More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3951 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1329  GCN5-related N-acetyltransferase  91.77 
 
 
414 aa  763    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5785  GCN5-related N-acetyltransferase  93.73 
 
 
400 aa  766    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316473  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3849  GCN5-related N-acetyltransferase  94.43 
 
 
414 aa  798    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156281  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3951  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
413 aa  838    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4135  GCN5-related N-acetyltransferase  89.72 
 
 
399 aa  719    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0441895  normal  0.143629 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4519  GCN5-related N-acetyltransferase  94.43 
 
 
414 aa  798    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20129  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4414  GCN5-related N-acetyltransferase  97.82 
 
 
413 aa  791    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0279389  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3857  GCN5-related N-acetyltransferase  67.69 
 
 
238 aa  321  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2818  GCN5-related N-acetyltransferase  62.55 
 
 
248 aa  317  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.828627  normal  0.284688 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4033  GCN5-related N-acetyltransferase  63.68 
 
 
235 aa  316  5e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4145  GCN5-related N-acetyltransferase  63.68 
 
 
235 aa  316  5e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0738417  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0909  acetyltransferase  65.07 
 
 
278 aa  312  9e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0925332  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0781  putative acetyltransferase  60.83 
 
 
240 aa  311  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0311014  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1974  acetyltransferase  64.56 
 
 
289 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0556  acetyltransferase  64.56 
 
 
289 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0787  acetyltransferase  64.56 
 
 
260 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228017  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0488  acetyltransferase  64.56 
 
 
260 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.223436  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0668  acetyltransferase  64.56 
 
 
282 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0559426  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2071  acetyltransferase  64.56 
 
 
301 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115952  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1621  acetyltransferase  64.14 
 
 
282 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.133589  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7127  GCN5-related N-acetyltransferase  63.04 
 
 
245 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.778776  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0245  GNAT family acetyltransferase  62.98 
 
 
245 aa  300  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4081  GCN5-related N-acetyltransferase  60.09 
 
 
239 aa  293  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1303  GNAT family acetyltransferase  56.02 
 
 
237 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0528252 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3358  GCN5-related N-acetyltransferase  57.2 
 
 
244 aa  277  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0936  GCN5-related N-acetyltransferase  56.47 
 
 
236 aa  272  8.000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.955559  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0504  GCN5-related N-acetyltransferase  53.11 
 
 
254 aa  268  1e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000371551  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2083  GCN5-related N-acetyltransferase  64.71 
 
 
235 aa  265  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.142575  normal  0.283603 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0091  acetyltransferase  52.97 
 
 
225 aa  262  1e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.476344  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2754  GCN5-related N-acetyltransferase  52.16 
 
 
234 aa  248  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4251  GCN5-related N-acetyltransferase  50.23 
 
 
225 aa  245  9e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0101502  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2237  GCN5-related N-acetyltransferase  49.58 
 
 
299 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.520496  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2019  GCN5-related N-acetyltransferase  51.1 
 
 
233 aa  243  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.919272  normal  0.277191 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2145  acetyltransferase  50.43 
 
 
299 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641026  normal  0.0140244 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2127  acetyltransferase  50.87 
 
 
236 aa  242  7.999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0814  acetyltransferase  55.45 
 
 
237 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0663  GCN5-related N-acetyltransferase  57.2 
 
 
238 aa  242  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0212  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  49.33 
 
 
238 aa  241  2e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000482497  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2112  acetyltransferase  49.33 
 
 
238 aa  241  2e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.371862  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0366  GCN5-related N-acetyltransferase  53.88 
 
 
234 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.6493 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7277  GCN5-related N-acetyltransferase  55.16 
 
 
388 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0717665  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2471  GCN5-related N-acetyltransferase  54.55 
 
 
237 aa  237  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1154  GCN5-related N-acetyltransferase  51.01 
 
 
251 aa  236  6e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.975803  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6010  GCN5-related N-acetyltransferase  49.81 
 
 
388 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00263828 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1997  GCN5-related N-acetyltransferase  51.77 
 
 
252 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.663348  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0133  GCN5-related N-acetyltransferase  51.57 
 
 
223 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2180  GCN5-related N-acetyltransferase  53.1 
 
 
246 aa  230  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0457  acetyltransferase  48 
 
 
231 aa  228  2e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6221  hypothetical protein  52.97 
 
 
224 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71700  GNAT family acetyltransferase  52.73 
 
 
224 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6844  hypothetical protein  49.56 
 
