More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0132 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0132  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 146 aa  302  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0137  GCN5-related N-acetyltransferase  72.41 
 
 		 147 aa  230  5e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71690  GNAT family acetyltransferase  71.72 
 
 		 149 aa  220  6e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6220  putative acetyltransferase  72.03 
 
 		 149 aa  219  8e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5635  GCN5-related N-acetyltransferase  63.64 
 
 		 148 aa  202  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0013842  normal  0.201231 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5176  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  63.45 
 
 		 335 aa  200  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.472651 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5506  acetyltransferase, GNAT family  60.28 
 
 		 148 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1141  GCN5-related N-acetyltransferase  60.84 
 
 		 149 aa  187  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.884922 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2785  GCN5-related N-acetyltransferase  59.31 
 
 		 147 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3956  GCN5-related N-acetyltransferase  56.55 
 
 		 402 aa  183  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0442969 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2497  GCN5-related N-acetyltransferase  57.93 
 
 		 147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12144  normal  0.087022 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5393  GCN5-related N-acetyltransferase  57.34 
 
 		 148 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.650664  hitchhiker  0.00916992 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2964  GCN5-related N-acetyltransferase  57.93 
 
 		 147 aa  181  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5119  GCN5-related N-acetyltransferase  55.94 
 
 		 148 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000288207  normal  0.236457 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5344  acetyltransferase  56.64 
 
 		 148 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00407792 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5253  GCN5-related N-acetyltransferase  55.94 
 
 		 148 aa  176  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4414  GCN5-related N-acetyltransferase  56.25 
 
 		 413 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0279389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5058  GCN5-related N-acetyltransferase  56.74 
 
 		 148 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3951  GCN5-related N-acetyltransferase  56.25 
 
 		 413 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3849  GCN5-related N-acetyltransferase  55.94 
 
 		 414 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156281  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4519  GCN5-related N-acetyltransferase  55.94 
 
 		 414 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2696  GCN5-related N-acetyltransferase  59.44 
 
 		 148 aa  167  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.771243  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5785  GCN5-related N-acetyltransferase  55.24 
 
 		 400 aa  167  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3262  GCN5-related N-acetyltransferase  61.38 
 
 		 148 aa  166  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1329  GCN5-related N-acetyltransferase  55.24 
 
 		 414 aa  166  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4135  GCN5-related N-acetyltransferase  54.86 
 
 		 399 aa  164  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0441895  normal  0.143629 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1954  GCN5-related N-acetyltransferase  55.63 
 
 		 148 aa  164  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0219812  normal  0.336797 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2165  GCN5-related N-acetyltransferase  56.34 
 
 		 148 aa  161  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0161004  normal  0.0731596 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0193  putative acetyltransferase  51.7 
 
 		 153 aa  159  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7075  GCN5-related N-acetyltransferase  48.98 
 
 		 153 aa  157  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1796  putative histone acetyltransferase (HAT)  49.66 
 
 		 148 aa  156  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4113  GCN5-related N-acetyltransferase  52.03 
 
 		 158 aa  156  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3266  GCN5-related N-acetyltransferase  49.66 
 
 		 158 aa  154  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0194  GCN5-related N-acetyltransferase  47.62 
 
 		 153 aa  153  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1190  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 		 150 aa  150  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.806576 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2044  GCN5-related N-acetyltransferase  48.32 
 
 		 153 aa  150  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.624808  normal  0.277662 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0310  GCN5-related N-acetyltransferase  51.05 
 
 		 154 aa  150  5.9999999999999996e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5125  GCN5-related N-acetyltransferase  48.32 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0836  GCN5-related N-acetyltransferase  44.06 
 
 		 158 aa  147  4e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09990  putative acetyltransferase  45.83 
 
 		 152 aa  144  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0175715  normal  0.714198 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1109  GCN5-related N-acetyltransferase  40.85 
 
 		 152 aa  144  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2917  GCN5-related N-acetyltransferase  48.3 
 
 		 158 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1310  GCN5-related N-acetyltransferase  48.3 
 
 		 150 aa  143  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.939241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2652  putative acetyltransferase  48.3 
 
 		 150 aa  143  9e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3851  GCN5-related N-acetyltransferase  47.59 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.619468  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4647  GCN5-related N-acetyltransferase  46.31 
 
