63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3338 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3338  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4828  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.446033  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4177  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.203512  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2917  GCN5-related N-acetyltransferase  56.9 
 
 
158 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3266  GCN5-related N-acetyltransferase  50.4 
 
 
158 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5125  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
158 aa  99  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4113  GCN5-related N-acetyltransferase  46.81 
 
 
158 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0193  putative acetyltransferase  39.75 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7075  GCN5-related N-acetyltransferase  39.29 
 
 
153 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0194  GCN5-related N-acetyltransferase  39.84 
 
 
153 aa  73.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1796  putative histone acetyltransferase (HAT)  43.36 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2044  GCN5-related N-acetyltransferase  38.79 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.624808  normal  0.277662 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3851  GCN5-related N-acetyltransferase  39.2 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.619468  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2497  GCN5-related N-acetyltransferase  34.27 
 
 
147 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12144  normal  0.087022 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4438  GCN5-related N-acetyltransferase  42.61 
 
 
153 aa  61.2  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3849  GCN5-related N-acetyltransferase  45.45 
 
 
414 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156281  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5785  GCN5-related N-acetyltransferase  45.45 
 
 
400 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316473  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4519  GCN5-related N-acetyltransferase  45.45 
 
 
414 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20129  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0137  GCN5-related N-acetyltransferase  36.72 
 
 
147 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1329  GCN5-related N-acetyltransferase  45.45 
 
 
414 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4135  GCN5-related N-acetyltransferase  47.3 
 
 
399 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0441895  normal  0.143629 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4414  GCN5-related N-acetyltransferase  44.16 
 
 
413 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0279389  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3951  GCN5-related N-acetyltransferase  44.16 
 
 
413 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4515  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
155 aa  57.8  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4647  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
155 aa  57.8  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20803  normal  0.0229692 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2964  GCN5-related N-acetyltransferase  44 
 
 
147 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2785  GCN5-related N-acetyltransferase  41.33 
 
 
147 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5506  acetyltransferase, GNAT family  50 
 
 
148 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3664  GCN5-related N-acetyltransferase  29.66 
 
 
151 aa  54.3  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.671996  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71690  GNAT family acetyltransferase  35.59 
 
 
149 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5058  GCN5-related N-acetyltransferase  35.59 
 
 
148 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153522  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3262  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
148 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5253  GCN5-related N-acetyltransferase  48.08 
 
 
148 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6220  putative acetyltransferase  35.29 
 
 
149 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0836  GCN5-related N-acetyltransferase  33.59 
 
 
158 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5344  acetyltransferase  48.08 
 
 
148 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00407792 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5393  GCN5-related N-acetyltransferase  46.15 
 
 
148 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.650664  hitchhiker  0.00916992 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5176  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  33.82 
 
 
335 aa  52.8  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.472651 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1141  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
149 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.884922 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0132  GCN5-related N-acetyltransferase  51.92 
 
 
146 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2696  GCN5-related N-acetyltransferase  44.3 
 
 
148 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.771243  normal  0.881591 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5119  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 
148 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000288207  normal  0.236457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5635  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
148 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0013842  normal  0.201231 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0310  GCN5-related N-acetyltransferase  34.03 
 
 
154 aa  50.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132707  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3514  GCN5-related N-acetyltransferase  25.44 
 
 
152 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3956  GCN5-related N-acetyltransferase  33.04 
 
 
402 aa  48.1  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0442969 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0028  GCN5-related N-acetyltransferase  36.11 
 
 
147 aa  48.1  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.578829 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2598  GCN5-related N-acetyltransferase  32.71 
 
 
154 aa  47.8  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0549  GCN5-related N-acetyltransferase  54.76 
 
 
146 aa  46.6  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1882  putative acetyltransferase  47.37 
 
 
152 aa  46.6  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0785639  normal  0.209526 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1954  GCN5-related N-acetyltransferase  44.23 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0219812  normal  0.336797 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6394  GCN5-related N-acetyltransferase  34.25 
 
 
148 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.423137  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1190  GCN5-related N-acetyltransferase  53.33 
 
 
150 aa  45.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.806576 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1109  GCN5-related N-acetyltransferase  26.96 
 
 
152 aa  45.8  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3002  GCN5-related N-acetyltransferase  32.17 
 
 
152 aa  45.4  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.533457  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2165  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
148 aa  45.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0161004  normal  0.0731596 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2652  putative acetyltransferase  43.1 
 
 
150 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1310  GCN5-related N-acetyltransferase  43.1 
 
 
150 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.939241  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3469  GCN5-related N-acetyltransferase  35.2 
 
 
158 aa  43.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.293029  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0274  GCN5-related N-acetyltransferase  36.54 
 
 
149 aa  42.4  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6192  GCN5-related N-acetyltransferase  53.85 
 
 
144 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1024  GCN5-related N-acetyltransferase  30.17 
 
 
152 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.643013  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1012  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 
152 aa  40.8  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>