253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5345 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5345  acetyltransferase  100 
 
 		 223 aa  460  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450705 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5254  GCN5-related N-acetyltransferase  97.76 
 
 		 223 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5394  GCN5-related N-acetyltransferase  91.48 
 
 		 223 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.757862  hitchhiker  0.00983095 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5120  GCN5-related N-acetyltransferase  78.38 
 
 		 224 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000605746  normal  0.334763 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5636  GCN5-related N-acetyltransferase  71.62 
 
 		 223 aa  331  7.000000000000001e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0145041  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5059  GCN5-related N-acetyltransferase  63.51 
 
 		 222 aa  299  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5507  acetyltransferase, GNAT family  63.51 
 
 		 222 aa  298  5e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6221  hypothetical protein  62.5 
 
 		 224 aa  288  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71700  GNAT family acetyltransferase  61.88 
 
 		 224 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0133  GCN5-related N-acetyltransferase  61.54 
 
 		 223 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0366  GCN5-related N-acetyltransferase  51.64 
 
 		 234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.6493 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2471  GCN5-related N-acetyltransferase  49.49 
 
 		 237 aa  204  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0814  acetyltransferase  49.49 
 
 		 237 aa  204  9e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3951  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 		 413 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4414  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 		 413 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0279389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4135  GCN5-related N-acetyltransferase  49.54 
 
 		 399 aa  202  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0441895  normal  0.143629 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4251  GCN5-related N-acetyltransferase  49.07 
 
 		 225 aa  202  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0101502  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6010  GCN5-related N-acetyltransferase  49.77 
 
 		 388 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00263828 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2180  GCN5-related N-acetyltransferase  48.37 
 
 		 246 aa  199  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3849  GCN5-related N-acetyltransferase  47.27 
 
 		 414 aa  198  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156281  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4519  GCN5-related N-acetyltransferase  47.27 
 
 		 414 aa  198  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5785  GCN5-related N-acetyltransferase  47.27 
 
 		 400 aa  198  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0397  ribosomal protein serine acetyltransferase  46.73 
 
 		 244 aa  198  7e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4081  GCN5-related N-acetyltransferase  47.47 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4145  GCN5-related N-acetyltransferase  47.27 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0738417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4033  GCN5-related N-acetyltransferase  47.27 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1154  GCN5-related N-acetyltransferase  46.58 
 
 		 251 aa  193  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.975803  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0091  acetyltransferase  46.26 
 
 		 225 aa  192  4e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.476344  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0909  acetyltransferase  46.73 
 
 		 278 aa  192  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0925332  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1329  GCN5-related N-acetyltransferase  46.36 
 
 		 414 aa  192  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7127  GCN5-related N-acetyltransferase  46.26 
 
 		 245 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.778776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0245  GNAT family acetyltransferase  46.48 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6844  hypothetical protein  45.7 
 
 		 229 aa  185  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7277  GCN5-related N-acetyltransferase  48.24 
 
 		 388 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0717665  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3358  GCN5-related N-acetyltransferase  44.39 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2818  GCN5-related N-acetyltransferase  44.95 
 
 		 248 aa  182  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.828627  normal  0.284688 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1997  GCN5-related N-acetyltransferase  43.72 
 
 		 252 aa  180  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.663348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2718  GCN5-related N-acetyltransferase  45.91 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2071  acetyltransferase  44.86 
 
 		 301 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115952  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1974  acetyltransferase  44.86 
 
 		 289 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2083  GCN5-related N-acetyltransferase  44.71 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.142575  normal  0.283603 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0556  acetyltransferase  44.39 
 
 		 289 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0668  acetyltransferase  44.39 
 
 		 282 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0559426  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0787  acetyltransferase  44.39 
 
 		 260 aa  175  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228017  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0488  acetyltransferase  44.39 
 
 		 260 aa  175  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.223436  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1621  acetyltransferase  44.39 
 
 		 282 aa  174  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.133589  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08604  GNAT family acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00850)  43.69 
 
 		 236 aa  169  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3099  GCN5-related N-acetyltransferase  41.63 
 
