272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2497 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_2497  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
147 aa  306  8e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12144  normal  0.087022 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2964  GCN5-related N-acetyltransferase  91.16 
 
 
147 aa  281  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2785  GCN5-related N-acetyltransferase  88.44 
 
 
147 aa  275  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0132  GCN5-related N-acetyltransferase  57.93 
 
 
146 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1141  GCN5-related N-acetyltransferase  57.53 
 
 
149 aa  180  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.884922 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71690  GNAT family acetyltransferase  56.85 
 
 
149 aa  180  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3262  GCN5-related N-acetyltransferase  62.94 
 
 
148 aa  179  8.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6220  putative acetyltransferase  57.64 
 
 
149 aa  179  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0137  GCN5-related N-acetyltransferase  55.78 
 
 
147 aa  175  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2696  GCN5-related N-acetyltransferase  58.04 
 
 
148 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.771243  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5506  acetyltransferase, GNAT family  54.55 
 
 
148 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1954  GCN5-related N-acetyltransferase  53.42 
 
 
148 aa  170  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0219812  normal  0.336797 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4414  GCN5-related N-acetyltransferase  54.17 
 
 
413 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0279389  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2165  GCN5-related N-acetyltransferase  53.42 
 
 
148 aa  168  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0161004  normal  0.0731596 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4135  GCN5-related N-acetyltransferase  54.86 
 
 
399 aa  168  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0441895  normal  0.143629 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3951  GCN5-related N-acetyltransferase  54.17 
 
 
413 aa  167  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5785  GCN5-related N-acetyltransferase  56.25 
 
 
400 aa  167  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316473  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3849  GCN5-related N-acetyltransferase  53.85 
 
 
414 aa  166  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156281  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4519  GCN5-related N-acetyltransferase  53.85 
 
 
414 aa  166  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20129  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5393  GCN5-related N-acetyltransferase  51.39 
 
 
148 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.650664  hitchhiker  0.00916992 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5635  GCN5-related N-acetyltransferase  52.45 
 
 
148 aa  161  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0013842  normal  0.201231 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1329  GCN5-related N-acetyltransferase  52.45 
 
 
414 aa  161  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5253  GCN5-related N-acetyltransferase  50.35 
 
 
148 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5344  acetyltransferase  50.35 
 
 
148 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00407792 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5058  GCN5-related N-acetyltransferase  50.35 
 
 
148 aa  152  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153522  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5176  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  51.02 
 
 
335 aa  151  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.472651 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0193  putative acetyltransferase  50.34 
 
 
153 aa  150  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7075  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
153 aa  150  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5119  GCN5-related N-acetyltransferase  48.25 
 
 
148 aa  150  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000288207  normal  0.236457 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3956  GCN5-related N-acetyltransferase  48.28 
 
 
402 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0442969 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4113  GCN5-related N-acetyltransferase  51.01 
 
 
158 aa  144  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4515  GCN5-related N-acetyltransferase  48.32 
 
 
155 aa  140  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4647  GCN5-related N-acetyltransferase  48.32 
 
 
155 aa  140  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20803  normal  0.0229692 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3266  GCN5-related N-acetyltransferase  48.99 
 
 
158 aa  140  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0310  GCN5-related N-acetyltransferase  42.47 
 
 
154 aa  138  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132707  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1796  putative histone acetyltransferase (HAT)  45.52 
 
 
148 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0194  GCN5-related N-acetyltransferase  44.9 
 
 
153 aa  137  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0836  GCN5-related N-acetyltransferase  43.06 
 
 
158 aa  134  4e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2044  GCN5-related N-acetyltransferase  44.9 
 
 
153 aa  134  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.624808  normal  0.277662 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5125  GCN5-related N-acetyltransferase  46.98 
 
 
158 aa  133  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3851  GCN5-related N-acetyltransferase  45.45 
 
 
154 aa  129  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.619468  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09990  putative acetyltransferase  42.96 
 
 
152 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0175715  normal  0.714198 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3002  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.533457  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1024  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.643013  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6192  GCN5-related N-acetyltransferase  45.77 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2917  GCN5-related N-acetyltransferase  44.9 
 
 
158 aa  124  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1190  GCN5-related N-acetyltransferase  42.76 
 
 
150 aa  123  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.806576 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3351  GCN5-related N-acetyltransferase  40.97 
 