 
229 aa  220  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5636  GCN5-related N-acetyltransferase  51.36 
 
 
223 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0145041  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2718  GCN5-related N-acetyltransferase  48.17 
 
 
226 aa  217  4e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0254  acetyltransferase  43.75 
 
 
226 aa  216  5.9999999999999996e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0375691  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5059  GCN5-related N-acetyltransferase  50.68 
 
 
222 aa  206  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5394  GCN5-related N-acetyltransferase  48.64 
 
 
223 aa  206  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.757862  hitchhiker  0.00983095 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5345  acetyltransferase  49.54 
 
 
223 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450705 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5507  acetyltransferase, GNAT family  50.45 
 
 
222 aa  203  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1946  GCN5-related N-acetyltransferase  42.8 
 
 
237 aa  203  5e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027856 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5254  GCN5-related N-acetyltransferase  49.08 
 
 
223 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0397  ribosomal protein serine acetyltransferase  44.89 
 
 
244 aa  199  7.999999999999999e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3813  acetyltransferase  45.12 
 
 
229 aa  196  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5120  GCN5-related N-acetyltransferase  49.09 
 
 
224 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000605746  normal  0.334763 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2777  GCN5-related N-acetyltransferase  43.69 
 
 
232 aa  193  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3099  GCN5-related N-acetyltransferase  45.89 
 
 
253 aa  192  7e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.401469 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3395  GCN5-related N-acetyltransferase  42.53 
 
 
231 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0149823 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1106  GCN5-related N-acetyltransferase  44.98 
 
 
231 aa  191  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.737753 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3694  GCN5-related N-acetyltransferase  41.23 
 
 
231 aa  190  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08604  GNAT family acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00850)  43.35 
 
 
236 aa  181  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2696  GCN5-related N-acetyltransferase  68.06 
 
 
148 aa  179  9e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.771243  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2165  GCN5-related N-acetyltransferase  57.93 
 
 
148 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0161004  normal  0.0731596 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3262  GCN5-related N-acetyltransferase  67.36 
 
 
148 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1954  GCN5-related N-acetyltransferase  56.25 
 
 
148 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0219812  normal  0.336797 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0132  GCN5-related N-acetyltransferase  56.25 
 
 
146 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2785  GCN5-related N-acetyltransferase  57.53 
 
 
147 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2497  GCN5-related N-acetyltransferase  54.17 
 
 
147 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12144  normal  0.087022 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2964  GCN5-related N-acetyltransferase  56.16 
 
 
147 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0194  GCN5-related N-acetyltransferase  54.61 
 
 
153 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0137  GCN5-related N-acetyltransferase  53.42 
 
 
147 aa  166  9e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71690  GNAT family acetyltransferase  53.69 
 
 
149 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6220  putative acetyltransferase  53.69 
 
 
149 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5176  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  49.37 
 
 
335 aa  162  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.472651 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4113  GCN5-related N-acetyltransferase  55.33 
 
 
158 aa  162  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1141  GCN5-related N-acetyltransferase  57.05 
 
 
149 aa  161  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.884922 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3956  GCN5-related N-acetyltransferase  48.37 
 
 
402 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0442969 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4515  GCN5-related N-acetyltransferase  56.67 
 
 
155 aa  160  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4647  GCN5-related N-acetyltransferase  56.67 
 
 
155 aa  160  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20803  normal  0.0229692 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0310  GCN5-related N-acetyltransferase  54.48 
 
 
154 aa  156  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132707  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5635  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
148 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0013842  normal  0.201231 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1796  putative histone acetyltransferase (HAT)  54.05 
 
 
148 aa  153  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7075  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
153 aa  152  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5393  GCN5-related N-acetyltransferase  49.32 
 
 
148 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.650664  hitchhiker  0.00916992 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5253  GCN5-related N-acetyltransferase  48.98 
 
 
148 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1190  GCN5-related N-acetyltransferase  50.68 
 
 
150 aa  149  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.806576 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5344  acetyltransferase  48.98 
 
 
148 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00407792 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0193  putative acetyltransferase  51.33 
 
 
153 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2044  GCN5-related N-acetyltransferase  49.32 
 
 
153 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.624808  normal  0.277662 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5119  GCN5-related N-acetyltransferase  47.95 
 
 
148 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000288207  normal  0.236457 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3266  GCN5-related N-acetyltransferase  50.67 
 
 
158 aa  143  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5506  acetyltransferase, GNAT family  47.97 
 
 
148 aa  142  8e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>