More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4647 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010678  Rpic_4515  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
155 aa  320  6e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4647  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
155 aa  320  6e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20803  normal  0.0229692 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0194  GCN5-related N-acetyltransferase  67.1 
 
 
153 aa  219  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7075  GCN5-related N-acetyltransferase  67.76 
 
 
153 aa  216  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1796  putative histone acetyltransferase (HAT)  68.71 
 
 
148 aa  213  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3266  GCN5-related N-acetyltransferase  66.67 
 
 
158 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0193  putative acetyltransferase  68.42 
 
 
153 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5125  GCN5-related N-acetyltransferase  66.01 
 
 
158 aa  207  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2044  GCN5-related N-acetyltransferase  64.47 
 
 
153 aa  206  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.624808  normal  0.277662 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3851  GCN5-related N-acetyltransferase  62.42 
 
 
154 aa  199  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.619468  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4438  GCN5-related N-acetyltransferase  67.1 
 
 
153 aa  194  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2917  GCN5-related N-acetyltransferase  63.09 
 
 
158 aa  193  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4113  GCN5-related N-acetyltransferase  61.33 
 
 
158 aa  187  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3469  GCN5-related N-acetyltransferase  60.69 
 
 
158 aa  170  7.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.293029  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3262  GCN5-related N-acetyltransferase  60.54 
 
 
148 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3951  GCN5-related N-acetyltransferase  56.67 
 
 
413 aa  159  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4414  GCN5-related N-acetyltransferase  56.67 
 
 
413 aa  159  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0279389  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4135  GCN5-related N-acetyltransferase  56.67 
 
 
399 aa  158  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0441895  normal  0.143629 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5785  GCN5-related N-acetyltransferase  56 
 
 
400 aa  157  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316473  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3849  GCN5-related N-acetyltransferase  56 
 
 
414 aa  157  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156281  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4519  GCN5-related N-acetyltransferase  56 
 
 
414 aa  157  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20129  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71690  GNAT family acetyltransferase  50 
 
 
149 aa  154  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5635  GCN5-related N-acetyltransferase  49.66 
 
 
148 aa  154  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0013842  normal  0.201231 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6220  putative acetyltransferase  50.68 
 
 
149 aa  154  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1329  GCN5-related N-acetyltransferase  55.1 
 
 
414 aa  152  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0137  GCN5-related N-acetyltransferase  50.67 
 
 
147 aa  152  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2696  GCN5-related N-acetyltransferase  57.82 
 
 
148 aa  153  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.771243  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3956  GCN5-related N-acetyltransferase  51.7 
 
 
402 aa  152  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0442969 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1141  GCN5-related N-acetyltransferase  53.02 
 
 
149 aa  150  8e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.884922 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2785  GCN5-related N-acetyltransferase  52.35 
 
 
147 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5506  acetyltransferase, GNAT family  45.33 
 
 
148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2964  GCN5-related N-acetyltransferase  51.01 
 
 
147 aa  144  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1012  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
152 aa  144  6e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3351  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
152 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5344  acetyltransferase  45.81 
 
 
148 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00407792 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5253  GCN5-related N-acetyltransferase  45.81 
 
 
148 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0310  GCN5-related N-acetyltransferase  46.05 
 
 
154 aa  143  8.000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132707  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5393  GCN5-related N-acetyltransferase  46.26 
 
 
148 aa  143  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.650664  hitchhiker  0.00916992 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0990  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
152 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1024  GCN5-related N-acetyltransferase  49.31 
 
 
152 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.643013  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2165  GCN5-related N-acetyltransferase  49.32 
 
 
148 aa  141  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0161004  normal  0.0731596 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5176  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  47.65 
 
 
335 aa  140  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.472651 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2497  GCN5-related N-acetyltransferase  48.32 
 
 
147 aa  140  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12144  normal  0.087022 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0132  GCN5-related N-acetyltransferase  46.31 
 
 
146 aa  140  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1954  GCN5-related N-acetyltransferase  49.32 
 
 
148 aa  140  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0219812  normal  0.336797 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1109  GCN5-related N-acetyltransferase  43.42 
 
 
152 aa  138  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5058  GCN5-related N-acetyltransferase  44.67 
 
 
148 aa  136  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153522  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5119  GCN5-related N-acetyltransferase  44 
 
 
148 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000288207  normal  0.236457 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3514  GCN5-related N-acetyltransferase  44.08 
 