 		 253 aa  169  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.401469 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3857  GCN5-related N-acetyltransferase  47.03 
 
 		 238 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3395  GCN5-related N-acetyltransferase  41.26 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0149823 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0212  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  41.23 
 
 		 238 aa  165  5e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000482497  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2112  acetyltransferase  41.23 
 
 		 238 aa  165  5e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.371862  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0936  GCN5-related N-acetyltransferase  42.27 
 
 		 236 aa  165  5.9999999999999996e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.955559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3694  GCN5-related N-acetyltransferase  40.81 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3813  acetyltransferase  40.81 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2777  GCN5-related N-acetyltransferase  41.07 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0457  acetyltransferase  40.28 
 
 		 231 aa  159  2e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0504  GCN5-related N-acetyltransferase  41.78 
 
 		 254 aa  159  3e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000371551  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2754  GCN5-related N-acetyltransferase  40.87 
 
 		 234 aa  156  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0781  putative acetyltransferase  39.09 
 
 		 240 aa  155  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0311014  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2019  GCN5-related N-acetyltransferase  43.84 
 
 		 233 aa  155  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.919272  normal  0.277191 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0254  acetyltransferase  35.51 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0375691  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1303  GNAT family acetyltransferase  38.28 
 
 		 237 aa  147  9e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0528252 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0663  GCN5-related N-acetyltransferase  44.98 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1106  GCN5-related N-acetyltransferase  41.74 
 
 		 231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.737753 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2145  acetyltransferase  38.94 
 
 		 299 aa  145  6e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641026  normal  0.0140244 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1946  GCN5-related N-acetyltransferase  38.5 
 
 		 237 aa  145  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027856 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2237  GCN5-related N-acetyltransferase  38.94 
 
 		 299 aa  145  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.520496  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2127  acetyltransferase  38.94 
 
 		 236 aa  144  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1575  GCN5-related N-acetyltransferase  36.65 
 
 		 209 aa  104  9e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.989709  normal  0.297074 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2524  GCN5-related N-acetyltransferase  35.96 
 
 		 200 aa  89.4  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.114386 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0263  GCN5-related N-acetyltransferase  35.43 
 
 		 193 aa  87.8  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1994  GCN5-related N-acetyltransferase  34.51 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.11238  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3727  GCN5-related N-acetyltransferase  38.93 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.755062  normal  0.374224 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44829  predicted protein  31.05 
 
 		 481 aa  80.1  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3177  GCN5-related N-acetyltransferase  35.38 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0622  hypothetical protein  31.18 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.231945 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0839  GCN5-related N-acetyltransferase  31.86 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0880466 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5405  GCN5-related N-acetyltransferase  34.73 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4244  GCN5-related N-acetyltransferase  33.73 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.248347  normal  0.0288305 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1744  GCN5-related N-acetyltransferase  34.94 
 
 		 201 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2220  GCN5-related N-acetyltransferase  30.53 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.427445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1220  hypothetical protein  33.16 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.86891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3485  GCN5-related N-acetyltransferase  34.5 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.143784  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3157  GCN5-related N-acetyltransferase  33.84 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4881  GCN5-related N-acetyltransferase  34.5 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0205  GNAT family acetyltransferase  32.8 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4069  hypothetical protein  29.21 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3953  GCN5-related N-acetyltransferase  38.03 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0306  hypothetical protein  29.84 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2883  GCN5-related N-acetyltransferase  34.88 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.104582  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7783  acetyltransferase, GNAT family  33.69 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.747821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4769  GCN5-related N-acetyltransferase  33.13 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4742  acetyltransferase, GNAT family  33.33 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2494  GCN5-related N-acetyltransferase  33.51 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2475  GCN5-related N-acetyltransferase  32.28 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1660  GCN5-related N-acetyltransferase  34.24 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4468  GCN5-related N-acetyltransferase  32.93 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282093  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2881  GCN5-related N-acetyltransferase  37.39 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2381  GCN5-related N-acetyltransferase  31.71 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>