 		 155 aa  140  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20803  normal  0.0229692 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4515  GCN5-related N-acetyltransferase  46.31 
 
 		 155 aa  140  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3002  GCN5-related N-acetyltransferase  41.55 
 
 		 152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.533457  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4438  GCN5-related N-acetyltransferase  49.66 
 
 		 153 aa  133  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1012  GCN5-related N-acetyltransferase  40.85 
 
 		 152 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0990  GCN5-related N-acetyltransferase  40.85 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3351  GCN5-related N-acetyltransferase  40.85 
 
 		 152 aa  130  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1024  GCN5-related N-acetyltransferase  40.14 
 
 		 152 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.643013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3469  GCN5-related N-acetyltransferase  49.66 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.293029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3514  GCN5-related N-acetyltransferase  38.57 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2598  GCN5-related N-acetyltransferase  43.17 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1882  putative acetyltransferase  49.31 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0785639  normal  0.209526 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3138  GCN5-related N-acetyltransferase  44.14 
 
 		 145 aa  125  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.644467 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3664  GCN5-related N-acetyltransferase  37.14 
 
 		 151 aa  124  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.671996  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4251  Histone acetyl transferase protein  47.22 
 
 		 150 aa  124  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2912  GCN5-related N-acetyltransferase  43.45 
 
 		 145 aa  123  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.196361 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0549  GCN5-related N-acetyltransferase  47.26 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60277  N-acetyltransferase HPA3  40 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.751079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2683  GCN5-related N-acetyltransferase  43.75 
 
 		 149 aa  120  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.454456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6192  GCN5-related N-acetyltransferase  44.06 
 
 		 144 aa  120  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0274  GCN5-related N-acetyltransferase  41.84 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0028  GCN5-related N-acetyltransferase  45.77 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.578829 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2583  GCN5-related N-acetyltransferase  45.77 
 
 		 151 aa  114  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0675931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1820  GCN5-related N-acetyltransferase  40.56 
 
 		 148 aa  114  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.209618  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2018  GCN5-related N-acetyltransferase  38.3 
 
 		 150 aa  114  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406329  normal  0.262902 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4542  GCN5-related N-acetyltransferase  40.56 
 
 		 149 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.3744 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4277  GCN5-related N-acetyltransferase  37.76 
 
 		 147 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.701884 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1866  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 		 147 aa  105  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.990958 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1633  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 		 147 aa  105  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.499665  normal  0.357486 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2987  acetyltransferase  40 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.82546  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0311  GCN5-related N-acetyltransferase  39.72 
 
 		 148 aa  103  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.126839  normal  0.150201 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2017  GCN5-related N-acetyltransferase  31.69 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059884  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3458  GCN5-related N-acetyltransferase  37.14 
 
 		 153 aa  95.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.229516  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1461  GCN5-related N-acetyltransferase  33.56 
 
 		 150 aa  87.4  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2444  acetyltransferase, GNAT family  32.19 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3724  GCN5-related N-acetyltransferase  30.66 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2822  GCN5-related N-acetyltransferase  34.85 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3036  GCN5-related N-acetyltransferase  41.25 
 
 		 84 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1584  GCN5-related N-acetyltransferase  31.85 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0515771 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0312  GCN5-related N-acetyltransferase  25.37 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.648752  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2450  GCN5-related N-acetyltransferase  31.11 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1393  GCN5-related N-acetyltransferase  26.12 
 
 		 168 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.232677  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2356  GCN5-related N-acetyltransferase  30.37 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3406  acetyltransferase  33.33 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.344947 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1564  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 179 aa  60.1  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000684291  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2124  GCN5-related N-acetyltransferase  37.21 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0882  GCN5-related N-acetyltransferase  30.14 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.922841 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4130  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2540  GCN5-related N-acetyltransferase  30.37 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777279 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1031  GCN5-related N-acetyltransferase  28.77 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4235  GCN5-related N-acetyltransferase  38.36 
 
 		 162 aa  57  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.815435  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0874  GCN5-related N-acetyltransferase  25.37 
 
 		 149 aa  57  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  23.13 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.673137  normal  0.0183751 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0526  GCN5-related N-acetyltransferase  24.63 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4148  GCN5-related N-acetyltransferase  30.82 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.674163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>