 
152 aa  135  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0836  GCN5-related N-acetyltransferase  44.16 
 
 
158 aa  136  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3002  GCN5-related N-acetyltransferase  47.22 
 
 
152 aa  135  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.533457  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3664  GCN5-related N-acetyltransferase  45.75 
 
 
151 aa  133  9e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.671996  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2652  putative acetyltransferase  48.05 
 
 
150 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1310  GCN5-related N-acetyltransferase  48.05 
 
 
150 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.939241  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1190  GCN5-related N-acetyltransferase  48.05 
 
 
150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.806576 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09990  putative acetyltransferase  45.21 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0175715  normal  0.714198 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2598  GCN5-related N-acetyltransferase  45.27 
 
 
154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6192  GCN5-related N-acetyltransferase  48.63 
 
 
144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0274  GCN5-related N-acetyltransferase  45.52 
 
 
149 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1882  putative acetyltransferase  47.33 
 
 
152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0785639  normal  0.209526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2583  GCN5-related N-acetyltransferase  46.79 
 
 
151 aa  114  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0675931  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2912  GCN5-related N-acetyltransferase  42.28 
 
 
145 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.196361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3138  GCN5-related N-acetyltransferase  42.95 
 
 
145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.644467 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2018  GCN5-related N-acetyltransferase  39.87 
 
 
150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406329  normal  0.262902 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0549  GCN5-related N-acetyltransferase  41.89 
 
 
146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0028  GCN5-related N-acetyltransferase  47.86 
 
 
147 aa  107  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.578829 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60277  N-acetyltransferase HPA3  37.5 
 
 
154 aa  107  8.000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.751079  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4542  GCN5-related N-acetyltransferase  39.04 
 
 
149 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.3744 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1820  GCN5-related N-acetyltransferase  38.26 
 
 
148 aa  104  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.209618  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4251  Histone acetyl transferase protein  41.83 
 
 
150 aa  103  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4277  GCN5-related N-acetyltransferase  38.36 
 
 
147 aa  103  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.701884 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1866  GCN5-related N-acetyltransferase  40.67 
 
 
147 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.990958 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2683  GCN5-related N-acetyltransferase  40.54 
 
 
149 aa  99.4  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.454456  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0311  GCN5-related N-acetyltransferase  40.13 
 
 
148 aa  99.4  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.126839  normal  0.150201 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2017  GCN5-related N-acetyltransferase  34.01 
 
 
146 aa  93.2  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059884  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2987  acetyltransferase  38.1 
 
 
147 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.82546  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3458  GCN5-related N-acetyltransferase  40.15 
 
 
153 aa  89  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.229516  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1633  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
147 aa  87.8  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.499665  normal  0.357486 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1461  GCN5-related N-acetyltransferase  30.94 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1031  GCN5-related N-acetyltransferase  30.1 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0886  acetyltransferase  33.65 
 
 
165 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5735  GCN5-related N-acetyltransferase  33.96 
 
 
165 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.77189  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0882  GCN5-related N-acetyltransferase  33.02 
 
 
165 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.922841 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2677  GCN5-related N-acetyltransferase  30.91 
 
 
161 aa  60.8  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.245575  normal  0.057406 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5816  acetyltransferase  30 
 
 
160 aa  60.5  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294644  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2412  GCN5-related N-acetyltransferase  31.36 
 
 
165 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700134 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2408  GCN5-related N-acetyltransferase  31.36 
 
 
165 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0178488  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1796  GCN5-related N-acetyltransferase  31.36 
 
 
195 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2124  GCN5-related N-acetyltransferase  38.2 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160054  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2318  GCN5-related N-acetyltransferase  33.02 
 
 
165 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253918  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  33.02 
 
 
165 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00150599  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4022  GCN5-related N-acetyltransferase  32.23 
 
 
159 aa  57.8  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  26.35 
 
 
150 aa  57.8  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04197  N-acetyltransferase  31.33 
 
 
163 aa  57.8  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0005  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
173 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4148  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
173 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.674163 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2450  GCN5-related N-acetyltransferase  31.18 
 
 
159 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4231  GCN5-related N-acetyltransferase  32.23 
 
 
159 aa  57.8  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2822  GCN5-related N-acetyltransferase  37.35 
 
 
169 aa  57.8  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3984  GCN5-like N-acetyltransferase  28.17 
 
 
163 aa  57.4  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>