More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4033 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4145  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
235 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0738417  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4033  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
235 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5785  GCN5-related N-acetyltransferase  63.68 
 
 
400 aa  318  6e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316473  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3849  GCN5-related N-acetyltransferase  63.68 
 
 
414 aa  317  7e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156281  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4519  GCN5-related N-acetyltransferase  63.68 
 
 
414 aa  317  7e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20129  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3951  GCN5-related N-acetyltransferase  63.64 
 
 
413 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4135  GCN5-related N-acetyltransferase  63.36 
 
 
399 aa  310  9e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0441895  normal  0.143629 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1329  GCN5-related N-acetyltransferase  62.82 
 
 
414 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4414  GCN5-related N-acetyltransferase  61.9 
 
 
413 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0279389  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3857  GCN5-related N-acetyltransferase  63.48 
 
 
238 aa  300  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0909  acetyltransferase  61.04 
 
 
278 aa  299  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0925332  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2818  GCN5-related N-acetyltransferase  62.45 
 
 
248 aa  292  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.828627  normal  0.284688 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0781  putative acetyltransferase  58.55 
 
 
240 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0311014  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0245  GNAT family acetyltransferase  58.77 
 
 
245 aa  284  7e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1974  acetyltransferase  60.17 
 
 
289 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0668  acetyltransferase  60.17 
 
 
282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0559426  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0556  acetyltransferase  60.17 
 
 
289 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0787  acetyltransferase  60.17 
 
 
260 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228017  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0488  acetyltransferase  60.17 
 
 
260 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.223436  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1621  acetyltransferase  60.17 
 
 
282 aa  281  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.133589  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2071  acetyltransferase  59.74 
 
 
301 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115952  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7127  GCN5-related N-acetyltransferase  57.89 
 
 
245 aa  280  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.778776  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4081  GCN5-related N-acetyltransferase  56.64 
 
 
239 aa  270  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3358  GCN5-related N-acetyltransferase  57.21 
 
 
244 aa  268  5e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0936  GCN5-related N-acetyltransferase  53.62 
 
 
236 aa  265  5e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.955559  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1303  GNAT family acetyltransferase  56.9 
 
 
237 aa  261  6e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0528252 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2754  GCN5-related N-acetyltransferase  52.56 
 
 
234 aa  257  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2083  GCN5-related N-acetyltransferase  59.83 
 
 
235 aa  256  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.142575  normal  0.283603 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0504  GCN5-related N-acetyltransferase  52.52 
 
 
254 aa  241  5e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000371551  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0212  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  47.23 
 
 
238 aa  238  5.999999999999999e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000482497  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2112  acetyltransferase  47.23 
 
 
238 aa  238  5.999999999999999e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.371862  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4251  GCN5-related N-acetyltransferase  49.32 
 
 
225 aa  238  5.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0101502  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0091  acetyltransferase  49.77 
 
 
225 aa  237  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.476344  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0663  GCN5-related N-acetyltransferase  56.9 
 
 
238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1997  GCN5-related N-acetyltransferase  48.67 
 
 
252 aa  233  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.663348  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1154  GCN5-related N-acetyltransferase  48.95 
 
 
251 aa  233  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.975803  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6221  hypothetical protein  52.75 
 
 
224 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0457  acetyltransferase  49.12 
 
 
231 aa  230  1e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7277  GCN5-related N-acetyltransferase  50.88 
 
 
388 aa  223  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0717665  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6010  GCN5-related N-acetyltransferase  49.33 
 
 
388 aa  223  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00263828 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71700  GNAT family acetyltransferase  50 
 
 
224 aa  222  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0133  GCN5-related N-acetyltransferase  49.09 
 
 
223 aa  221  8e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2019  GCN5-related N-acetyltransferase  47.62 
 
 
233 aa  219  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.919272  normal  0.277191 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2180  GCN5-related N-acetyltransferase  50.87 
 
 
246 aa  218  6e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2471  GCN5-related N-acetyltransferase  50.22 
 
 
237 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0814  acetyltransferase  50.22 
 
 
237 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0366  GCN5-related N-acetyltransferase  49.1 
 
 
234 aa  209  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.6493 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2718  GCN5-related N-acetyltransferase  46.79 
 
 
226 aa  208  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2237  GCN5-related N-acetyltransferase  43.72 
 
 
299 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.520496  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2145  acetyltransferase  43.72 
 
