetyltransferase  44.52 
 
 
152 aa  130  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0175715  normal  0.714198 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0836  GCN5-related N-acetyltransferase  41.22 
 
 
158 aa  127  7.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2598  GCN5-related N-acetyltransferase  44.3 
 
 
154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2652  putative acetyltransferase  45.16 
 
 
150 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1310  GCN5-related N-acetyltransferase  45.16 
 
 
150 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.939241  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1190  GCN5-related N-acetyltransferase  43.87 
 
 
150 aa  124  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.806576 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0549  GCN5-related N-acetyltransferase  48.3 
 
 
146 aa  120  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2683  GCN5-related N-acetyltransferase  44.74 
 
 
149 aa  117  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.454456  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6192  GCN5-related N-acetyltransferase  44.52 
 
 
144 aa  117  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0274  GCN5-related N-acetyltransferase  43.33 
 
 
149 aa  116  9e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4251  Histone acetyl transferase protein  45.39 
 
 
150 aa  114  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1882  putative acetyltransferase  46.26 
 
 
152 aa  114  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0785639  normal  0.209526 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0311  GCN5-related N-acetyltransferase  41.33 
 
 
148 aa  110  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.126839  normal  0.150201 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60277  N-acetyltransferase HPA3  36.6 
 
 
154 aa  108  4.0000000000000004e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.751079  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4542  GCN5-related N-acetyltransferase  38 
 
 
149 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.3744 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4277  GCN5-related N-acetyltransferase  38 
 
 
147 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.701884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3138  GCN5-related N-acetyltransferase  40.94 
 
 
145 aa  105  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.644467 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0028  GCN5-related N-acetyltransferase  43.45 
 
 
147 aa  104  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.578829 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2912  GCN5-related N-acetyltransferase  40.27 
 
 
145 aa  103  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.196361 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1820  GCN5-related N-acetyltransferase  35.95 
 
 
148 aa  102  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.209618  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3458  GCN5-related N-acetyltransferase  39.33 
 
 
153 aa  100  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.229516  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2018  GCN5-related N-acetyltransferase  36.18 
 
 
150 aa  98.6  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406329  normal  0.262902 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2017  GCN5-related N-acetyltransferase  36.05 
 
 
146 aa  98.2  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059884  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2583  GCN5-related N-acetyltransferase  41.45 
 
 
151 aa  97.4  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0675931  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1866  GCN5-related N-acetyltransferase  36.67 
 
 
147 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.990958 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2987  acetyltransferase  37.5 
 
 
147 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.82546  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1633  GCN5-related N-acetyltransferase  38.19 
 
 
147 aa  94.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.499665  normal  0.357486 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1461  GCN5-related N-acetyltransferase  29.14 
 
 
150 aa  72  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4177  hypothetical protein  38.6 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.203512  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4828  hypothetical protein  38.6 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.446033  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3338  hypothetical protein  38.6 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3036  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
84 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134438  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13208  predicted protein  29.5 
 
 
145 aa  57.4  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0144324  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4651  GCN5-related N-acetyltransferase  28.99 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.217746 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06850  acetyltransferase  29.73 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0005  GCN5-related N-acetyltransferase  31.54 
 
 
173 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4425  GCN5-related N-acetyltransferase  34.88 
 
 
173 aa  53.9  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2822  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
169 aa  53.9  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4148  GCN5-related N-acetyltransferase  31.54 
 
 
173 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.674163 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2855  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
173 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2540  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
159 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1584  GCN5-related N-acetyltransferase  35.53 
 
 
157 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0515771 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1031  GCN5-related N-acetyltransferase  27.34 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2356  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3209  GCN5-related N-acetyltransferase  34.57 
 
 
150 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.675647  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3406  acetyltransferase  27.27 
 
 
159 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.344947 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5609  GCN5-related N-acetyltransferase  27.66 
 
 
163 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.460517 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0159  GCN5-related N-acetyltransferase  27.4 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0205255  normal  0.0268459 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0163  GCN5-related N-acetyltransferase  27.4 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>