More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5344 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_5344  acetyltransferase  100 
 
 
148 aa  311  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00407792 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5253  GCN5-related N-acetyltransferase  99.32 
 
 
148 aa  309  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5393  GCN5-related N-acetyltransferase  93.92 
 
 
148 aa  293  6e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.650664  hitchhiker  0.00916992 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5635  GCN5-related N-acetyltransferase  75.68 
 
 
148 aa  242  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0013842  normal  0.201231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5119  GCN5-related N-acetyltransferase  75.68 
 
 
148 aa  241  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000288207  normal  0.236457 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5506  acetyltransferase, GNAT family  72.97 
 
 
148 aa  233  7e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5058  GCN5-related N-acetyltransferase  71.62 
 
 
148 aa  223  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153522  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71690  GNAT family acetyltransferase  56.85 
 
 
149 aa  186  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6220  putative acetyltransferase  57.34 
 
 
149 aa  186  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0137  GCN5-related N-acetyltransferase  54.79 
 
 
147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0132  GCN5-related N-acetyltransferase  56.64 
 
 
146 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1141  GCN5-related N-acetyltransferase  54.79 
 
 
149 aa  177  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.884922 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2785  GCN5-related N-acetyltransferase  56.64 
 
 
147 aa  173  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3956  GCN5-related N-acetyltransferase  48.63 
 
 
402 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0442969 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2964  GCN5-related N-acetyltransferase  51.75 
 
 
147 aa  161  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5176  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  48.63 
 
 
335 aa  159  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.472651 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2497  GCN5-related N-acetyltransferase  50.35 
 
 
147 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12144  normal  0.087022 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2165  GCN5-related N-acetyltransferase  51.72 
 
 
148 aa  154  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0161004  normal  0.0731596 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4135  GCN5-related N-acetyltransferase  51.02 
 
 
399 aa  153  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0441895  normal  0.143629 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1954  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
148 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0219812  normal  0.336797 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4414  GCN5-related N-acetyltransferase  48.98 
 
 
413 aa  148  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0279389  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5785  GCN5-related N-acetyltransferase  50.34 
 
 
400 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316473  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3849  GCN5-related N-acetyltransferase  50.34 
 
 
414 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156281  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3951  GCN5-related N-acetyltransferase  48.98 
 
 
413 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4519  GCN5-related N-acetyltransferase  50.34 
 
 
414 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20129  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2044  GCN5-related N-acetyltransferase  48.65 
 
 
153 aa  148  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.624808  normal  0.277662 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3262  GCN5-related N-acetyltransferase  49.32 
 
 
148 aa  148  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1329  GCN5-related N-acetyltransferase  50.69 
 
 
414 aa  146  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0310  GCN5-related N-acetyltransferase  47.14 
 
 
154 aa  146  9e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132707  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0194  GCN5-related N-acetyltransferase  45.1 
 
 
153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7075  GCN5-related N-acetyltransferase  47.33 
 
 
153 aa  144  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4647  GCN5-related N-acetyltransferase  45.81 
 
 
155 aa  143  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20803  normal  0.0229692 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4515  GCN5-related N-acetyltransferase  45.81 
 
 
155 aa  143  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0193  putative acetyltransferase  47.65 
 
 
153 aa  143  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1190  GCN5-related N-acetyltransferase  47.3 
 
 
150 aa  142  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.806576 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1310  GCN5-related N-acetyltransferase  47.97 
 
 
150 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.939241  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2652  putative acetyltransferase  47.97 
 
 
150 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3266  GCN5-related N-acetyltransferase  46.67 
 
 
158 aa  140  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1796  putative histone acetyltransferase (HAT)  45.58 
 
 
148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5125  GCN5-related N-acetyltransferase  46.67 
 
 
158 aa  138  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2696  GCN5-related N-acetyltransferase  48.95 
 
 
148 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.771243  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4438  GCN5-related N-acetyltransferase  47.71 
 
 
153 aa  137  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4113  GCN5-related N-acetyltransferase  44.67 
 
 
158 aa  136  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2917  GCN5-related N-acetyltransferase  45.33 
 
 
158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0836  GCN5-related N-acetyltransferase  42.07 
 
 
158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3851  GCN5-related N-acetyltransferase  43.15 
 
 
154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.619468  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09990  putative acetyltransferase  43.84 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0175715  normal  0.714198 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1882  putative acetyltransferase  45.58 
 