 
299 aa  207  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641026  normal  0.0140244 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2127  acetyltransferase  43.72 
 
 
236 aa  206  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1946  GCN5-related N-acetyltransferase  45.18 
 
 
237 aa  206  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027856 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0254  acetyltransferase  41.44 
 
 
226 aa  202  4e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0375691  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08604  GNAT family acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00850)  45.61 
 
 
236 aa  202  5e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5636  GCN5-related N-acetyltransferase  47.2 
 
 
223 aa  201  9e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0145041  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5059  GCN5-related N-acetyltransferase  45.91 
 
 
222 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2777  GCN5-related N-acetyltransferase  46.15 
 
 
232 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5120  GCN5-related N-acetyltransferase  47.95 
 
 
224 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000605746  normal  0.334763 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6844  hypothetical protein  44.69 
 
 
229 aa  198  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5345  acetyltransferase  47.27 
 
 
223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450705 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5394  GCN5-related N-acetyltransferase  46.36 
 
 
223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.757862  hitchhiker  0.00983095 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3099  GCN5-related N-acetyltransferase  43.54 
 
 
253 aa  195  4.0000000000000005e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.401469 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5254  GCN5-related N-acetyltransferase  46.79 
 
 
223 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3694  GCN5-related N-acetyltransferase  42.27 
 
 
231 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3395  GCN5-related N-acetyltransferase  42.27 
 
 
231 aa  191  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0149823 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5507  acetyltransferase, GNAT family  44.55 
 
 
222 aa  190  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1106  GCN5-related N-acetyltransferase  42.92 
 
 
231 aa  190  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.737753 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3813  acetyltransferase  43.4 
 
 
229 aa  188  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0397  ribosomal protein serine acetyltransferase  40.44 
 
 
244 aa  178  7e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0205  GNAT family acetyltransferase  34.05 
 
 
197 aa  101  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1575  GCN5-related N-acetyltransferase  34.72 
 
 
209 aa  99.8  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.989709  normal  0.297074 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3177  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
191 aa  96.3  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3936  acetyltransferase  32.97 
 
 
207 aa  95.1  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.229925  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1092  putative amino-acid acetyltransferase  33 
 
 
199 aa  94  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.981692  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3372  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 
202 aa  92.4  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351729  normal  0.46007 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44829  predicted protein  29.08 
 
 
481 aa  91.7  8e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2524  GCN5-related N-acetyltransferase  36.13 
 
 
200 aa  91.3  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.114386 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0263  GCN5-related N-acetyltransferase  32.29 
 
 
193 aa  89.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2220  GCN5-related N-acetyltransferase  30.26 
 
 
197 aa  89  6e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.427445  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2494  GCN5-related N-acetyltransferase  31.18 
 
 
197 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1587  GCN5-related N-acetyltransferase  34 
 
 
203 aa  87  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.66399  normal  0.12838 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1994  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
197 aa  86.7  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.11238  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3187  GCN5-related N-acetyltransferase  34.21 
 
 
197 aa  85.5  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2883  GCN5-related N-acetyltransferase  28.4 
 
 
195 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.104582  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3157  GCN5-related N-acetyltransferase  32.82 
 
 
194 aa  84  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0985  GCN5-related N-acetyltransferase  30.81 
 
 
197 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2381  GCN5-related N-acetyltransferase  32.37 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2475  GCN5-related N-acetyltransferase  32.61 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0839  GCN5-related N-acetyltransferase  32.07 
 
 
199 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0880466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1660  GCN5-related N-acetyltransferase  32.09 
 
 
236 aa  82.4  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3130  acetyltransferase, GNAT family  26.71 
 
 
195 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00157226  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1834  GCN5-related N-acetyltransferase  32.47 
 
 
199 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.18307  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7783  acetyltransferase, GNAT family  31.55 
 
 
193 aa  82  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.747821  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2859  acetyltransferase  26.83 
 
 
195 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0157116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2820  acetyltransferase  27.33 
 
 
195 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4742  acetyltransferase, GNAT family  34.29 
 
 
196 aa  81.6  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3111  acetyltransferase, GNAT family  26.83 
 
 
195 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3129  acetyltransferase  27.22 
 
 
195 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.203794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2891  acetyltransferase  27.33 
 
 
195 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0153318  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3108  acetyltransferase  27.33 
 
 
195 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>