 
152 aa  123  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1012  GCN5-related N-acetyltransferase  41.26 
 
 
152 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3514  GCN5-related N-acetyltransferase  39.29 
 
 
152 aa  122  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0990  GCN5-related N-acetyltransferase  41.26 
 
 
152 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0274  GCN5-related N-acetyltransferase  41.55 
 
 
149 aa  121  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4438  GCN5-related N-acetyltransferase  46.62 
 
 
153 aa  121  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3664  GCN5-related N-acetyltransferase  38.73 
 
 
151 aa  121  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.671996  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60277  N-acetyltransferase HPA3  40.13 
 
 
154 aa  121  4e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.751079  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2652  putative acetyltransferase  41.38 
 
 
150 aa  120  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1310  GCN5-related N-acetyltransferase  41.38 
 
 
150 aa  120  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.939241  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1109  GCN5-related N-acetyltransferase  36.81 
 
 
152 aa  120  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4277  GCN5-related N-acetyltransferase  40.14 
 
 
147 aa  116  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.701884 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2683  GCN5-related N-acetyltransferase  43.06 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.454456  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3138  GCN5-related N-acetyltransferase  42.55 
 
 
145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.644467 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4542  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
149 aa  114  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.3744 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2018  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
150 aa  113  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406329  normal  0.262902 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1882  putative acetyltransferase  44.37 
 
 
152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0785639  normal  0.209526 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2912  GCN5-related N-acetyltransferase  40.43 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.196361 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0028  GCN5-related N-acetyltransferase  42.55 
 
 
147 aa  110  8.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.578829 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2583  GCN5-related N-acetyltransferase  44.37 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0675931  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3469  GCN5-related N-acetyltransferase  41.38 
 
 
158 aa  107  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.293029  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2598  GCN5-related N-acetyltransferase  39.72 
 
 
154 aa  106  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0311  GCN5-related N-acetyltransferase  40.56 
 
 
148 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.126839  normal  0.150201 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1866  GCN5-related N-acetyltransferase  37.41 
 
 
147 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.990958 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2987  acetyltransferase  38.89 
 
 
147 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.82546  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1820  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 
148 aa  100  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.209618  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1633  GCN5-related N-acetyltransferase  38.19 
 
 
147 aa  99.4  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.499665  normal  0.357486 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4251  Histone acetyl transferase protein  38.73 
 
 
150 aa  98.6  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0549  GCN5-related N-acetyltransferase  39.04 
 
 
146 aa  97.8  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2017  GCN5-related N-acetyltransferase  34.03 
 
 
146 aa  97.1  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059884  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3458  GCN5-related N-acetyltransferase  33.81 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.229516  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4235  GCN5-related N-acetyltransferase  32.06 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.815435  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3036  GCN5-related N-acetyltransferase  45.45 
 
 
84 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134438  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1461  GCN5-related N-acetyltransferase  28.77 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0612  GCN5-related N-acetyltransferase  30.16 
 
 
183 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.56302  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4828  hypothetical protein  45.33 
 
 
187 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.446033  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3338  hypothetical protein  45.33 
 
 
187 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4177  hypothetical protein  45.33 
 
 
187 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.203512  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  27.88 
 
 
151 aa  58.2  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.673137  normal  0.0183751 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2124  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160054  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2444  acetyltransferase, GNAT family  30.17 
 
 
161 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0886  acetyltransferase  33 
 
 
165 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0312  GCN5-related N-acetyltransferase  31.17 
 
 
168 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.648752  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1393  GCN5-related N-acetyltransferase  32.47 
 
 
168 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.232677  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1464  GCN5-related N-acetyltransferase  34.15 
 
 
166 aa  54.3  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.975468  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0591  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
171 aa  53.5  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0874  GCN5-related N-acetyltransferase  25.64 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1389  GCN5-related N-acetyltransferase  34.67 
 
 
212 aa  52.8  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00377993  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6026  putative acetyltransferase  35.79 
 
 
173 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4651  GCN5-related N-acetyltransferase  37.33 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.217746 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5735  GCN5-related N-acetyltransferase  32.65 
 
 
165 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.77189  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4130  GCN5-related N-acetyltransferase  26.47 
 
 
170 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2822  GCN5-related N-acetyltransferase  40.98 
 
 
169 aa  51.2  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>