 
152 aa  128  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0785639  normal  0.209526 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4251  Histone acetyl transferase protein  46.94 
 
 
150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1012  GCN5-related N-acetyltransferase  38.78 
 
 
152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1109  GCN5-related N-acetyltransferase  39.16 
 
 
152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3469  GCN5-related N-acetyltransferase  41.89 
 
 
158 aa  122  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.293029  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0990  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
152 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3664  GCN5-related N-acetyltransferase  37.24 
 
 
151 aa  120  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.671996  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3002  GCN5-related N-acetyltransferase  38.36 
 
 
152 aa  120  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.533457  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3351  GCN5-related N-acetyltransferase  37.67 
 
 
152 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60277  N-acetyltransferase HPA3  39.74 
 
 
154 aa  119  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.751079  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3514  GCN5-related N-acetyltransferase  37.24 
 
 
152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1024  GCN5-related N-acetyltransferase  37.67 
 
 
152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.643013  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3138  GCN5-related N-acetyltransferase  40.85 
 
 
145 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.644467 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0274  GCN5-related N-acetyltransferase  40.56 
 
 
149 aa  116  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2912  GCN5-related N-acetyltransferase  38.73 
 
 
145 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.196361 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2683  GCN5-related N-acetyltransferase  40.28 
 
 
149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.454456  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4542  GCN5-related N-acetyltransferase  34.97 
 
 
149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.3744 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2598  GCN5-related N-acetyltransferase  37.32 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2018  GCN5-related N-acetyltransferase  34.72 
 
 
150 aa  110  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406329  normal  0.262902 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2987  acetyltransferase  38.57 
 
 
147 aa  110  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.82546  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1633  GCN5-related N-acetyltransferase  39.29 
 
 
147 aa  110  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.499665  normal  0.357486 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4277  GCN5-related N-acetyltransferase  34.97 
 
 
147 aa  107  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.701884 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1866  GCN5-related N-acetyltransferase  37.76 
 
 
147 aa  107  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.990958 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6192  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
144 aa  107  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0028  GCN5-related N-acetyltransferase  39.72 
 
 
147 aa  103  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.578829 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0311  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
148 aa  101  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.126839  normal  0.150201 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1820  GCN5-related N-acetyltransferase  35.21 
 
 
148 aa  100  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.209618  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0549  GCN5-related N-acetyltransferase  34.93 
 
 
146 aa  96.3  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2017  GCN5-related N-acetyltransferase  29.45 
 
 
146 aa  94.4  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059884  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3458  GCN5-related N-acetyltransferase  31.47 
 
 
153 aa  92.8  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.229516  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2583  GCN5-related N-acetyltransferase  38.19 
 
 
151 aa  92.8  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0675931  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2356  GCN5-related N-acetyltransferase  38.71 
 
 
159 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2540  GCN5-related N-acetyltransferase  38.71 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777279 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3406  acetyltransferase  37.63 
 
 
159 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.344947 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1461  GCN5-related N-acetyltransferase  28.19 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2432  GCN5-related N-acetyltransferase  31.85 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2838  GCN5-related N-acetyltransferase  31.11 
 
 
176 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2444  acetyltransferase, GNAT family  30.2 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2450  GCN5-related N-acetyltransferase  30.37 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4130  GCN5-related N-acetyltransferase  28.26 
 
 
170 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2565  putative acetyltransferase protein  30.37 
 
 
177 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1031  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06250  GNAT family acetyltransferase  31.18 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129837  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0584  putative N-acetyltransferase  31.18 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2822  GCN5-related N-acetyltransferase  32.33 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0312  GCN5-related N-acetyltransferase  29.93 
 
 
168 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.648752  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4651  GCN5-related N-acetyltransferase  35.56 
 
 
153 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.217746 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02661  putative N-acetyltransferase  25.35 
 
 
162 aa  62.8  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.967011  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1393  GCN5-related N-acetyltransferase  30.83 
 
 
168 aa  61.2  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.232677  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0886  acetyltransferase  30.11 
 
 
165 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0882  GCN5-related N-acetyltransferase  30.09 
 
 
165 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.922841 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1584  GCN5-related N-acetyltransferase  31.18 
 
 
157 aa  61.2  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0515771 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2124  GCN5-related N-acetyltransferase  27.35 
 
 
159 aa  60.8  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160054  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>